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2020 Fiscal Year Annual Research Report

揺動散逸定理の破れと非ガウス性解析に基づく非熱的揺らぎの有用性評価

Publicly Offered Research

Project AreaInformation physics of living matters
Project/Area Number 20H05536
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

水野 大介  九州大学, 理学研究院, 教授 (30452741)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Keywordsアクティブマター / 非平衡メカニクス / 非平衡散逸 / 非ガウス揺らぎ / 揺動散逸定理
Outline of Annual Research Achievements

モーター蛋白質やその他の酵素分子を始めとする生体高分子機械は、希薄なin vitro系よりも密に詰め込まれた細胞内の混み合い環境の下で最適に稼働する。本研究では、生体高分子機械の稼働速度や効率に対して周囲媒質の”非平衡性”が及ぼす影響に着目して、この謎の解明を目指している。
混み合い環境のもとで生体高分子機械が稼働すると、非熱的な揺らぎが生じて細胞質は非平衡状態となる。これまで、揺動散逸定理の破れを観測することで、非平衡系における非熱的揺らぎの強度(2次のモーメント)を求め、その増大に伴って細胞骨格が硬化したり、逆に、細胞質の流動が促進することを見出した。これらの観測結果は、生体高分子機械が主導する細胞内部の代謝活動が、非熱的な揺らぎによって物理的に活性化される可能性を示唆する。他方で、細胞内における非熱的な揺らぎは、系の熱力学温度を変えない程度の僅かなエネルギーしか持たない。したがって、熱的には励起しにくい過程を微弱な非熱的揺らぎが速やかに励起して、生体高分子機械の機能を活性化していると考えられた。そこで、非熱的な揺らぎが、熱揺らぎとは全く異なる統計的な偏りや時空間相関を示すことに着目して、非熱的揺らぎの有用性の評価に取り組んだ。
具体的には、揺動散逸定理の破れから、非平衡散逸、力のスペクトル、実効温度等を見積もり、また、非熱揺らぎの統計分布を解析することで、その非ガウス性が生体高分子機械にとっての非熱エネルギーの質とどのように関係するか?考察した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平衡かつ混み合った媒質内で生体高分子機械の機能が向上する機構を解明するために、周囲媒質のメカニクスと非平衡揺らぎに着目した実験的研究を推進した。そのために、マイクロレオロジー法を用いて、細胞内部や細胞類似のモデル試料に埋め込んだコロイド粒子の揺らぎ・応答観測を行い、揺動散逸定理の破れ(=非熱的な揺らぎの強さ)と、周囲媒質の力学特性の関係性を系統的に観測した。得られた結果を領域研究者との議論の下で解析し、結果のとりまとめを行っている。

Strategy for Future Research Activity

今後さらに、生体高分子機械の動き易さや、生体高分子に伝達する非熱的な力を推定し、生体高分子機械の機能と非熱揺らぎの相関を理論解析するための実験的知見を得る。得られた結果を領域内の理論研究者と忌憚なく議論することで、非熱揺らぎの“強度”に留まらず、その“質”を評価するための方法論の構築を目指す。

  • Research Products

    (19 results)

All 2021 2020

All Journal Article (4 results) Presentation (15 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Rapid local compression in active gels is caused by nonlinear network response2020

    • Author(s)
      Mizuno D.、Tardin C.、Schmidt C. F.
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 16 Pages: 9369~9382

    • DOI

      10.1039/c9sm02362c

  • [Journal Article] Experimental and theoretical energetics of walking molecular motors under fluctuating environments2020

    • Author(s)
      Ariga Takayuki、Tomishige Michio、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 12 Pages: 503~510

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00684-7

  • [Journal Article] Optimization of Optical Trapping and Laser Interferometry in Biological Cells2020

    • Author(s)
      Sugino Yujiro、Ikenaga Masahiro、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Applied Sciences

      Volume: 10 Pages: 4970~4970

    • DOI

      10.3390/app10144970

  • [Journal Article] Biophysics at Kyushu University2020

    • Author(s)
      Akiyama Ryo、Annaka Masahiko、Kohda Daisuke、Kubota Hiroyuki、Maeda Yusuke、Matsumori Nobuaki、Mizuno Daisuke、Yoshida Norio
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 12 Pages: 245~247

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00643-2

  • [Presentation] 代謝活性を持つ細胞質モデルのレオロジーと構造緩和2021

    • Author(s)
      杉野裕次郎, 熊丸一平, 福本昂平, 曽和義幸, 高橋達郎, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第76回年次大会
  • [Presentation] レーザー干渉法における光てこの応用2021

    • Author(s)
      井口昇之, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第76回年次大会
  • [Presentation] 光てこを用いたレーザー干渉法による粒子追跡2021

    • Author(s)
      井口昇之, 水野大介
    • Organizer
      応用物理学会春季学術講演会
  • [Presentation] レーザー干渉法を用いたアクティブマターの力学計測2020

    • Author(s)
      杉野裕次郎, 福本昂平, 三谷一晃, 西澤賢治, 高橋達郎, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] 生体高分子ゲルの局所力学応答2020

    • Author(s)
      白木啓悟, 本田菜月, Francis van Esterik, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] 局所外力印加によりひき起こされるミクロスケールでの高分子の構造緩和2020

    • Author(s)
      西澤賢治, 本田菜月, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] 光てこを用いたレーザー干渉法による粒子追跡2020

    • Author(s)
      井口昇之, 三谷一晃, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] 局所的な力印加における濃厚コロイド懸濁液のマイクロレオロジー2020

    • Author(s)
      荊原佳祐, 江藤高宏, 林原蹴斗, 荻原僚, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] 外力誘起により流動する濃厚コロイド懸濁液のマイクロレオロジー2020

    • Author(s)
      江藤高宏, 荊原佳祐, 荻原僚, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] アクティブ環境下でのキネシンの運動2020

    • Author(s)
      有賀隆行, 立石圭人, 富重道雄, 水野大介
    • Organizer
      日本物理学会 第75回年次大会
  • [Presentation] モーター蛋白質が生み出す非熱揺らぎの時空間特性と細胞質流動化2020

    • Author(s)
      水野大介
    • Organizer
      第10回分子モーター討論会
    • Invited
  • [Presentation] ずり場印加下における濃厚コロイド懸濁液のマイクロレオロジー2020

    • Author(s)
      江藤高宏,荊原佳祐,水野大介
    • Organizer
      第126回日本物理学会九州支部例会
  • [Presentation] 局所的な力印加による濃厚コロイド懸濁液のマイクロレオロジー2020

    • Author(s)
      荊原佳祐,江藤高宏,水野大介
    • Organizer
      第126回日本物理学会九州支部例会
  • [Presentation] 非平衡系におけるアクティブ拡散と構造緩和の測定2020

    • Author(s)
      熊丸一平,杉野裕次郎,水野大介
    • Organizer
      第126回日本物理学会九州支部例会
  • [Presentation] 濃厚エマルジョンの広帯域マイクロレオロジー2020

    • Author(s)
      井口昇之,水野大介
    • Organizer
      第126回日本物理学会九州支部例会

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Published: 2021-12-27  

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