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2009 Fiscal Year Annual Research Report

モータータンパク質の揺らぎと性能の相関を調べる超高速光学顕微鏡の開発

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
Project/Area Number 21107517
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

飯野 亮太  Osaka University, 産業科学研究所, 助教 (70403003)

Keywords分子モーター / 1分子計測 / 暗視野顕微鏡 / 光学顕微鏡 / ゆらぎ
Research Abstract

本課題は、マイクロ秒の時間分解能とナノメートルの空間分解能を同時に達成する超高速光学顕微鏡を開発してモータータンパク質の1分子計測を行い、その化学-力学共役におけるタンパク質の構造揺らぎの役割を解明することを目的とする。
本年度は、全反射型照明タイプのレーザー暗視野顕微鏡の設計および組み立てを行い、その基本性能を検討した。またデータ処理の高速化を目指し、得られた画像の解析法(座標位置決定法)として、シンプルで高速な重心計算(輝度による重みづけを含む)と、より処理時間のかかるガウス関数によるフィッティング(いわゆるFIONAに用いられている方法)との比較を行った。
直径60nmの金コロイド粒子をプローブとして利用し、波長532nmのレーザーを光源に用いた全反射型レーザー暗視野顕微鏡で画像取得をした場合、9.1マイクロ秒の時間分解能(110,000フレーム/秒)で約1.5nmの位置決定精度が得られた。また位置決定精度はガウスフィット法と重心計算法で差はみられず、より高速で短時間で結果が得られる後者が非常に有効であることが明らかとなった(Ueno et al Biophys J 2010 印刷中)。
今後は、532nm以外のレーザー波長や(473nm等)、金コロイド以外のプローブ(銀コロイド等)の検討等を行い、よりサイズの小さなブローブで同等またはより高い空間分解能を達成する。その後、回転モータータンパク質であるF_1-ATPase (F_1)の観察を行い、ATP結合待ちやATP加水分解待ちの停止、および回転中の回転子γサブユニットの揺らぎを詳細に調べる。特に、ATP加水分解活性が異なる好熱菌由来および大腸菌由来のF_1の揺らぎの比較を行う。

  • Research Products

    (17 results)

All 2010 2009

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Visualization of ATP levels inside single living cells with fluorescence resonance energy transfer-based genetically encoded indicators2009

    • Author(s)
      Imamura, H., Huynh Nhat, K.P., Togawa, H., Saito, K., Iino, R., Kato-Yamada, Y., Nagai, T., Noji, H.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA. 106

      Pages: 15651-15656

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-molecule study on the temperature-sensitive reaction of F_1-ATPase with a hybrid F_1 carrying a single ss (E 190D)2009

    • Author(s)
      Enoki, S., Watanabe, R., Iino, R., Noji, H.
    • Journal Title

      J Biol Chem. 284

      Pages: 23169-23176

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanism of inhibition by C-terminal α-helices of the ε subunit of Escherichia coli F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Iino, R., Hasegawa, R., Tabata, K.V., Noji, H.
    • Journal Title

      J Biol Chem. 284

      Pages: 17457-17464

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Preparation and Biological Application of Water-In-Oil Microchamber Array Formed on Hydrophobic/Hydrophilic Patterned Surface.2009

    • Author(s)
      Iino R, Sakakihara S, Noji H
    • Journal Title

      Proc μTAS 2

      Pages: 1121-1123

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Single-Molecule Imaging of Ion-Transporting Rotary Motor Protein2010

    • Author(s)
      Ryota Iino, Khek-Chian Tham, Kazuhito V.Tabata, Hiroshi Ueno, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      International Symposium of Joint Research Network on Advanced Materials and Devices
    • Place of Presentation
      Sapporo (Japan)
    • Year and Date
      2010-03-25
  • [Presentation] 超微小反応容器を用いた1分子バイオアッセイ2010

    • Author(s)
      飯野亮太, 野地博行
    • Organizer
      第57回応用物理学関連連合講演会シンポジウム「ナノバイオエンジニアリングの現状と未来像」
    • Place of Presentation
      神奈川県平塚市
    • Year and Date
      2010-03-18
  • [Presentation] Fluctuation theorem applied to F_1-ATPase2010

    • Author(s)
      Kumiko Hayashi, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      Biophysical Society 54^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Francisco (USA)
    • Year and Date
      2010-02-24
  • [Presentation] The role of P_i-release as the main torque generating step of F_1-ATPase2010

    • Author(s)
      Rikiya Watanabe, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      Biophysical Society 54^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Francisco (USA)
    • Year and Date
      2010-02-21
  • [Presentation] Simple Total Internal Reflection Dirk-field Microscopy with Nanometer spatial precision and Microsecond Temporal Resolution2009

    • Author(s)
      Hiroshi Ueno, So Nishikawa, Ryota Iino, Kazuhito Tabata, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      The 3^<rd> International Symposium : Molecular Science of Fluctuation toward Biological Functions
    • Place of Presentation
      Nagoya (Japan)
    • Year and Date
      2009-12-20
  • [Presentation] Direct observation of steps in c-ring rotation of Escherichia coli F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Ryota Iino
    • Organizer
      JST/CREST Symposium : WBMA'09 (Watching Biomolecules in Action)
    • Place of Presentation
      Osaka (Japan)
    • Year and Date
      2009-12-15
  • [Presentation] Simple Total Internal Reflection Dirk-field Microscopy with Nanometer spatial precision and Microsecond Temporal Resolution2009

    • Author(s)
      Hiroshi Ueno, So Nishikawa, Ryota Iino, Kazuhito Tabata, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      第47回(2009年度)日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島県
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] Stiffness of Y subunit of F_1-ATPase2009

    • Author(s)
      Daichi Okuno, Ryota Iino, Rie Hasegawa, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      第47回(2009年度)日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島県
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] Mechanism of inhibition by C-terminal α-helices of the ε subunit of Escherichia coil F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Ryota Iino, Rie Hasegawa, Kazuhito Tabata, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      第47回(2009年度)日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島県
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] The completion of chemo-mechanical coupling scheme of F_1-ATPase ; The determination of the timing of P_i-release2009

    • Author(s)
      Rikiya Watanabe, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      第47回(2009年度)日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島県
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] Torque measurements of F_1-ATPase by using the fluctuation theorem2009

    • Author(s)
      Kumiko Hayashi, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      第47回(2009年度)日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島県
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] 36-degree stepping rotation of F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji, Ryota Iino
    • Organizer
      International Symposium "Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes"
    • Place of Presentation
      Kyoto (Japan)
    • Year and Date
      2009-09-09
  • [Book] 「第4章 第1節 第1項 生体膜超分子モーター-細胞の回転エネルギー変換装置:ATP合成酵素」超分子サイエンス&テクノロジー2009

    • Author(s)
      飯野亮太、田端和仁、野地博行
    • Total Pages
      (851-859)
    • Publisher
      NTS

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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