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2019 Fiscal Year Annual Research Report

ヘリオロドプシンは何を伝えているのか?

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative understanding of biological signaling networks based on mathematical science
Project/Area Number 19H04959
Research InstitutionNagoya Institute of Technology

Principal Investigator

神取 秀樹  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70202033)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords微生物ロドプシン / レチナール / 光反応サイクル / X線結晶構造解析 / プルダウンア
Outline of Annual Research Achievements

これまで地球上のロドプシンには、微生物に由来するタイプ1と動物に由来するタイプ2しか存在しないと考えられていた。ところが我々は2018年、全く新しいロドプシンを発見し、第三のロドプシンであるこのタンパク質群にヘリオロドプシンと名付けた。ヘリオロドプシンはイオンを輸送しないため、我々は光センサー機能を推測しているが実験的な証拠はない。ヘリオロドプシンが古細菌、真正細菌、藻類などの真核生物から巨大ウイルスにまで存在する事実は、普遍な光利用機構の存在を示唆している。果たしてそれがタンパク質間相互作用によるシグナル伝達なのか、あるいは全く別の機構が存在するのか、実験的に明らかにすることを目標とした。2019年度は特に構造情報を得ることを目的として研究を行った結果、以下の成果が得られた。
古細菌由来のヘリオロドプシンについて東大との共同研究により結晶構造解析に成功した。我々は反転している膜トポロジーの解析や、ヘリオロドプシンがスクランブレース活性を持たないことなどとともに、低温赤外分光法を用いた水分子の水素結合構造の解析、時間分解赤外分光法を用いたO中間体の構造解析、全反射赤外分光法を用いたイオン結合の解析を行った。ヘリオロドプシンは一価の陽イオン・陰イオンを結合しないことが明らかになり、水素結合の強い水分子が存在することがわかった。以上の成果をすべてまとめてNature誌に論文発表した。
ヘリオロドプシンの相互作用解析においては培養可能な生物がほとんどないことが大きな問題であったが、ある種の放線菌がヘリオロドプシン遺伝子を持ち、培養可能であることを見出し、機能解析を開始することができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

ヘリオロドプシンの論文を2年続けてNature誌に発表したことは顕著な実績であり、国内外から注目された。

Strategy for Future Research Activity

研究は順調に進んでおり、当初の予定通りの研究を推進する。

  • Research Products

    (105 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (18 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Peer Reviewed: 18 results,  Open Access: 1 results) Presentation (78 results) (of which Int'l Joint Research: 32 results,  Invited: 12 results) Book (8 results)

  • [Int'l Joint Research] Israel Inst. Tech.(イスラエル)

    • Country Name
      ISRAEL
    • Counterpart Institution
      Israel Inst. Tech.
  • [Journal Article] Infrared spectroscopic analysis on structural changes around the protonated Schiff base upon retinal isomerization in light-driven sodium pump KR2.2020

    • Author(s)
      S. Tomida, S. Ito, T. Mato, Y. Furutani, K. Inoue, H. Kandori
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta Bioenerg.

      Volume: - Pages: 148190

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148190.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure-affinity insights into the Na+ and Ca2+ interactions with multiple sites of a sodium-calcium exchanger.2020

    • Author(s)
      M. Iwaki, B. Refaeli, L. van Dijk, R. Hiller, M. Giladi, H. Kandori, D. Khananshvili
    • Journal Title

      FEBS J.

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/febs.15250.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Allosteric Communication with the Retinal Chromophore upon Ion Binding in a Light-Driven Sodium Ion-Pumping Rhodopsin.2020

    • Author(s)
      A. Otomo, M. Mizuno, K. Inoue, H. Kandori, Y. Mizutani
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 59 (4) Pages: 520-529

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.9b01062.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acid-Base Equilibrium of the Chromophore Counterion Results in Distinct Photoisomerization Reactivity in the Primary Event of Proteorhodopsin2019

    • Author(s)
      C. Chang, H. Kuramochi, M. Singh, R. Abe-Yoshizumi, T. Tsukuda, H. Kandori, T. Tahei*
    • Journal Title

      Phys Chem Chem Phys.

      Volume: 21(46) Pages: 25728-25734

    • DOI

      10.1039/c9cp04991f.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ligand Binding-Induced Structural Changes in the M2 Muscarinic Acetylcholine Receptor Revealed by Vibrational Spectroscopy.2019

    • Author(s)
      K.Katayama, K. Suzuki, R. Suno, H. Tsujimoto, S. Iwata, T. Kobayashi, H. Kandori*
    • Journal Title

      J Phys Chem Lett.

      Volume: 10(22) Pages: 7270-7276

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.9b02942

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of a bound anion on the structure and dynamics of halorhodopsin from Natronomonas pharaonis2019

    • Author(s)
      M. Mizuno, Y. Shimoo, H. Kandori, Y. Mizutani*
    • Journal Title

      Struct. Dynamics

      Volume: 6(5) Pages: 54703

    • DOI

      10.1063./1.5125621

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Anion binding to mutants of the Schiff base counterion in heliorhodopsin 48C122019

    • Author(s)
      M. Singh, K. Katayama, O. Beja, H. Kandori*
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 21(42) Pages: 23663-23671

    • DOI

      10.1039/c9cp04102h

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Crystal structure of heliorhodopsin2019

    • Author(s)
      W. Shihoya, K. Inoue, M. Singh, M. Konno, S. Hososhima, K. Yamashita, K. Ikeda, A. Higuchi, T. Izume, S. Okazaki, M. Hashimoto, R. Mizutori, S. Tomida, Y. Yamauchi, R. Abe-Yoshizumi, K. Katayama, S. P. Tsunoda, M. Shibata, Y. Furutani, A. Pushkarev, O. Beja, T. Uchihashi, H. Kandori*, O. Nureki*
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 574 Pages: 132-136

    • DOI

      10.1038/s41586-019-1604-6

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ion channel properties of a cation channelrhodopsin, Gt_CCR42019

    • Author(s)
      S. Shigemura, S. Hososhima, H. Kandori, S. P. Tsunoda*
    • Journal Title

      Appl. Sci.

      Volume: 9 Pages: 3440

    • DOI

      10.3390/app9173440

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Unique photochemistry observed in a new microbial rhodopsin2019

    • Author(s)
      C. Kataoka, K. Inoue, K. Katayama, O. Beja, H. Kandori*
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. Lett.

      Volume: 10 Pages: 5117-5121

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.9b01957

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] X-ray crystallographic structure and oligomerization of Gloeobacter Rhodopsin2019

    • Author(s)
      T. Morizumi, W. L. Ou, N. Van Eps, K. Inoue, H. Kandori, L. S. Brown, O. P. Ernst*
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 9 Pages: 11283

    • DOI

      10.1038/s41598-019-47445-5.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Essential ion binding residues for Na+ flow in stator complex of the Vibrio flagellar motor2019

    • Author(s)
      Y. Onoue, M. Iwaki, A. Shinobu, Y. Nishihara, H. Iwatsuki, H. Terashima, A. Kitao, H. Kandori*, M. Homma*
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 9 Pages: 11216

    • DOI

      10.1038/s41598-019-46038-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FTIR study of S180A mutant of primate red-sensitive pigment2019

    • Author(s)
      K. Katayama, H. Imai, H. Kandori*
    • Journal Title

      Chem. Lett.

      Volume: 48 Pages: 1142-1144

    • DOI

      10.1246/cl.190458

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of Gln114 in spectral tuning of a long-wavelength sensitive visual pigment2019

    • Author(s)
      K. Katayama, S. Nakamura, T. Sasaki, H. Imai, H. Kandori*
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 58 Pages: 2944-2952

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.9b00340.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Engineered functional recovery of microbial rhodopsin without retinal-binding lysine2019

    • Author(s)
      Y. Yamauchi, M. Konno, D. Yamada, K. Yura, K. Inoue, O. Beja, H. Kandori*
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol.

