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2019 Fiscal Year Annual Research Report

特異な化学構造をもつ海洋産リポペプチドの生合成機構解明に基づく人工誘導体生産

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04662
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

末永 聖武  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 教授 (60273215)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2021-03-31
KeywordsミンナミドA / リポペプチド / 繰り返し構造 / 生合成遺伝子 / 化学合成
Outline of Annual Research Achievements

ミンナミドAを産生する海洋シアノバクテリアOkeania hirsutaの実験室における培養やゲノム抽出を検討するために必要なシアノバクテリアを採集するべく、本年度も沖縄県水納島へ出かけ採集を試みたが、目的のシアノバクテリアを見つけることができなかった。そこで、さらに範囲を広げて各所で試料採集を行なった結果、目的のOkeania hirsutaのサンプルを入手することができた。ミンナミドAを産生していることも確認できたため、そのゲノムDNAを抽出した。通常の方法では鞘の除去や大量に含まれる多糖類の除去が難しく、純度の良いゲノムDNAを得ることに苦労している。検討の結果、遠心分離操作や界面活性剤による処理を複数回行うことで、ゲノムDNAの純度を上げることができた。さらに精製条件を検討し、純度の良いゲノムDNAが得られ次第、次世代シークエンサーによる配列解析を実施する。
また、上記の新たに採集できたOkeania hirsutaの抽出物を分離・精製したところ、ミンナミドAの新たな類縁物質を複数単離することができた。現在、立体化学の決定を行なっている。
さらに、ミンナミドAの化学合成研究を進めている。共役ケトンの立体選択的1,2還元により生成するアリル位水酸基を利用して、3置換オレフィンのカチオン性錯体触媒を用いる立体選択的水素化により、ミンナミドAの脂肪酸部に含まれる特徴的な繰り返しを構築する手法を確立した。現在、この手法により脂肪酸部の合成を進めている。ペプチド部の異常アミノ酸の合成法を確立し、縮合を進めており、フラグメントカップリングにより収束的に合成する経路を検討している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

ミンナミドAを産生する海洋シアノバクテリアOkeania hirsutaの入手に時間がかかったため、研究がやや遅れている。

Strategy for Future Research Activity

ゲノムDNAの精製方法は、ほぼ確立した。基本的にはその手法にしたがって、さらに改良を加えつつ精製を進め、純度の良いゲノムDNAが得られ次第、次世代シークエンサーによる配列解析を実施する。ミンナミドAを産生する海洋シアノバクテリアOkeania hirsutaを新たに採集することは当分の間、困難と予想されるため、採集場所に行くことが可能な地元の研究者へ協力いただくことも検討したい。4月7日からキャンパスが閉鎖されたため、キャンパス内での研究活動再開までは、文献調査などを進める。

  • Research Products

    (7 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Ikoamide, an Antimalarial Lipopeptide from an Okeania sp. Marine Cyanobacterium2020

    • Author(s)
      Iwasaki Keitaro、Iwasaki Arihiro、Sumimoto Shimpei、Matsubara Teruhiko、Sato Toshinori、Nozaki Tomoyoshi、Saito-Nakano Yumiko、Suenaga Kiyotake
    • Journal Title

      Journal of Natural Products

      Volume: 83 Pages: 481~488

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acs.jnatprod.9b01147

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来の生物活性物質2020

    • Author(s)
      末永聖武、岩﨑有紘、森田真布、佐藤英祐、照屋俊明、大野修
    • Organizer
      農芸化学会2020年度大会、九州大学伊都キャンパス、シンポジウム「農芸化学会シアノバクテリアと未来を描く」
    • Invited
  • [Presentation] 海洋産リポペプチドMinnamide A脂肪酸部分の合成研究12020

    • Author(s)
      岸本勇志・小林正幸・佐藤理央・岩﨑有紘・末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会(東京理科大学野田キャンパス)
  • [Presentation] 海洋産リポペプチドMinnamide A脂肪酸部分の合成研究22020

    • Author(s)
      小林正幸・佐藤理央・岸本勇志・岩﨑有紘・末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会(東京理科大学野田キャンパス)
  • [Presentation] 海洋産リポペプチドMinnamide Aペプチド部分の合成研究2020

    • Author(s)
      佐藤理央・小林正幸・岸本勇志・岩﨑有紘・末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会(東京理科大学野田キャンパス)
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来鎖状リポペプチドMinnamide Aの単離、構造決定および生物活性2019

    • Author(s)
      澄本慎平、小林正幸、佐藤理央、四宮誠一、岩﨑有紘、須田彰一郎、照屋俊明、犬塚俊康、大野修、末永聖武
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第14回年会(ウインクあいち)
  • [Remarks] 研究室web

    • URL

      http://user.keio.ac.jp/~suenaga/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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