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2009 Fiscal Year Annual Research Report

古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明と光応答性カリウムチャネルの開発

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular interaction and modal shift of cellular sensors
Project/Area Number 21026016
Research InstitutionInstitute for Molecular Science

Principal Investigator

古谷 祐詞  Institute for Molecular Science, 生命・錯体分子科学研究領域, 准教授 (80432285)

Keywordsシグナル伝達 / 赤外分光法 / 生体分子 / 蛋白質 / 生物物理
Research Abstract

Anabaena Sensory Rhodopsin (ASR)は、光反応過程、光誘起構造変化、情報伝達タンパク質(ASRT)との相互作用が、これまで研究されてきた古細菌型ロドプシンとまったく異なる新奇な光センサー蛋白質である。本研究では、研究代表者が最適化してきた液中で計測可能な全反射赤外分光計測を駆使することにより、生理的条件に近い温度、pH、塩濃度環境下での計測を実現し、ASRと情報伝達タンパク質(ASRT)の光情報伝達過程に伴うタンパク質の構造変化や水素結合変化を明らかにすることを目的としている。さらに、内向きプロトンポンプ活性を示すD217E変異体の特性を生かし、そのC末端にK^+チャネルであるKcsAを遺伝子工学的手法により連結させ、光応答性K^+チャネルを創成することを目指す。
平成21年度は以下のような研究成果を得た。1.内向きプロトンポンプ活性を示すD217E変異体について、プロトン輸送活性および光誘起赤外差スペクトルの計測を行い、学術論文にまとめた(A.Kawanabe et al., J.Am.Chem.Soc.131,16439-16444)。2.べん毛モーター蛋白質を構成するPomA/PomB蛋白質に対して、全反射赤外分光計測を行い、Na^+イオンの透過経路の1つとしてAsp24を同定した(Y.Sudo et al., Biochemistry 48,10136-10145)。3.KcsAに対しても各種アルカリ金属イオンとの相互作用を全反射赤外分光計測での解析を開始し、イオン種によって異なる差スペクトルを得ることに成功し、第47回生物物理学会年回で発表した(Y.Asai et al., The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)。

  • Research Products

    (36 results)

All 2010 2009

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (30 results)

  • [Journal Article] An FTIR Study of Monkey Green- and Red-Sensitive Visual Pigments2010

    • Author(s)
      Kouta Katayama et al.
    • Journal Title

      Angew.Chem.Int.Ed. 49

      Pages: 891-894

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Manipulation of the Protein-complex Function by Using an Engineered Heterotrimeric Coiled-coil Switch2009

    • Author(s)
      Toshihisa Mizuno et al.
    • Journal Title

      Org.Biomol.Chem. 7

      Pages: 3102-3111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of Chloride Ion Binding on the Photochemical Properties of Salinibacter Sensory Rhodopsin I2009

    • Author(s)
      Daisuke Suzuki et al.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 392

      Pages: 48-62

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Engineering an inward proton transport from a bacterial sensor rhodopsin2009

    • Author(s)
      Akira Kawanabe et al.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 131

      Pages: 16439-16444

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of signaling complex composed of sensory rhodopsin I and its cognate transducer protein from the eubacterium Salinibacter rubber2009

    • Author(s)
      Yuki Sudo et al.
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 10136-10145

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interaction between Na+ ion and carboxylates of the PomA-PomB statorunit studied by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • Author(s)
      Yuki Sudo et al.
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 11699-11705

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2010

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      平成21年度生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100329-20100330
  • [Presentation] X-H, X-D伸縮振動領域の赤外分光法から何が分かるか?2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] センサーロドプシンを用いたプロトンポンプ研究2010

    • Author(s)
      川鍋陽
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2010

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡によるロドプシンの動態観察―ロドプシンの直接観察から何が分かるか、何をもたらすか―2010

    • Author(s)
      山下隼人
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何が分かるか""何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2010

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      新学術領域「π空間」第3回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100315-20100316
  • [Presentation] KcsAチャネルの全反射赤外分光解析2010

    • Author(s)
      浅井佑介
    • Organizer
      新学術領域「π空間」第3回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター、岡崎
    • Year and Date
      20100315-20100316
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明と光応答性カリラムチャネルの開発2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「細胞感覚」平成21年度冬の班会議
    • Place of Presentation
      箕面観光ホテル、箕面
    • Year and Date
      20091223-20091224
  • [Presentation] Stimulus-Induced Difference FTIR Spectroscopy for Archaeal-Type Rhodopsins2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      2nd Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences-Experiments and Simulations
    • Place of Presentation
      Symposion Hall, Nagoya University, Nagoya
    • Year and Date
      20091222-20091223
  • [Presentation] Study on chimeric archeal-rhodopsin containing cytoplasmic loop of bovine rhodopsin2009

