• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Understanding real neural network by comparison with atrificial neural nerwork

Publicly Offered Research

Project AreaCorrespondence and Fusion of Artificial Intelligence and Brain Science
Project/Area Number 19H04980
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

飯野 雄一  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (40192471)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords線虫C.elegans / 神経ネットワーク / カルシウムイメージング / ニューラルネットワークモデル / 神経活動 / 確率的モデル
Outline of Annual Research Achievements

本研究は動物の脳の実際の神経回路がどのようにネットワークとして動作しているのかを人工ニューラルネットワークと対比しそれを使いながら再現することを目的とした。
そのために、302個の神経細胞からなる全ネットワークが解明されている線虫C.エレガンスを用い、タンパク質コード型カルシウムレポーター(GECI)と4Dイメージングシステムを用いて撮影した頭部の全神経の神経活動を定量化したデータを用いた。個体により異なるが、平均150個程度の神経の活動時系列が得られている。
このデータをいくつかの方法で解析した。まず、独立成分分析により10個の独立成分の線形結合として神経活動を表現し、各神経の成分混合比から情報の流れを推定した。これにより、個体毎に異なる情報源から神経ネットワーク上を情報が流れている様子が伺えた。また、多変量の時系列を力学系とみなし、2つの神経が同じ力学系に属するか(相互作用しているか)をリカレント解析により検討した。これにより、神経間の相互作用が可視化されるとともに、時間経過により相互作用関係が変化する様子が観察できた。
次に、全結合のニューラルネットワークモデルにより全神経の過去の神経活動値から各神経の未来の活動値を推定する学習を行わせた。その結果、神経により異なるがよい推定を与える神経活動モデルを得ることができた。ニューラルネットワークモデルが神経活動をよく記述することが伺えた。
一方、線虫の行動についても定量化を試みた。自由行動中の線虫の画像を連続的に撮影し、線虫の姿勢を数値化した結果をMDN-RNNと呼ばれる深層確率生成モデルで学習させることにより、線虫の動きを行動の切り替えも含めて再現できた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ニューラルネットワークモデルによる神経活動の再現が予定通り進んだ。

Strategy for Future Research Activity

線虫の運動について確率モデルで再現できたことから、今後神経活動についても確率モデルを採用して現実に近い活動を作れるかを試す。

  • Research Products

    (9 results)

All 2019 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Caenorhabditis elegans: a model to understand host?microbe interactions2019

    • Author(s)
      Kumar Arun、Baruah Aiswarya、Tomioka Masahiro、Iino Yuichi、Kalita Mohan C.、Khan Mojibur
    • Journal Title

      Cellular and Molecular Life Sciences

      Volume: 77 Pages: 1229~1249

    • DOI

      10.1007/s00018-019-03319-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DAF-16/FOXO promotes taste avoidance learning independently of axonal insulin-like signaling2019

    • Author(s)
      Nagashima Takashi、Iino Yuichi、Tomioka Masahiro
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 15 Pages: e1008297

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1008297

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multiple sensory neurons mediate starvation-dependent aversive navigation inCaenorhabditis elegans2019

    • Author(s)
      Jang Moon Sun、Toyoshima Yu、Tomioka Masahiro、Kunitomo Hirofumi、Iino Yuichi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 18673~18683

    • DOI

      10.1073/pnas.1821716116

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 線虫C. elegansの神経ネットワークのダイナミクス2019

    • Author(s)
      飯野 雄一
    • Organizer
      第90回日本動物学会大会
  • [Presentation] Molecular and neural network mechanisms for the alteration in taste evaluation of C. elegans2019

    • Author(s)
      Yuichi Iino
    • Organizer
      48th Naito Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bio-image informatics for whole-brain activity imaging of C. elegans2019

    • Author(s)
      Yu Toyoshima
    • Organizer
      22nd International Worm Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 線虫全脳の機能的イメージングと動態解析2019

    • Author(s)
      豊島 有
    • Organizer
      第44回レーザー顕微鏡研究会
    • Invited
  • [Presentation] Two distinct sets of chemosensory neurons involved in food-related navigation.2019

    • Author(s)
      Moonsun Jang
    • Organizer
      22th International C. elegans Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 飯野研究室

    • URL

      http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JTop.html

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi