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2019 Fiscal Year Annual Research Report

ナビ行動を生み出す神経情報処理の自由行動4Dイメージングによる解析

Publicly Offered Research

Project AreaSystems Science of Bio-navigation
Project/Area Number 19H04928
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

豊島 有  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (10632341)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords機能的全脳イメージング / 行動計測 / 神経細胞の同定 / 数理モデル化 / 線虫
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ナビゲーション行動中の線虫の全神経活動の観察に加えて、機械学習等による特徴抽出や時系列予測技術などを活用して、神経活動や行動を解釈する枠組みを構築することを目指す。

2019年度は、ナビゲーション行動中の線虫の全神経活動の観察を実現するため、高速4Dイメージング顕微鏡の試作機について改良を進めた。試作機を用いた撮影の結果、線虫の行動に伴って光シートの照射方向と線虫の角度の関係が変わると励起光のムラが生じることが判明していた。この問題を解決するため、光シートの照射角度を変更できる回転光学系を導入したが、撮影した画像の輝度の低下や輝度ムラの増大など新たな問題が生じた。既存のスピニングディスク型共焦点顕微鏡に自動追尾ステージを組み合わせることで、これらの問題を回避しつつ、行動中の線虫の全神経活動が観察できる可能性があるか、検討をすすめた。
また線虫の神経活動を神経回路レベルで解析するために、線虫の神経細胞を同定する技術の開発を進めた。これまでに、細胞の位置情報のデータベースを構築し、細胞の同定に適した線虫株を作出して、細胞同定の過程を自動化し、GUIに組み込んで公開した。これらの成果をまとめて論文として発表した(Toyoshima et al., 2020, BMC biology)。
また線虫のナビゲーション行動の詳細な解析を行った。線虫は後退運動とそれに引き続く方向転換を行うことで塩走性行動を実現していることが知られている。ASG感覚神経は塩を直接関知しないが、こうした後退運動の後に活性化し、走性行動に影響していることが明らかになかった。またこの方向転換の角度はこれまでランダムだと考えられてきたが、詳細な解析の結果、実際には一定のルールがあることが明らかになった。これらの成果をまとめて論文として発表した(Jang et al, 2019, PNAS)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

自由行動中の線虫の神経活動を包括的に観測するために必要な顕微鏡の開発が遅延したため。

Strategy for Future Research Activity

既存のスピニングディスク型共焦点顕微鏡に自動追尾ステージを組み合わせることで、行動中の線虫の全神経活動が観察できるよう、検討・改良をすすめる。

  • Research Products

    (9 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans2020

    • Author(s)
      Toyoshima Yu、Wu Stephen、Kanamori Manami、Sato Hirofumi、Jang Moon Sun、Oe Suzu、Murakami Yuko、Teramoto Takayuki、Park Chanhyun、Iwasaki Yuishi、Ishihara Takeshi、Yoshida Ryo、Iino Yuichi
    • Journal Title

      BMC Biology

      Volume: 18 Pages: 30

    • DOI

      10.1186/s12915-020-0745-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Multiple sensory neurons mediate starvation-dependent aversive navigation inCaenorhabditis elegans2019

    • Author(s)
      Jang Moon Sun、Toyoshima Yu、Tomioka Masahiro、Kunitomo Hirofumi、Iino Yuichi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 18673~18683

    • DOI

      10.1073/pnas.1821716116

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] (Bio-image informatics for whole-brain activity imaging of C. elegans)2019

    • Author(s)
      Yu Toyoshima
    • Organizer
      22nd International Worm Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 線虫全脳の機能的イメージングと動態解析2019

    • Author(s)
      豊島 有, Wu Stephen, 金森 真奈美, 佐藤 博文, Jang Moon Sun, 村上 悠子, 大江 紗, 徳永 旭将, 広瀬 修, 久下 小百合, 寺本 孝行, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 石原 健, 飯野 雄一
    • Organizer
      第44回レーザー顕微鏡研究会
    • Invited
  • [Presentation] Exploring the origin of brain and central nervous system through monitoring the neural activity of the whole animal2019

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Manami Kanamori, Stephen Wu, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Sayuri Kuge, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino
    • Organizer
      第42回日本神経科学大会
  • [Presentation] Bio-image informatics for whole brain activity imaging and analysis of neural activity of C. elegans2019

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Yuko Murakami, Suzu Oe, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Sayuri Kuge, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 線虫全脳の機能的イメージングと動態解析2019

    • Author(s)
      豊島 有
    • Organizer
      第9回光科学異分野横断萌芽研究会
    • Invited
  • [Presentation] Bio-image informatics for whole brain imaging and analysis of neural activity of C. elegans2019

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Yuko Murakami, Suzu Oe, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Sayuri Kuge, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino
    • Organizer
      Resonance Bio International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A pipeline of bio-image informatics for whole-brain imaging of C. elegans and analysis of the neural activity2019

    • Author(s)
      Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Yuko Murakami, Suzu Oe, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Sayuri Kuge, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino
    • Organizer
      The 20th International Conference of Systems Biology
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-12-27  

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