      Volume: 95 (5) Pages: 1116-1121

    • DOI

      10.1111/php.13114

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Red-shiftingmutation of light-driven sodium-pump rhodopsin2019

    • Author(s)
      K. Inoue, M. Del Carmen Marin, S. Tomida, R. Nakamura, Y. Nakajima, M. Olivucci, H. Kandori*
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 10 Pages: 1993

    • DOI

      10.1038/s41467-019-10000-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Distortion and a strong hydrogen bond in the retinal chromophore enable sodium-ion transport by the sodium-ion pump KR22019

    • Author(s)
      N. Nishimura, M. Mizuno, H. Kandori, Y. Mizutani*
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 123 Pages: 3430-3440

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.9b00928.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Casting light on Asgardarchaeota metabolism in a sunlit microoxic niche2019

    • Author(s)
      P. A. Bulzu, A. S. Andrei, M. M. Salcher, M. Mehrshad, K. Inoue, H. Kandori, O. Beja, R. Ghai*, H. L. Banciu
    • Journal Title

      Nat. Microbiol.

      Volume: 4 Pages: 1129-1137

    • DOI

      10.1038/s41564-019-0404-y.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] FTIR study of visual and non-visual G protein-coupled receptors2020

    • Author(s)
      K. Katayama, K. Suzuki, R. Suno, H. Kandori
    • Organizer
      日本化学会 第100春季年会 (2020)
  • [Presentation] 海洋性藻類Guillardia thetaにおける微生物型ロドプシン様遺伝子の発現解析2020

    • Author(s)
      山内夢叶、今野雅恵、井上圭一、神取秀樹
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] チャネルとポンプ:いのちを支える2つのイオン輸送2020

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Organizer
      理化学研究所研究会
    • Invited
  • [Presentation] Rhodococcus属細菌由来へリオロドプシンの物性と生理機能の探索2020

    • Author(s)
      武藤亜衣、吉住玲、神取秀樹
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解明から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] 新奇ロドプシンフォスホジエステラーゼのオプトジェネティクスツールとしての可能性2020

    • Author(s)
      杉浦雅大, 吉田一帆, 日比正彦, 角田聡, 神取秀樹
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] 全反射赤外分光法によるムスカリン性アセチルコリン受容体のリガンド誘起構造変化解析2020

    • Author(s)
      魲洸平 , 片山耕大 , 寿野良二 ,神取秀樹
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] カチオンチャネルロドプシンTs_Rh3のユニークなカイネティクス解析2020

    • Author(s)
      田代凜太郎、Kumari Sushmita、Suneel Kateriya、神取秀樹、角田聡
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] アスパラギン酸マッピングによるタンパク質内部環境変化の赤外分光解析2020

    • Author(s)
      橋本真典、片山耕大、Manish Singh、古谷祐詞、神取秀樹
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] Stractural change of a primate blue-sensitive pigment by photochemical reaction2020

    • Author(s)
      華井竣平、佐々木拓磨、片山耕大、今井啓雄、神取秀樹
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] T(6-4)Cを用いた(6-4)光回復酵素の低温赤外測定2020

    • Author(s)
      前田克弥、熊谷真衣、山田大智、神取秀樹
    • Organizer
      第7回将来を見据えた生体分子の構造・機能解析から分子設計に関する研究会
  • [Presentation] Characterization of a novel sub-family of rhodopsin (Heliorhodopsin), spectral tuning and anion binding to counterion mutants in 48C122019

    • Author(s)
      M. Singh, A. Pushkarev, K. Inoue, W. Shihoya, O. Nureki, O. Beja, H. Kandori
    • Organizer
      ISAJ 2019 (Indian Scientist Association in Japan)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 新奇光依存性フォスホジエステラーゼRh-PDEの分子特性評価2019

