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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Chromatin potential underlying the cellular reprogramming triggered by DNA damage

Publicly Offered Research

Project AreaChromatin potential for gene regulation
Project/Area Number 19H05274
Research InstitutionUtsunomiya University

Principal Investigator

玉田 洋介  宇都宮大学, 工学部, 准教授 (50579290)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
KeywordsDNA損傷 / クロマチン / 幹細胞化 / エピゲノム / 生細胞イメージング / 補償光学 / ホログラフィー
Outline of Annual Research Achievements

幹細胞化を誘導するためのDNA損傷によって細胞が死に、それが傷害刺激となって幹細胞化が誘導された可能性を完全に排除するために、死細胞の細胞核を標識する蛍光色素propidium iodideにて植物体を標識しながら、DNA損傷による幹細胞化の全過程を観察する系を構築した。この系を用いた観察の結果、DNA損傷による幹細胞化過程のほとんどの場合において細胞死は観察されなかった。このことから、細胞死に伴う傷害刺激によらず、DNA損傷が幹細胞化を誘導することを実証した。この結果をNature Plants誌に報告し、少なくとも83件のプレス報道(国内新聞9件、国内ウェブ新聞50件、国際ウェブ新聞21件、専門誌紹介3件)があった。また、DNA損傷によって幹細胞化する一部の葉細胞におけるエピゲノムを解明するためにはシングルセル解析が効果的である。ヒメツリガネゴケ葉のように個別の細胞が単離できない組織に対しては、多数の細胞核を単離して解析する単一細胞核解析が有効であることが近年報告されている。単一細胞核解析に向けたインタクトな細胞核の大量単離実験を進めた。
DNA損傷による幹細胞化の過程における定量深部細胞核イメージングを実現するため、光の乱れを計測し補正することで高解像深部観察を行う補償光学の研究を北見工業大学や国立天文台と共同で進めた。点光源がなくとも画像の相関によって光の乱れを計測する画像相関法を補償光学に適用し、さらに得られた画像についてストレール比などのパラメータを比較することで、蛍光像と明視野像の両方における高解像イメージングを実証し、論文にて発表した。また、神戸大学と共同で、3次元に分布する蛍光と位相の両方をシングルショットで計測するデジタルホログラフィーや、3枚の画像から計測する強度輸送方程式を用いたイメージングを生細胞観察に適用することに成功し、複数の論文にて発表した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Remarks


玉田 洋介. "DNAが傷つくと幹細胞に変化することを発見" 化学 75: 72 (2020).

  • Research Products

    (28 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 6 results) Remarks (5 results)

  • [Int'l Joint Research] Huazhong Agricultural University/Hubei University of Medicine(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Huazhong Agricultural University/Hubei University of Medicine
  • [Int'l Joint Research] Institute of Experimental Botany(チェコ)

    • Country Name
      CZECH
    • Counterpart Institution
      Institute of Experimental Botany
  • [Int'l Joint Research] Universitat Jaume I(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      Universitat Jaume I
  • [Journal Article] Multi-physical parameter cross-sectional imaging of quantitative phase and fluorescence by integrated multimodal microscopy2021

    • Author(s)
      Sudheesh K Rajput, Osamu Matoba, Manoj Kumar, Xiangyu Quan, Yasuhiro Awatsuji, Yosuke Tamada, Enrique Tajahuerce
    • Journal Title

      IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics

      Volume: in press Pages: -

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multimodal microscopy: Fast acquisition of quantitative phase and fluorescence imaging in 3D space2021

    • Author(s)
      Xiangyu Quan, Manoj Kumar, Sudheesh K Rajput, Yosuke Tamada, Yasuhiro Awatsuji, Osamu Matoba
    • Journal Title

      IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics

      Volume: 27 Pages: 6800911

    • DOI

      10.1109/JSTQE.2020.3038403

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-shot common-path off-axis digital holography: applications in bioimaging and optical metrology2021

    • Author(s)
      Manoj Kumar, Osamu Matoba, Xiangyu Quan, Sudheesh K Rajput, Yasuhiro Awatsuji, Yosuke Tamada
    • Journal Title

      Applied Optics

      Volume: 60 Pages: A195-A204

    • DOI

      10.1364/AO.404208

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Imaging performance of microscopy adaptive-optics system using scene-based wavefront sensing2020

    • Author(s)
      Yusuke Ashida, Yusuke Honma, Noriaki Miura, Takatoshi Shibuya, Hayao Kikuchi, Yosuke Tamada, Yasuhiro Kamei, Atsushi Matsuda, Masayuki Hattori
    • Journal Title

      Journal of Biomedical Optics

      Volume: 25 Pages: 123707

    • DOI

      10.1117/1.JBO.25.12.123707

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-shot common-path off-axis dual-wavelength digital holographic microscopy2020

    • Author(s)
      Manoj Kumar, Xiangyu Quan, Yasuhiro Awatsuji, Yosuke Tamada, Osamu Matoba
    • Journal Title

      Applied Optics

      Volume: 59 Pages: 7144-7152

    • DOI

      10.1364/AO.395001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA damage triggers reprogramming of differentiated cells into stem cells in Physcomitrella2020

    • Author(s)
      Nan Gu*, Yosuke Tamada*, Akihiro Imai, Gergo Palfalvi, Yukiko Kabeya, Shuji Shigenobu, Masaki Ishikawa, Karel J. Angelis, Chunli Chen, Mitsuyasu Hasebe
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 6 Pages: 1098-1105

    • DOI

      10.1038/s41477-020-0745-9

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 細胞壁によって固定された植物細胞における単一細胞解析2020

    • Author(s)
      玉田 洋介, 久保 稔
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 52 Pages: 777-780

  • [Journal Article] ディジタルホログラフィ瞬時多次元イメージング2020

    • Author(s)
      的場 修, Manoj Kumar, 全 香玉, 粟辻 安浩, 玉田 洋介
    • Journal Title

      Optics design: 光設計研究グループ機関誌

      Volume: 69 Pages: 28-34

  • [Journal Article] ディジタルホログラフィ瞬時マルチモーダルイメージングとその応用2020

    • Author(s)
      的場 修, Manoj Kumar, 全 香玉, 粟辻 安浩, 玉田 洋介
    • Journal Title

      検査技術

      Volume: 25 Pages: 21-26

  • [Presentation] 光渦を利用した高感度波面センシングの数値シミュレーション2020

    • Author(s)
      須藤 星路, 村上 尚史, 早野 裕, 服部 雅之, 玉田 洋介, 秋山 毅志, 稲垣 滋
    • Organizer
      日本光学会年次学術講演会OPJ2020
  • [Presentation] 補償光学顕微鏡を用いた作物の生細胞イメージング2020

    • Author(s)
      初見 洲人, 服部 雅之, 黒倉 健, 児玉 豊, 早野 裕, 山本 裕紹, 玉田 洋介
    • Organizer
      日本光学会年次学術講演会OPJ2020
  • [Presentation] サブ回折限界照明顕微法による三次元イメージングの検討2020

    • Author(s)
      山田 理己, 小倉 裕介, 西村 隆宏, 玉田 洋介, 村田 隆, 谷田 純
    • Organizer
      日本光学会年次学術講演会OPJ2020
  • [Presentation] 顕微鏡用AO用差分型波面センシングのための領域抽出処理の導入2020

    • Author(s)
      菊池 駿, 三浦 則明, 蘆田 悠輔, 澁谷 隆俊, 玉田 洋介, 松田 厚志, 服部 雅之
    • Organizer
      日本光学会年次学術講演会OPJ2020
  • [Presentation] オンリーワンの研究者を目指して2020

    • Author(s)
      玉田 洋介
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
    • Invited
  • [Presentation] 天文技術補償光学を用いて生命の深部を生きたまま観察し操作する2020

    • Author(s)
      玉田 洋介
    • Organizer
      第45回光学シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Stable multimodal three-dimensional imaging2020

    • Author(s)
      Manoj Kumar, Osamu Matoba, Xiangyu Quan, Yosuke Tamada, Yasuhiro Awatsuji
    • Organizer
      3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Improvement of signal-to-noise ratio in super resolution imaging using subdiffraction limited spots by additional digital signal processing2020

    • Author(s)
      Riki Yamada, Yusuke Ogura, Takahiro Nishimura, Yosuke Tamada, Takashi Murata, Jun Tanida
    • Organizer
      Biomedical Imaging and Sensing Conference 2020(コロナウイルス感染症拡大防止のため予稿発表を持って口頭発表と代えることとなった)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Live-cell imaging to illuminate the mechanism underlying high stem-cell formation ability in plants2020

    • Author(s)
      Yosuke Tamada
    • Organizer
      Biomedical Imaging and Sensing Conference 2020(コロナウイルス感染症拡大防止のため予稿発表を持って口頭発表と代えることとなった)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 生体深部の超解像観察へ:生細胞による光の乱れを補正する補償光学顕微鏡2020

    • Author(s)
      玉田 洋介, 三浦 則明, 服部 雅之
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第76回学術講演会(紙上開催)
    • Invited
  • [Presentation] Non-interferometric 3D fluorescence imaging for bio-applications2020

    • Author(s)
      Osamu Matoba, Sudheesh K. Rajput, Manoj Kumar, Xiangyu Quan, Yosuke Tamada, Yasuhiro Awatsuji, Enrique Tajahuerce
    • Organizer
      SPIE Defense + Commercial Sensing
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 宇都宮大学 地域創生科学研究科 光工学プログラム

    • URL

      https://www.utsunomiya-u.ac.jp/grdc/agricultural/light_engineering.html

  • [Remarks] 宇都宮大学 工学部 物質環境化学コース

    • URL

      http://www.eng.utsunomiya-u.ac.jp/course/material-and-environmental-chemistry-course/

  • [Remarks] 宇都宮大学 オプティクス教育研究センター (CORE)

    • URL

      https://uu-core.com/

  • [Remarks] 宇都宮大学 ロボティクス・工農技術研究所 (REAL)

    • URL

      https://ja-jp.facebook.com/REAL.Utsunomiya/

  • [Remarks] 日本光学会 研究グループ

    • URL

      http://myosj.or.jp/group/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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