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2010 Fiscal Year Annual Research Report

運動する生物のロバスト追跡と傾向画像解析

Publicly Offered Research

Project AreaSystems molecular ethology to understand the operating principle of the nervous system
Project/Area Number 21115502
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

橋本 浩一  東北大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 (80228410)

Keywordsオートフォーカス / ビジュアルサーボ / 蛍光画像処理 / 線虫 / ゼブラフィッシュ
Research Abstract

本研究の目的は、生物が持つ「神経系の活動状態」とそのアウトプットとしての「行動」を高い時間・空間分解能で計測する装置を開発することである。
生物の行動を理解するためには、それを作り出している神経系の複雑な情報処理過程を解明することが必要不可欠である。しかし、近年の行動遺伝学の進展にもかかわらず多段階の情報処理過程はいまだにほとんど明らかにされていない。そのもっとも大きな原因は、観察倍率と視野サイズがトレードオフの関係にあり、運動する生物を高い空間分解能で長時間観察することができないことにある。そこで本研究では、顕微鏡画像のフィードバックにより顕微鏡ステージを制御して生物の運動を追跡するという本質的な解決策により、高い空間分解能を保ったまま神経活動を長時間記録・解析可能なシステムを開発する。とくに、モデル生物として盛んに研究されている線虫(C.elegans)やゼブラフィッシュ(Danio rerio)の神経部位を明視野像と蛍光像を用いてリアルタイム追跡し、同時に神経細胞の蛍光像を記録できる顕微鏡の実現を目指す。
本年度は、線虫の変形やZ軸方向のずれにロバストな画像処理アルゴリズムおよびその高速化手法、神経細胞の蛍光像をフィードバックしたオートフォーカス手法、高精度な三次元追跡が可能なビジュアルサーボステージを開発した。実際、埼玉大学中井教授、大阪大学木村准教授、名古屋大学森教授、東京大学飯野教授などの研究室にXYZステージを導入し、フィードバック制御アルゴリズムを提供した。これらの共同研究の成果は学会発表の予定である。

  • Research Products

    (4 results)

All 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] GPU Acceleration in a Visual Servo System2012

    • Author(s)
      Chuantao Zang, Koichi Hashimoto
    • Journal Title

      Journal of Robotics and Mechatronics

      Volume: 24 Pages: 105-114

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fast Sensor Scheduling for Spatially Distributed Sensors2011

    • Author(s)
      Shogo Arai, Yasushi Iwatani, Koichi Hashimoto
    • Journal Title

      IEEE Transactions on Automatic Control

      Volume: 56 Pages: 1900-1905

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞の個体差に適応する高速オートフォーカス顕微鏡2011

    • Author(s)
      小原健、五十嵐康伸、橋本浩一
    • Journal Title

      計測自動制御学会論文集

      Volume: 47 Pages: 31-39

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Visual Servo Microscope for Locking on Single Neuron of a Worm2011

    • Author(s)
      Mitsunori Maru, Min Chen, Koichi Hashimoto
    • Organizer
      IEEE Int.Conf.Robotics and Biomimetics
    • Place of Presentation
      Thailand, Phuket
    • Year and Date
      20111207-20111211

URL: 

Published: 2013-06-26  

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