    • Author(s)
      Aya Nakatsuma
    • Organizer
      1^<st> International Symposium on Emergence of Highly Elaborated π-Space and Its Function
    • Place of Presentation
      Hotel Hankyu Expo Park, Suita
    • Year and Date
      20091218-20091219
  • [Presentation] Interaction between membrane protein and ions characterized by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Sodium ion binding sites of V-ATPase studied by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] An FTIR Study of Monkey Green- and Red-Sensitive Visual Pigments2009

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] ATR-FTIR study of KcsA channel2009

    • Author(s)
      浅井佑介
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Study on chimeric archeal-rhodopsin containing cytoplasmic loop of bovine rhodopsin2009

    • Author(s)
      Aya Nakatsuma
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Encapsulation of ion-pumping rhodopsins into multi-wall carbon nanotubes2009

    • Author(s)
      川島崇睦
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      ASTY Tokushima, Tokushima
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] An FTIR Study of Monkey Green- and Red-Sensitive Visual Pigments2009

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      Horiba-ISSP International Symposium(ISSP-11)on "Hydrogen and Water in Condensed Matter Physics"
    • Place of Presentation
      Seimeinomori Resort, Chiba
    • Year and Date
      20091012-20091016
  • [Presentation] 全反射赤外分光法によるKcsAチャネルのイオン選択およびpH センシング機構の解析2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      第3回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋大学、名古屋
    • Year and Date
      20090921-20090924
  • [Presentation] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2009

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      第3回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋大学、名古屋
    • Year and Date
      20090921-20090924
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンのカーボンナノチューブへの内包2009

    • Author(s)
      川島崇睦
    • Organizer
      第3回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋大学、名古屋
    • Year and Date
      20090921-20090924
  • [Presentation] Structural Analysis of Sodium Ion Binding Sites of V-ATPase from Enterococcus hirae by use of ATR-FTIR Spectroscopy2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      Internal Symposium : Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes
    • Place of Presentation
      Shirankaikan in Kyoto University, Kyoto
    • Year and Date
      20090908-20090910
  • [Presentation] KcsAチャネルに対する赤外分光の狙いは達成されたのか?2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「高次系分子科学」第7回ミニ公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      越前町生涯学習センター越前分館、越前
    • Year and Date
      20090831-20090901
  • [Presentation] ロドプシンのカーボンナノチューブへの内包2009

    • Author(s)
      川島崇睦
    • Organizer
      新学術領域研究「高次π空間」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都テルサ、京都
    • Year and Date
      20090827-20090828
  • [Presentation] 赤外分光法による膜タンパク質の機能発現に伴う構造変化解析2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      第49回分子科学若手の会夏の学校
    • Place of Presentation
      もみのき森林公園、広島県廿日市市
    • Year and Date
      20090817-20090821
  • [Presentation] 霊長類色覚視物質の赤外分光解析2009

    • Author(s)
      片山耕大
    • Organizer
      生物物理若手の会第49回夏の学校
    • Place of Presentation
      支笏湖ユースホステル、支笏湖
    • Year and Date
      20090731-20090803
  • [Presentation] ロドプシンのカーボンナノチューブへの内包2009

    • Author(s)
      川島崇睦
    • Organizer
      生物物理若手の会第49回夏の学校
    • Place of Presentation
      支笏湖ユースホステル、支笏湖
    • Year and Date
      20090731-20090803
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明と光応答性カリウムチャネルの開発2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「細胞感覚」平成21年度夏の班会議
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター、沖縄
    • Year and Date
      20090629-20090630
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンで実現した内向きのプロトンポンプ2009

    • Author(s)
      川鍋陽
    • Organizer
      第36回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館、札幌
    • Year and Date
      20090619-20090620
  • [Presentation] ATR-FTIR Spectroscopy for Investigating Interaction Changes upon Binding of Ions to Transmembrane Proteins2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      First World Congress of International Academy of Nanomedicine(IANM)
    • Place of Presentation
      Sanya, China
    • Year and Date
      20090611-20090614
  • [Presentation] Analysis of Hydrogen-Bonding Dynamics of a Water Cluster Formed in an Isolated Nanospace2009

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      The 3rd Symposium on "Molecular Science for Supra Functional Systems"
    • Place of Presentation
      Tokyo Institute of Technology, O-okayama
    • Year and Date
      20090603-20090605

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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