    • Author(s)
      杉浦雅大、吉田一帆、日比正彦、角田聡、神取秀樹
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 電気生理学的解析による新規チャネルロドプシンTs_Rh3のイオン輸送メカニズム解明2019

    • Author(s)
      田代凜太郎, K. Sushmita, S. Kateriya, 神取秀樹, 角田聡
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 微生物ロドプシンが教えてくれること2019

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Organizer
      基礎生物学研究所研究会「異分野融合による次世代光生物学」
    • Invited
  • [Presentation] 能動輸送のパナマ運河モデルと光駆動ナトリウムポンプの特殊性2019

    • Author(s)
      神取秀樹、井上圭一、角田 聡
    • Organizer
      基礎生物学研究所研究会「異分野融合による次世代光生物学」
  • [Presentation] 低温赤外分光解析による(6-4)光回復酵素の光修復メカニズムの解明2019

    • Author(s)
      前田克弥、熊谷真衣、山田大智、神取秀樹
    • Organizer
      基礎生物学研究所研究会「異分野融合による次世代光生物学」
  • [Presentation] Rhodococcus 属細菌が有するヘリオロドプシンの物性および生理機能の探索2019

    • Author(s)
      武藤亜衣、吉住玲、神取秀樹
    • Organizer
      基礎生物学研究所研究会「異分野融合による次世代光生物学」
  • [Presentation] 全反射赤外分光法によるムスカリン性アセチルコリン受容体のリガンド認識・活性化機構解析2019

    • Author(s)
      魲洸平、片山耕大、寿野良二、神取秀樹
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
  • [Presentation] 電気生理学的解析による新規チャネルロドプシンTs_Rh3の分子特性解明2019

    • Author(s)
      田代凜太郎, K. Sushmita, S. Kateriya, 神取秀樹, 角田聡
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
  • [Presentation] アスパラギン酸をプローブとして用いた赤外分光測定によるタンパク質内部の構造解析2019

    • Author(s)
      橋本真典、片山耕大、M. Singh、古谷祐詞、神取秀樹
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
  • [Presentation] T(6-4)Cを用いた光修復中間体の低温赤外分光解析2019

    • Author(s)
      前田克弥、熊谷真衣、山田大智、寺井悠馬、山元淳平、神取秀樹
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
  • [Presentation] 天然のバクテリアを用いたヘリオロドプシンの機能研究2019

    • Author(s)
      武藤亜衣、吉住玲、神取秀樹
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
  • [Presentation] Role of Gln114 in spectral tuning of a long-wavelength sensitive visual pigment2019

    • Author(s)
      K. Katayama, S. Nakamura, T. Sasaki, H. Imai, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The cation-induced structural changes in the Na+-driven flagellar stator studied by ATR-FTIR2019

    • Author(s)
      M. Iwaki, T. Nishikino, H. Terashima, M. Homma, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Electrophysiological study and Optogenetics application of inward-directed proton-pumping rhodopsin, NsXeR2019

    • Author(s)
      S. Tsunoda, S. Hososhima, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular properties of Heliorhodopsin from Actinotalea fementans2019

    • Author(s)
      R. Abe-Yoshizumi, A. Muto, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel optogenetics tool: A light-gated cation channel with high-reactivity to weak light2019

    • Author(s)
      S. Hososhima, S. Shigemura, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Engineering microbial rhodopsin without retinal-binding lysine to gain photosensitive function2019

    • Author(s)
      Y. Yamauchi, M. Konno, D. Yamada, K. Yura, K. Inoue, O. Beja, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Time-resolved FTIR spectroscopy for studying molecular mechanisms of sodium and lithium ion transportation of Krokinobacter rhodopsin 22019

    • Author(s)
      S. Tomida, H. Kandori, Y. Furutani
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular properties of light-dependent homo-oligomerizing At CRY22019

    • Author(s)
      K. Agata, D. Yamada, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Different structural dynamics between cone pigments and rhodopsin revealed by FTIR spectroscopy2019

