2021 Fiscal Year Annual Research Report
逆イジングモデル法に基づく機能未知な微生物遺伝子の機能推定
Publicly Offered Research
| Project Area | Post-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system |
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| Project/Area Number |
20H05582
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| Research Institution | Waseda University |
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Principal Investigator |
福永 津嵩 早稲田大学, 高等研究所, 講師(任期付) (80791433)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 遺伝子機能推定 / ゲノム進化 / 系統プロファイル法 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究計画は、機能未知遺伝子の機能を高精度に予測する手法として、 (1) 逆イジング法を用いた高精度系統プロファイル法を開発する (2) ゲノムデータに付 随するメタデータを統合的に解析するための逆イジングモデル法の技術的拡張、 という 2 点について研究を行うことを目的としていた。
これまでのところ、(1-2)ゲノム進化史を高速・高精度に推定するソフトウェアMirage ver1およびver2、(3)逆イジング法による系統プロファイル法の高性能化の 実証およびMirageとの統合について研究をまとめ、既に論文を報告している。現在、開発したソフトウェアをシアノバクテリアのゲノムデータに適用すること で、フィコビリソームに関与する機能未知遺伝子の機能解析を行う研究に取り組んでいる。
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| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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