2020 Fiscal Year Annual Research Report
プラナリア生殖戦略のインテグリティを支える新奇機構の解明
Publicly Offered Research
| Project Area | Ensuring integrity in gametogenesis |
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| Project/Area Number |
19H05236
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| Research Institution | Hirosaki University |
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Principal Investigator |
小林 一也 弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (50360110)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | プラナリア / ゲノム解析 / ゲノムインテグリティー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
1有性化阻害細菌と有性化阻害因子の同定
先行研究においてプラナリア有性化阻害細菌を同定した。目的細菌のゲノムの決定するために培養系の確立を目指したがうまくいかなかった。そこで、有性化阻害細菌が無性個体に存在している細菌の内の約70-80%を占めているという特徴を利用して、ダイレクトにホストから細菌を単離する方法を確立した。現在は単離した細菌叢のゲノム解析をナノポアシーケンサーを用いて行っている最中である。一方、有性化阻害因子はプラナリア無性個体に多く含まれているという仮説のもとで、メタボローム解析を行った。その結果、候補物質を４種同定していた。これらの物質に有性化阻害効果があるかを検証したところ、有性化初期に起こる卵巣誘導に関して、3-メチルアデニンと4-GBAに抑制効果がみられた。今後は、さらに完全有性化に決定的な阻害効果があるかの検証が必要である。また、有性化阻害細菌のゲノム決定後は3-メチルアデニンと4-GBAの産出に関わる遺伝子が存在しているかを検証する。
2プラナリアゲノムのインテグリティ保証システムの解明
先行研究から、プラナリアではPIWI-piRNAによるレトロトランスポゾン抑制システムによって生殖系列細胞ではゲノムのインテグリティは保証されている一方で、体細胞のゲノムはレトロトランスポゾンにより積極的に壊されているという仮説が提唱できた。そこで、本研究の照明に必須なDugesia ryukyuensisのゲノム解析に取り組んだ。イルミナで読んだ約200bpの短いリード情報を用いてK-mer解析を行った結果、ゲノム解読に適当なクローン集団を得ることができた。次にChromiumによるlinked readシーケンスを行なったが、予想よりも解読状況が芳しくなく、ロングリードシーケンスに必須な実験動物のゲノム抽出法を確立し、現在、PacBioシーケンスに取り組んでいる。
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(5 results)