    • Author(s)
      T. Sasaki, K. Katayama, H. Imai, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Study of cation channelrhodopsin Gt_CCR4 from cryptophyte for optogenetics2019

    • Author(s)
      S. Shigemura, S. Hososhima, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effects of the L/Q switch on color tuning of heliorhodopsin2019

    • Author(s)
      Y. Nakajima, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular characterization of heliorhodopsin from marine giant virus light-dependently infecting to Emiliania huxleyi2019

    • Author(s)
      R. Mizutori, M. Konno, K. Inoue, O. Beja, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural features of enzyme rhodopsins revealed by infrared spectroscopy2019

    • Author(s)
      M. Watari, T. Tatsuya, H. Hutamata, D. Yamada, W. Shihoya, K. Yoshida, Y. Furutani, S. Tsunoda, O. Nureki, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Asymmetric pH effect on the enzyme rhodopsin, Rh-PDE2019

    • Author(s)
      M. Sugiura, K. Yoshida, M. Hibi, S, Tsunoda, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ligand recognition and activation mechanism in muscarinic acetylcholine receptor M2 (M2R) study by ATR-FTIR spectroscopy2019

    • Author(s)
      K. Suzuki, K. Katayama, R. Suno, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Electrophysiological analysis of a novel channelrhodopsin Ts_Rh32019

    • Author(s)
      R. Tashiro, K. Sushmita, S. Kateriya, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mapping of aspartic acids to probe protein structural changes by FTIR spectroscopy2019

    • Author(s)
      M. Hashimoto, K. Katayama, M. Singh, Y. Furutani, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ptotochemical reactions of a primate blue-sensitive pigment by spectroscopy2019

    • Author(s)
      S. Hanai, K. Katayama, T. Sasaki, H. Imai, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidation of the repair mechanism of <6-4> photolyase by infrared spectroscopy with T(6-4)C2019

    • Author(s)
      K. Maeda, M. Kumagai, D. Yamada, Y. Terai, J. Yamamoto, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Function study of heliorhodopsin using native bacteria2019

    • Author(s)
      A. Muto, R.Yoshizumi, H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of the inward proton transport pathway in Schizorhodopsin2019

    • Author(s)
      M. Konno, K. Inoue, R. Ghai、O. Beja、H. Kandori
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] オプトジェネティクスに求められるチャネルロドプシンの基礎特性2019

    • Author(s)
      重村竣太、細島頌子、神取秀樹、角田聡
    • Organizer
      第13回分子科学討論会
  • [Presentation] pH dependent activity change of the enzyme rhodopsin2019

    • Author(s)
      M. Sugiura, K. Yoshida, M. Hibi, S. Tsunoda, H. Kandori
    • Organizer
      第13回分子科学討論会2019
  • [Presentation] Novel Microbial Rhodopsins: Molecular Mechanisms and Optogenetic Application2019

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Organizer
      第11回光操作研究会
    • Invited
  • [Presentation] A High light-sensitive channelrhodopsin from cryptophyte2019

    • Author(s)
      S. Hososhima, S. Shigemura, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      第11回光操作研究会
  • [Presentation] Monovalent metal cation selectivity channelrhodopsin Gt_CCR42019

    • Author(s)
      S. Shigemura, S. Hososhima, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      第11回光操作研究会
  • [Presentation] Asymmetric pH effect of rhodopsin phosphodiesterase2019

    • Author(s)
      M. Sugiura, K. Yoshida, M. Hibi, S. Tsunoda, H. Kandori
    • Organizer
      第11回光操作研究会
  • [Presentation] Molecular mechanisms of a novel channelrhodopsin Ts_Rh32019

    • Author(s)
      R. Tashiro, K. Sushmita, S. Kateriya, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      第11回光操作研究会
  • [Presentation] ロドプシンを定義する2019

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Organizer
      ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」
    • Invited
  • [Presentation] 能動輸送のパナマ運河モデルと光駆動ナトリウムポンプの特殊性2019

