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2019 Fiscal Year Annual Research Report

酵素機能改変による新規活性アルカロイド生産系の構築

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04641
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

淡川 孝義  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (80609834)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords微生物アルカロイド / 生合成酵素 / 非天然型化合物
Outline of Annual Research Achievements

医薬品シード化合物取得のために酵素を用いた物質生産の手法は興味深い。本計画では、生合成酵素の基質特異性、反応性をハイスループットに改変し、物質生産へと繋げる酵素改変に取り組み、非天然型の基質を受け入れる変異酵素のスクリーニングを行い、「改変酵素を用いた高収量費天然型化合物生産系構築の方法論の確立」を試みる。本年度では、放線菌より単離されるPKC(protein kinase C)の強い活性化作用を持つインドールテルペノイド、テレオシジン生合成酵素の、P450酸化酵素TleBに注目し、その結晶構造解析を行った。また、その構造の異なる基質を作用させることで、C-N結合形成だけでなく、3環性インドール構造、脱メチル化構造など、様々な骨格の化合物を創出することに成功した。また、以前見出した、スルホンアミド抗生物質アルテミシジンのテトラヒドロインダン骨格形成反応に注目し、SbzN (sugar isomerase-like enzyme)遺伝子破壊株において、2位の窒素原子に糖が結合した、非天然型スルホンアミド化合物であることを同定した。また、同様に、SbzE (methyltransferase)の遺伝子破壊株において、脱メチル基化合物を単離し、非天然型化合物と構造決定した。SbzNは既知のC-N結合開裂酵素と相同性を持たず、新規な生合成機構の存在が示唆される。化合物のトリヒドロインダンの左右のC4単位はアスパラギン酸に、中央のC3単位はグリセロールに由来することを安定同位体ラベル化合物取り込み実験により確かめており、その情報をもとに現在、基質を合成し、それぞれの反応をin vitroにて試験している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

テレオシジン生合成酵素に関しては、P450酸化酵素の結晶構造解析に成功し、その複合体解析によって反応機構の推定、非天然型反応の創出を行った。それぞれ構造の異なる基質を作用させることで、5-6-5インドール構造など、様々な骨格の化合物を創出することに成功した。また、スルホンアミド抗生物質アルテミシジンの遺伝子破壊株において、種々の非天然型化合物を単離し、天然に存在しないアルカロイド化合物の創出に成功した。現在、酵素の構造解析、改変によって、さらなる非天然型化合物の創出を試みている。

Strategy for Future Research Activity

前年度は、特に酸化酵素TleBに注目し、その結晶構造解析を行ったが、その構造情報をもとにして、in vivoでのTleABCDの反応の改変を行い、サブタイプ特異的なPKC(protein kinase C)活性化化合物を取得する。ゲノムデータベースから見出したテレオシジンホモログクラスターNRPS HinBをTleAと比較し、遺伝子比較、融合による新規機能型NRPSの創出、トリプトファン基質アナログを用いた非天然型化合物の創出に取り組む。また、スルホンアミド抗生物質アルテミシジンの骨格形成反応の構造機能解析に取り組み、その反応の利用、代謝経路の改変によって、非天然型抗生物質の創出を試みる。

  • Research Products

    (20 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ピッツバーグ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ピッツバーグ大学
  • [Int'l Joint Research] Jinan大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Jinan大学
  • [Journal Article] Molecular basis for the P450-catalyzed C-N bond formation in indolactam biosynthesis2019

    • Author(s)
      He Fei、Mori Takahiro、Morita Iori、Nakamura Hitomi、Alblova Miroslava、Hoshino Shotaro、Awakawa Takayoshi、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 15 Pages: 1206~1213

    • DOI

      10.1038/s41589-019-0380-9

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural Elucidation of Tenebrathin: Cytotoxic C-5-Substituted γ-Pyrone with a Nitroaryl Side Chain from Streptoalloteichus tenebrarius2019

    • Author(s)
      Hoshino Shotaro、Mitsuhashi Takaaki、Kikuchi Takashi、Wong Chin Piow、Morita Hiroyuki、Awakawa Takayoshi、Fujita Makoto、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 21 Pages: 6519~6522

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.9b02443

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Complete biosynthetic pathways of ascofuranone and ascochlorin in Acremonium egyptiacum2019

    • Author(s)
      Araki Yasuko、Awakawa Takayoshi、Matsuzaki Motomichi、Cho Rihe、Matsuda Yudai、Hoshino Shotaro、Shinohara Yasutomo、Yamamoto Masaichi、Kido Yasutoshi、Inaoka Daniel Ken、Nagamune Kisaburo、Ito Kotaro、Abe Ikuro、Kita Kiyoshi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 8269~8274

    • DOI

      10.1073/pnas.1819254116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Beijinchromes A-D, Novel Aromatic Compounds Isolated from Nocardia beijingensis NBRC 163422019

    • Author(s)
      Hoshino Shotaro、Awakawa Takayoshi、Zhang Huiping、Hayashi Fumiaki、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 67 Pages: 775~777

    • DOI

      10.1248/cpb.c19-00364

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular basis for the plasticity of aromatic prenyltransferases in hapalindole biosynthesis2019

    • Author(s)
      Awakawa Takayoshi、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Beilstein Journal of Organic Chemistry

      Volume: 15 Pages: 1545~1551

    • DOI

      10.3762/bjoc.15.157

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploitation and application of unique actinomycetical alkaloid biosynthetic enzymes2019

    • Author(s)
      Awakawa Takayoshi
    • Journal Title

      Actinomycetologica

      Volume: 33 Pages: S3-S8

  • [Presentation] Biosynthetic study of sulfonamide natural product antibiotics2020

    • Author(s)
      Takayoshi Awakawa, Zhijuan Hu, Haibing He, Takahiro Mori, Ikuro Abe
    • Organizer
      3rd International Conference on Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 微生物からの医薬品骨格生合成酵素の発掘と利用2020

    • Author(s)
      淡川 孝義
    • Organizer
      日本薬学会第140年会
    • Invited
  • [Presentation] 非リボソーマルペプチド-ポリケタイド合成酵素モジュール相互作用の精密解析2020

    • Author(s)
      文野 伶音、森 貴裕、淡川 孝義、阿部 郁朗
    • Organizer
      日本薬学会第140年会
  • [Presentation] Penicillium arizonense由来メロテルペノイドAustalideの生合成研究2020

    • Author(s)
      劉 薇、白 桐暄、淡川 孝義、阿部 郁朗
    • Organizer
      日本薬学会第140年会
  • [Presentation] Function and structure analysis of a multifunctional cupin dioxygenase in sulfonamide biosynthesis2019

    • Author(s)
      Takayoshi Awakawa, Zhijuan Hu, Haibing He, Takahiro Mori, Ikuro Abe
    • Organizer
      Gordon Conference Enzyme
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放線菌アルカロイド生合成酵素の発掘および物質生産2019

    • Author(s)
      淡川 孝義
    • Organizer
      第34回放線菌学会
    • Invited
  • [Presentation] 微生物医薬品骨格生合成酵素の発掘とその利用2019

    • Author(s)
      淡川 孝義
    • Organizer
      日本薬学会関東支部会
    • Invited
  • [Presentation] スルホンアミド抗生物質の生合成研究2019

    • Author(s)
      淡川 孝義、胡 志娟、何 海兵、森 貴裕、阿部 郁朗
    • Organizer
      第八回食品薬学シンポジウム
  • [Presentation] アスコフラノン生合成の天然物化学 糸状菌メロテルペノイドの生合成反応の多様性2019

    • Author(s)
      淡川 孝義
    • Organizer
      KISTECセミナー(神奈川)
    • Invited
  • [Book] Comprehensive Natural Products III: Chemistry and Biology2020

    • Author(s)
      Awakawa Takayoshi、Liu Xinyu
    • Total Pages
      20
    • Publisher
      Elsevier
  • [Book] バイオサイエンスとインダストリー2019

    • Author(s)
      荒木康子、淡川孝義、松崎素道、阿部郁朗
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      バイオインダストリー協会
  • [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室ホームページ

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm

URL: 

Published: 2021-01-27  

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