2009 Fiscal Year Annual Research Report
海洋における生物起源気体の変換に関わる細菌機能群の動態解析
Publicly Offered Research
| Project Area | Linkages in biogeochemical cycles between surface ocean and lower atmosphere |
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| Project/Area Number |
21014005
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
浜崎 恒二 The University of Tokyo, 海洋研究所, 准教授 (80277871)
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| Keywords | 海洋 / 細菌 / DMS |
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| Research Abstract |
本研究では、生物起源気体の一種であるジメチルサルファイド(DMS)及びその前駆物質であるジメチルスルフォプロピオネイト(DMSP)の海水中での変換、分解に関わる海洋細菌群集の主要代謝遺伝子について、その時空間的な分布と発現量の変動パターンを明らかにすることを目的とした。相模湾等から分離した環境株を用いて、DMSP変換遺伝子保有細菌の探索を行った。複数の対象遺伝子のうち、DMSPリアーゼによるDMSへの直接的変換に関わるdddL遺伝子、アシルコエンザイムとの結合を経てDMSへ開裂する変換に関わるdddD遺伝子及びdddR遺伝子について、その保有細菌の探索を行った。いずれも、既報のプライマーセットを用いて、145株のPCR増幅によるスクリーニングを行ったが、dddD遺伝子についてのみ、4株から増幅産物が得られた。これら増幅産物の配列を決定後、相同性検索を行ったが、dddD遺伝子の登録データが少なく特定できなかった。これらの株を用いたDMS生成実験による確認が必要と考えられる。他の遺伝子に関しては、さらにPCR増幅条件の検討が必要と考えられた。また、南大洋におけるDMSP分解実験で得られた環境試料について、dddD遺伝子のPCRによる検出を行い、適当なサイズの増幅産物が得られたが、増幅量が少なくさらに詳しい解析が出来なかった。今後、プライマーセットも含めたPCR増幅条件の検討が必要と考えられた。
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Research Products
(4 results)
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[Journal Article] Analysis of nanoplankton community structure using flow sorting and molecular techniques2009
Author(s)
Yoshida, N, Nishimura, M., Inoue, K., Yoshizawa, S, Kamiya, E., Taniguchi, A., Hamasaki, K., Kogure, K.
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Journal Title
Microbes and Environments 24
Pages: 297-304
Peer Reviewed
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