    • Author(s)
      神取秀樹、井上圭一、角田 聡
    • Organizer
      ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」
  • [Presentation] Anion binding to mutants of the Schiff base counterion in heliorhodopsin 48C122019

    • Author(s)
      Manish Singh, 片山耕大, Oded Beja, 神取秀樹
    • Organizer
      ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」
  • [Presentation] レチナールを結合するリジンを保存しない微生物型ロドプシンの光機能獲得2019

    • Author(s)
      山内夢叶、今野雅恵、山田大智、由良敬、井上圭一、Oded Beja、神取秀樹
    • Organizer
      ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」
  • [Presentation] 霊長類色覚センサー蛋白質の光反応ダイナミクスの赤外分光解析2019

    • Author(s)
      佐々木拓磨、片山耕大、今井啓雄、神取秀樹
    • Organizer
      ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」
  • [Presentation] 4つのドメインからなるヘリオロドプシンがもつ光反応ダイナミクス比較2019

    • Author(s)
      水鳥律、今野雅恵、Manish Singh、井上圭一、Oded Beja、神取秀樹
    • Organizer
      ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」
  • [Presentation] Panama Canal Model for Active Transport and One Exception2019

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Organizer
      10th Toyota RIKEN International Workshop on "Science of Life Phenomena Woven by Water and Biomolecules"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] レチナールを結合するリジンを保存しない微生物型ロドプシンの機能解明2019

    • Author(s)
      山内夢叶、今野雅恵、山田大智、由良敬、井上圭一、O. Beja、神取秀樹
    • Organizer
      新学術領域「数理シグナル」第3回若手ワークショップ
  • [Presentation] Retinal Proteins in Microbes: Diversity and Mechanisms2019

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Organizer
      17th International Congress on Photobiology, Symposium SENS-1: "Retinal Proteins in Microbes: Diversity and Mechanisms"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Ultrafast Photoisomerization and Role of Protein Environment in Rhodopsins2019

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Organizer
      17th International Congress on Photobiology, Symposium PCHEM-10: "Femtobiology"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Structural study of thermo-stabilized mutation in cone visual opsin2019

    • Author(s)
      K. Katayama, H. Kandori
    • Organizer
      17th International Congress on Photobiology 18th Congress of the European Society for Photobiology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effect of pH and metal ion on the activity of enzyme rhodopsins2019

    • Author(s)
      M. Sugiura, K. Yoshida, S. P. Tsunoda, H. Kandori
    • Organizer
      17th International Congress on Photobiology 18th Congress of the European Society for Photobiology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Spectroscopic study of photochemical reactions of a primate blue-sensitive pigment2019

    • Author(s)
      S. Hanai, K. Katayama, T. Sasaki, H. Imai, H. Kandori
    • Organizer
      17th International Congress on Photobiology 18th Congress of the European Society for Photobiology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional improvement of enzyme rhodopsin for optogenetics applications2019

    • Author(s)
      M. Sugiura, K. Yoshida, M. Hibi, S. Tsunoda, H. Kandori
    • Organizer
      Scientific Seminar in Freie Universitat Berlin
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Spectroscopic study of photochemical reactions of a primate blue-sensitive pigment2019

    • Author(s)
      S. Hanai, K. Katayama, T. Sasaki, H, Imai, H. Kandori
    • Organizer
      Scientific Seminar in Freie Universitat Berlin
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 光感受性イオンチャネルのゲーティング機構と光遺伝学への応用2019

    • Author(s)
      細島頌子、神取秀樹、角田聡
    • Organizer
      第4回イオンチャネル研究会
  • [Presentation] Study of monovalent cation selectivite channelrhodopsin Gt_CCR4 for optogenetics2019

    • Author(s)
      S. Shigemura, S. Hososhima, H. Kandori, S. Tsunoda
    • Organizer
      The 42nd Annual Meeting of the Japan Neuroscience Society and The 62nd Annual Meeting of the Japanese Society for Neurochemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ロドプシンの作動メカニズム イオンの輸送を中心として2019

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Organizer
      第62回数理医学研究会
    • Invited
  • [Presentation] Light-induced Diffrence FTIR Spectroscopy of Rhodopsins2019

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Organizer
      10th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Vibrational spectroscopic approaches for understanding interactions of ligand with G protein-coupled receptors2019

    • Author(s)
      K. Katayama, R. Suno, K. Suzuki, S. Iwata, H. Kandori
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
  • [Presentation] 色覚センサーの光反応ダイナミクスの赤外分光解析2019

    • Author(s)
      佐々木拓磨、片山耕大、今井啓雄、神取秀樹
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
  • [Presentation] パワフルで一価金属カチオン選択性を持つチャネルロドプシンのオプトジェネティクスに向けたイオン透過解析2019

    • Author(s)
      重村竣太、細島頌子、神取秀樹、角田聡
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
  • [Presentation] 植物クリプトクロム2のホモオリゴマー時の構造状態の解析2019

    • Author(s)
      縣和哉、山田大智、神取秀樹
    • Organizer
      第46回生体分子科学討論会
  • [Presentation] 全反射赤外分光法によるムスカリン性アセチルコリン受容体M2の活性化機構解析2019

    • Author(s)
      魲洸平、片山耕大、寿野良二、神取秀樹
    • Organizer
      第46回生体分子科学討論会
  • [Presentation] 低温赤外分法によるHeliorhodopsinの初期中間体構造解析2019

    • Author(s)
      橋本真典、富田紗穂子、片山耕大、古谷祐詞、神取秀樹
    • Organizer
      第46回生体分子科学討論会
  • [Presentation] 分光計測による霊長類青感受性視物質の光反応中間体構造解析2019

    • Author(s)
      華井竣平、佐々木拓磨、片山耕大、今井啓雄、神取秀樹
    • Organizer
      第46回生体分子科学討論会
  • [Presentation] ヘリオロドプシンは何を伝えているのか?2019

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Organizer
      新学術領域「数理シグナル」領域推進会議
    • Invited
  • [Presentation] 発色団を結合するリジンを保存しない微生物型ロドプシンの光応答性機能獲得2019

    • Author(s)
      山内夢叶、今野雅恵、山田大智、由良敬、井上圭一、Oded Beja、神取秀樹
    • Organizer
      新学術領域「数理シグナル」領域推進会議
  • [Book] Biophysics of rhodopsins and optogenetics.2020

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      SPRINGER NATURE
  • [Book] Novel optogenetics tool: Gt_CCR4 A light-gated cation channel with high-reactivity to weak light2020

    • Author(s)
      S. Hososhima, S. Shigemura, H. Kandori, S. P. Tsunoda
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      SPRINGER NATURE
  • [Book] Retinal Proteins: Photochemistry and Optogenetics2020

    • Author(s)
      H. Kandori
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      The Chemical Society of Japan
  • [Book] オプトジェネティクスツールとしてのロドプシン2020

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Total Pages
      624
    • Publisher
      (株)NTS
    • ISBN
      978-4-86043-537-0 C3045
  • [Book] 視覚の初期過程を捉えるための超高速分光2020

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      一般社団法人 日本生物物理学会
  • [Book] 光を信号へと変換する第3のロドプシン: ヘリオロドプシンの発見2019

    • Author(s)
      井上圭一、神取秀樹
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      バイオインダストリー協会
  • [Book] "Light-induced difference FTIR spectroscopy of photoreceptive proteins" Vibrational Spectroscopy in Protein Research: From Purified Proteins to Aggregates and Assemblies (Y. Ozaki, M. Baranska, I. Lednev, B. R. Wood, eds)2019

    • Author(s)
      H. Kandori, K. Katayama
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      -
  • [Book] ロドプシンの作動メカニズム2019

    • Author(s)
      神取秀樹
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      公益社団法人日本生化学会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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