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2020 Fiscal Year Annual Research Report

大環状ペプチド人工生合成系を基盤とした生理活性中分子ライブラリーの構築

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 19H04664
Research InstitutionKindai University

Principal Investigator

石川 文洋  近畿大学, 薬学部, 講師 (50631553)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords非リボソームペプチド合成酵素 / アデニル化酵素 / 生合成 / 分子プローブ / 非天然型ペプチド
Outline of Annual Research Achievements

ペプチド系天然物の多くは, 非リボソームペプチド合成酵素 (NRPS) により生合成される. NRPS によるペプチド合成には, 20種類のタンパク質性アミノ酸以外に, 非タンパク質性アミノ酸も使える利点があり, 創薬への期待が高い. しかしながらNRPSは, アミノ酸を選別するアデニル化酵素の基質特異性の高さから, 様々な種類のペプチドを含む化合物ライブラリーの構築には適していないとされている. 一因として, 実験事実に基づいたアデニル化酵素の酵素化学的性質 (基質認識の厳密性と寛容性) の理解が乏しいことが挙げられる. また, NRPSは複数の酵素ドメインが繋がった超巨大タンパク質 (Mw: 300-1600 kDa) として存在している. このようなタンパク質を活性型として発現・精製することは, 簡単なことではない. いかなるタンパク質であっても, 本来の機能をもって自在に発現できる遺伝子発現系を構築することが理想であるが, 実現するのはまだまだ難しい. そこで, これら問題を一挙に解決できる基盤技術を開発した. 本技術はアデニル化酵素選択的ラベル化剤を活用し, 内在的に発現するすべてのNRPS アデニル化酵素の基質特異性に関する情報を速やかに読み出す技術である (Activity-based protein profiling of NRPSs, ABPP-NRPSs). 本年度は, グラミジンS生合成系をモデルに, ABPP-NRPSs を物質生産と連結することで, 既知化合物1個, 新規化合物4つの創製に成功した. また, 1つの非タンパク質性アミノ酸のグラミシジンS骨格への導入に成功した. さらに, 有機合成化学を組み合わせることで, グラミシジンS骨格中の非タンパク質性アミノ酸を修飾することに成功した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (16 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Elongation of the side chain by linear alkyl groups increases the potency of salacinol, a potent α-glucosidase inhibitor from the Ayurvedic traditional medicine “Salacia,” against human intestional maltase2021

    • Author(s)
      Katsuki Takashima, Mika Sakano, Eri Kinouchi, Shinya Nakamura, Shinsuke Marumoto, Fumihiro Ishikawa, Kiyofumi Ninomiya, Isao Nakanishi, Toshio Morikawa,* Genzoh Tanabe*
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 33 Pages: 127751

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ligand compatibility of salacinol-type α-glucosidase inhibitors toward family GH312021

    • Author(s)
      Fumihiro Ishikawa, Aiko Hirano, Yuuto Yoshimori, Kana Nishida, Shinya Nakamura, Katsuki Takashima, Shinsuke Marumoto, Kiyofumi Ninomiya, Isao Nakanishi, Weijia Xie, Toshio Morikawa, Osamu Muraoka, Genzoh Tanabe*
    • Journal Title

      RSC Adv.

      Volume: 11 Pages: 3221-3225

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutational biosynthesis of hitachimycin analogs controlled by the β-amino acid-;selective adenylation enzyme HitB2021

    • Author(s)
      Fumitaka Kudo,* Sotaro Takahashi, Akimasa Miyanaga, Yuichiro Nakazawa, Kota Nishino, Yuki Hayakawa, Koichi Kawamura, Fumihiro Ishikawa, Genzoh Tanabe, Naeko Iwai, Takeo Usui, Tadashi Eguchi*
    • Journal Title

      ACS Chem. Biol.

