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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Mathematical analysis of outlier immune cells using extreme statistics

Publicly Offered Research

Project AreaSingularity biology
Project/Area Number 19H05422
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

中村 直俊  名古屋大学, 理学研究科, 特任准教授 (30554472)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords運動軌跡 / 確率分布
Outline of Annual Research Achievements

蛍光顕微鏡下で観測された、細胞運動の不均一性を定量化し、クラスタリングを行う方法として、運動軌跡を離散速度ベクトルの確率分布とみなし、異なる細胞間での確率分布の距離をJensen-Shannon divergenceを用いて定量し、新しい座標空間内に細胞を布置する新規手法を論文化し、国際学会(Methods of Mathematical Oncology: Fusion of Mathematics and Biology)の報告集(Springer, 2021)に査読付き原著論文として発表した。また、この研究などで得られた成果について、雑誌「応用数理」において4回の連載(チュートリアル・細胞生物学の数理(1)-(4)、各6ページ)で一般の数理科学研究者および生命科学研究者のために詳細に説明を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

提案している新規手法を論文化し、国際学会の報告集に査読付き原著論文として発表することができた。また、雑誌「応用数理」において成果を4回の連載(チュートリアル・細胞生物学の数理)にまとめた。

Strategy for Future Research Activity

細胞の運動軌跡をさらに、相互作用も含めて解析する方法として、最近のコロナ禍でも注目された人流の解析の手法を取り入れることを検討している。複数の細胞の相互作用および場との相互作用について、速度ベクトルの分布の1次モーメントおよび2次モーメントを詳しく解析する予定である。

  • Research Products

    (17 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 2 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Lifestyle changes during the coronavirus disease 2019 pandemic impact metabolic dysfunction?associated fatty liver disease2022

    • Author(s)
      Fujii Hideki、Nakamura Naotoshi、Fukumoto Shinya、Kimura Tatsuo、Nakano Akemi、Nadatani Yuji、Tauchi Yukie、Nishii Yuuko、Takashima Shingo、Kamada Yoshihiro、Watanabe Toshio、Kawada Norifumi
    • Journal Title

      Liver International

      Volume: 42 Pages: 995~1004

    • DOI

      10.1111/liv.15158

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Preoperative Left Ventricular Energy Loss in the Operating Theater Reflects Subjective Symptoms in Chronic Aortic Regurgitation2022

    • Author(s)
      Kainuma Atsushi、Itatani Keiichi、Akiyama Koichi、Naito Yoshifumi、Ishii Maki、Shimizu Masaru、Ohara Junya、Nakamura Naotoshi、Nakajima Yasufumi、Numata Satoshi、Yaku Hitoshi、Sawa Teiji
    • Journal Title

      Frontiers in Surgery

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fsurg.2022.739743

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Expression of Cancer Stem Cell Markers EpCAM and CD90 Is Correlated with Anti- and Pro-Oncogenic EphA2 Signaling in Hepatocellular Carcinoma2021

    • Author(s)
      Asakura Nobuhiko、Nakamura Naotoshi、Muroi Atsushi、Nojima Yosui、Yamashita Taro、Kaneko Shuichi、Ikeda Kazuki、Koshikawa Naohiko、Suzuki Takashi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 22 Pages: 8652~8652

    • DOI

      10.3390/ijms22168652

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 細胞生物学の数理(1) 概論とMichaelis-Menten式2021

    • Author(s)
      中村 直俊
    • Journal Title

      応用数理

      Volume: 31 Pages: 32~37

    • DOI

      10.11540/bjsiam.31.1_32

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞生物学の数理(2) 細胞間不均一性2021

    • Author(s)
      中村 直俊
    • Journal Title

      応用数理

      Volume: 31 Pages: 28~33

    • DOI

      10.11540/bjsiam.31.2_28

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞生物学の数理(3) 動く細胞2021

    • Author(s)
      中村 直俊
    • Journal Title

      応用数理

      Volume: 31 Pages: 28~33

    • DOI

      10.11540/bjsiam.31.3_28

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞生物学の数理(4) 不完全な情報に対処する2021

    • Author(s)
      中村 直俊
    • Journal Title

      応用数理

      Volume: 31 Pages: 28~33

    • DOI

      10.11540/bjsiam.31.4_28

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 細胞の表現型不均一性を数理モデルとデータサイエンスで解明する2022

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      京都駅前セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Deciphering heterogeneity in liver diseases using mathematical models and data science2022

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      ASHBiセミナー
    • Invited
  • [Presentation] EphA2 と EGFR を介する肝細胞がんの悪性化経路の数理モデリング2021

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      ネオMEセミナー
    • Invited
  • [Presentation] Mathematical modeling of hepatocellular cancer progression via EphA2 and EGFR.2021

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 肝がん悪性化シグナルの数理モデルによる解析2021

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      日本応用数理学会2021年度年会
  • [Presentation] Team 14: Lipid therapeutics for rejuvenating senile T cells2021

    • Author(s)
      Nakamura N, Tay A, Almsherqi Z
    • Organizer
      The Interstellar Initiative: 2nd workshop
  • [Presentation] EphA2とEGFRを介する肝細胞がんの悪性化経路の数理モデリング2020

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      数理腫瘍学研究会
  • [Presentation] EphA2とEGFRを介する肝細胞がんの悪性化経路の数理モデリング2020

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      ワークショップ・工学と数学の接点を求めて
    • Invited
  • [Presentation] Mathematical modeling of hepatocellular cancer progression via EphA2 and EGFR2020

    • Author(s)
      中村直俊
    • Organizer
      Fusion of Mathematics and Biology, JSPS Core-to-Core Program "Establishing International Research Network of Mathematical Oncology"
    • Int'l Joint Research
  • [Book] Methods of Mathematical Oncology2021

    • Author(s)
      Naotoshi Nakamura, Ryo Yamada
    • Total Pages
      11
    • Publisher
      Springer
    • ISBN
      9789811648663

URL: 

Published: 2022-12-28  

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