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2021 Fiscal Year Annual Research Report

The molecular mechanism of TORC1-regulated micronucleophagy

Publicly Offered Research

Project AreaMultimode autophagy: Diverse pathways and selectivity
Project/Area Number 20H05317
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

丑丸 敬史  静岡大学, 理学部, 教授 (50262788)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
KeywordsTORC1 / オートファジー / ヌクレオファジー / ミクロオートファジー / ミクロヌクレオファジー / rDNA / 核小体
Outline of Annual Research Achievements

出芽酵母で栄養源飢餓により誘導されるヌクレオファジー(核を分解するオートファジー)では核小体タンパク質が選択的に分解されるが、核小体内にあるrDNA領域も含め染色体DNAは分解されない。ミクロヌクレオファジーにおいて、この分解は液胞と核の接触部(NVJ)が液胞内に陥入し取り込まれることにより起こる。研究代表者は、分解される核小体タンパク質はNVJに近寄り、分解されないrDNAは凝縮しつつ核小体タンパク質から分離してNVJより遠ざかることを見出した。本研究では、NVJがこの染色体・核小体の核内配置を制御する分子基盤を明らかにすることを目的とした。
研究代表者は、NVJに対しての核小体タンパク質とrDNAの定方向性の運動性がコンデンシンとHmo1依存的なrDNA凝縮と、CLIP/cohibin依存的なrDNAの核内膜繋留を必要とすることを明らかにしていた。NVJを欠く変異株ではミクロヌクレオファジーに加え、核内イベントであるrDNA凝縮も消失した(Tasnin et al. 2021)。このことは、液胞が核外からNVJを介して核小体リモデリングを指令することを示す。さらに、NVJ局在性タンパク質を網羅的に調べた結果、rDNA凝縮に必要な因子として既知のNvj1に加えてMdm1を同定した(Sharmin et al. 2021)。
一方、分裂期のrDNA凝縮に必要なCdc14フォスファターゼとトポイソメラーゼIIが、飢餓誘導性にも必要であることを見出した(Mostofa et al. 2021)。しかし、間期細胞を用いたところ、飢餓誘導性のrDNA凝縮はコンデンシン非依存性であること、しかしながらHmo1、Cdc14、Rpd3ヒストン脱アセチル化酵素、CLIP/cohibinは必要とすることを明らかにした(Takeichi et al. 2022)。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The PI3 kinase complex II-PI3P-Vps27 axis on vacuolar membranes is critical for microautophagy induction and nutrient stress adaptation2022

    • Author(s)
      Most Naoshia Tasnin, Kisara Ito, Haruko Katsuta, Tsuneyuki Takuma, Tasnuva Sharmin, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 434 Pages: 167360

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2021.167360

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] nterphase chromosome condensation in nutrient-starved conditions requires Cdc14 and Hmo1, but not condensin, in yeast2022

    • Author(s)
      Yuri Takeichi, Tsuneyuki Takuma, Kotaro Ohara, Most Naoshia Tasnin, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 611 Pages: 46-52

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.04.078

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vacuolar fragmentation promotes fluxes of microautophagy and micronucleophagy but not of macroautophagy2022

    • Author(s)
      Tsuneyuki Takuma and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 614 Pages: 161-168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cdc14 protein phosphatase and topoisomerase II mediate rDNA dynamics and nucleophagic degradation of nucleolar proteins after TORC1 inactivation2021

    • Author(s)
      Md. Golam Mostofa, Shamsul Morshed, Satoru Mase, Shun Hosoyamada, Takehiko Kobayashi, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Cellular Signalling

      Volume: 79 Pages: 109884

    • DOI

      10.1016/j.cellsig.2020.109884

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The vacuole controls nucleolar dynamics and micronucleophagy via the NVJ2021

    • Author(s)
      Most Naoshia Tasnin, Tsuneyuki Takuma, Tasnuva Sharmin, Shamsul Morshed, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 550 Pages: 158-165

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.02.141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sorting nexin Mdm1/SNX14 regulates nucleolar dynamics at the NVJ after TORC1 inactivation2021

    • Author(s)
      Tasnuva Sharmin, Tsuneyuki Takuma, Shamsul Morshed, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 552 Pages: 1-8

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.03.033

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cdc14 phosphatase downmodulates ESCRT-0 complex formation on vacuolar membranes and microautophagy after TORC1 inactivation2021

    • Author(s)
      Tasnuva Sharmin, Shamsul Morshed, Most Naoshia Tasnin, Tsuneyuki Takuma, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 561 Pages: 158-164

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.05.021

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TORC1 inactivation promotes APC/C-dependent mitotic slippage in yeast and human cells2021

    • Author(s)
      Chihiro Yamada, Aya Morooka, Seira Miyazaki, Masayoshi Nagai, Satoru Mase, Kenji Iemura, Most Naoshia Tasnin, Tsuneyuki Takuma, Shotaro Nakamura, Shamsul Morshed, Naoki Koike, Md. Golam Mostofa, Muhammad Arifur Rahman, Tasnuva Sharmin, Haruko Katsuta, Kotaro Ohara, Kozo Tanaka, and Takashi Ushimaru
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 103675

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.103675

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] NVJが制御する核小体局在移動とミクロヌクレオファジー2021

    • Author(s)
      丑丸 敬史、Most Naoshia Tasnin、Tasnuva Sharmin、Md. Golam Mostofa
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 飢餓下の出芽酵母における複数のNVJが核小体リモデリングに及ぼす影響の解析2021

    • Author(s)
      宅間恒行、丑丸敬史
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
  • [Presentation] 出芽酵母M期における飢餓誘導性rDNA凝縮の分析2021

    • Author(s)
      大原公太郎、武市有莉、丑丸敬史
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
  • [Remarks] 丑丸研究室

    • URL

      https://wwp.shizuoka.ac.jp/ushimaru-lab/

URL: 

Published: 2022-12-28  

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