      Volume: 16 Pages: 539-547

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activity, binding, and modeling studies of a reprogrammed aryl acid adenylation domain with an enlarged substrate binding site2021

    • Author(s)
      Fumihiro Ishikawa,* Hinano Kitayama, Shinya Nakamura, Katsuki Takashima, Isao Nakanishi, Genzoh Tanabe*
    • Journal Title

      Chem. Pharm. Bull.

      Volume: 69 Pages: 222-225

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discovery of new benzhydrol biscarbonate esters as potent and selective apoptosis inducers of human melanoma cells: SAR studies on an ERK MAPK signaling modulator, ACA-282020

    • Author(s)
      Ryosuke Sato, Naoya Hamada, Ami Yamada, Fumihiro Ishikawa, Teruaki Takasaki, Genzoh Tanabe,* Reiko Sugiura*
    • Journal Title

      Bioorg. Chem.

      Volume: 103 Pages: 104137

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Probing the compatibility of an enzyme-linked immunosorbent assay toward the reprogramming of nonribosomal peptide synthetase adenylation domains2020

    • Author(s)
      Fumihiro Ishikawa,* Maya Nohara, Katsuki Takashima, Genzoh Tanabe*
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 21 Pages: 3056-3061

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 拡張型基質結合部位をもつアデニル化酵素の二置換安息香酸誘導体への基質許容性2021

    • Author(s)
      野原 麻耶, 石川 文洋, 高島 克輝, 田邉 元三
    • Organizer
      日本薬学会第 141 年会
  • [Presentation] 安息香酸誘導体選択的アデニル化酵素の基質特異性を制御するNRPSコードの生化学的解析2021

    • Author(s)
      石川 文洋, 野原 麻耶, 中村 真也, 高島 克輝, 仲西 功, 田邉 元三
    • Organizer
      日本薬学会第 141 年会
  • [Presentation] タイ天然物 “Melodorum” 由来ブテノリド類の網羅的合成およびメラニン産生抑制作用の検討2021

    • Author(s)
      田邉 元三, 塩谷 友梨, 高島 克輝, 森川 敏生, 二宮 清文, 石川 文洋
    • Organizer
      日本薬学会第 141 年会
  • [Presentation] スルフィドのジアステレオ選択的分子内環化反応を利用したアーユルベーダ天然薬物“サラシア”由来α-グルコシダーゼ阻害剤 neokotalanolの全合成2021

    • Author(s)
      高島 克輝, 小林 祐喜, 石川 文洋, 丸本 真輔, 田邉 元三
    • Organizer
      日本薬学会第141年会
  • [Presentation] 矛を磨いた10年 於 大阪府大→UCSD→京都大→近畿大2020

    • Author(s)
      石川 文洋
    • Organizer
      第6回関西薬学シンポジウム: 化学系の若い力
    • Invited
  • [Presentation] 人工アデニル化酵素の設計、機能、構造解析2020

    • Author(s)
      石川 文洋, 野原 摩耶, 高島 克輝, 田邉 元三
    • Organizer
      第70回日本薬学会関西支部大会
  • [Presentation] アーユルベーダ天然薬物“サラシア”由来α-グルコシダーゼ阻害剤 neokotalanolの簡便かつ効率的な合成2020

    • Author(s)
      高島克輝, 石川文洋, 丸本 真輔, 田邉元三
    • Organizer
      第70回日本薬学会関西支部大会
  • [Presentation] スルフィドのジアステレオ選択的分子内環化反応を利用したアーユルベーダ天然薬物“サラシア”由来α-グルコシダーゼ阻害剤neokotalanolの全合成2020

    • Author(s)
      高島 克輝, 小林 祐喜, 石川 文洋, 丸本 真輔, 田邉 元三
    • Organizer
      第62回天然有機化合物討論
  • [Presentation] An engineered aryl acid adenylating enzyme with an enlarged substrate binding pocket2020

    • Author(s)
      Fumihiro Ishikawa
    • Organizer
      2nd German-Japanese Symposiumu on Natural Product Biosynthesis
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 近畿大学薬学部有機薬化学研究室

    • URL

      https://www.phar.kindai.ac.jp/orgchem/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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