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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Redox potential of the oxygen-evolving complex

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of novel light energy conversion system through elucidation of the molecular mechanism of photosynthesis and its artificial design in terms of time and space
Project/Area Number 20H05090
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

石北 央  東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (00508111)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Keywords人工光合成
Outline of Annual Research Achievements

植物などが行う天然光合成における水分解酸素発生反応は蛋白質photosystem II (PSII)で行われる。本研究では、最近の結晶構造で明らかにされたMn4CaO5近傍の水分子挙動および水分解に関わる電子移動経路のコファクターのエナジェティクスをも分子化学的に解明した。Mn4CaO5の配位水W1-W4のpKaをタンパク質環境の存在下、非存在下で同定した。その結果、「W2が解離してOH-」との前提で進めている研究の多くは、実は「タンパク質環境非存在下」の計算で得られた結果を基に行っているものであり、タンパク質環境ではプロトンアクセプターの存在するW1の方が解離しやすいことが明らかとなった。この結果は、今までのあいまいにされてきたまま進められてきた(根拠の弱い)前提をくつがえすものであり、重要なマイルストーンとなると思われる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

コロナ禍で多くの制限があったにもかかわらず、精力的に研究を進めた。その結果、2020年に10報の論文発表を行うことができた。

Strategy for Future Research Activity

今までの研究はX-ray diffraction (XRD)構造を主に用いて研究を行ってきた。その間、多くのX-ray free electron laser (XFERL)による反応中間体構造や、cryo-EM構造(アンテナタンパク質との複合体構造)も発表されている。本研究で開発した手法を今後これらのタンパク質分子構造に適応することにより、水分解反応のより多角的な解析と、(そのエネルギーを供給する)アンテナタンパク質からのエネルギー移動の過程もあわせて解析することにより、系の統合的な理解を進める。

  • Research Products

    (10 results)

All 2020

All Journal Article (10 results)

  • [Journal Article] Insights into the Protein Functions and Absorption Wavelengths of Microbial Rhodopsins2020

    • Author(s)
      Tsujimura Masaki、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 124 Pages: 11819-11826

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c08910

  • [Journal Article] The Nature of the Short Oxygen?Oxygen Distance in the Mn<sub>4</sub>CaO<sub>6</sub> Complex of Photosystem II Crystals2020

    • Author(s)
      Mandal Manoj、Saito Keisuke、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 11 Pages: 10262-10268

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.0c02868

  • [Journal Article] Redox potentials along the redox-active low-barrier H-bonds in electron transfer pathways2020

    • Author(s)
      Saito Keisuke、Mandal Manoj、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 22 Pages: 25467-25473

    • DOI

      10.1039/D0CP04265J

  • [Journal Article] Dependence of the chlorophyll wavelength on the orientation of a charged group: Why does the accessory chlorophyll have a low site energy in photosystem II?2020

    • Author(s)
      Saito Keisuke、Mitsuhashi Koji、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry

      Volume: 402 Pages: 112799-112799

    • DOI

      10.1016/j.jphotochem.2020.112799

  • [Journal Article] Green-Sensitive, Long-Lived, Step-Functional Anion Channelrhodopsin-2 Variant as a High-Potential Neural Silencing Tool2020

    • Author(s)
      Kojima Keiichi、Miyoshi Natsuki、Shibukawa Atsushi、Chowdhury Srikanta、Tsujimura Masaki、Noji Tomoyasu、Ishikita Hiroshi、Yamanaka Akihiro、Sudo Yuki
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 11 Pages: 6214-6218

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.0c01406

  • [Journal Article] Energetics of Ionized Water Molecules in the H-Bond Network near the Ca<sup>2+</sup> and Cl<sup>?</sup> Binding Sites in Photosystem II2020

    • Author(s)
      Saito Keisuke、Mandal Manoj、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 59 Pages: 3216-3224

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.0c00177

  • [Journal Article] pKa of the ligand water molecules in the oxygen-evolving Mn4CaO5 cluster in photosystem II2020

    • Author(s)
      Saito Keisuke、Nakagawa Minesato、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      Communications Chemistry

      Volume: 3 Pages: 89

    • DOI

      10.1038/s42004-020-00336-7

  • [Journal Article] Rigidly hydrogen-bonded water molecules facilitate proton transfer in photosystem II2020

    • Author(s)
      Sakashita Naoki、Ishikita Hiroshi、Saito Keisuke
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 22 Pages: 15831-15841

    • DOI

      10.1039/d0cp00295j

  • [Journal Article] Acquirement of water-splitting ability and alteration of the charge-separation mechanism in photosynthetic reaction centers2020

    • Author(s)
      Tamura Hiroyuki、Saito Keisuke、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 117 Pages: 16373-16382

    • DOI

      10.1073/pnas.2000895117

  • [Journal Article] Quenching of Singlet Oxygen by Carotenoids via Ultrafast Superexchange Dynamics2020

    • Author(s)
      Tamura Hiroyuki、Ishikita Hiroshi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry A

      Volume: 124 Pages: 5081-5088

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.0c02228

URL: 

Published: 2022-12-28  

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