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2009 Fiscal Year Annual Research Report

植物自然免疫を担う活性酸素生成酵素の制御機構の構造生物学的解明

Publicly Offered Research

Project AreaSignaling functions of reactive oxygen species
Project/Area Number 21117513
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

清水 敏之  Yokohama City University, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (30273858)

Keywords活性酸素 / Rboh / X線結晶解析 / EFハンド / カルシウム / Rac1
Research Abstract

活性酸素種は動植物を問わず重要な生理活性物質でありその生成は厳密に制御されている。本申請は植物の感染防御応答において中心的な役割を果たす膜タンパク質の活性酸素生成酵素(NADPH oxidase;イネではOsRbohB)に焦点をあて、動物食細胞のものとは異なる活性化機構を明らかにし、活性酸素生成の制御過程を原子レベルで明らかにすることを目的とする。イネ由来のRbohB、Rac1を研究対象に選び大腸菌による大量発現系、精製系を検討している。カルシウム結合型のOsRbohBに関しては構造解析を終了している。OsRac1は全長の形で大腸菌に形質転換させ大量発現に成功し複数のカラムクロマトグラフィーを用いて精製を行い、やや取得量は少ないが1Lあたり1mg程度のタンパク質がとれる段階まで達している。
RbohBとRac1の相互作用を検討するためRbohBのカルシウム存在・非存在、Rac1のGTP結合型・GDP結合型を用いてプルダウンアッセイを行った。その結果、相互作用はGTP依存性があったが、カルシウムに関しては依存性がなかった。またカルシウムの有無による構造変化を検討するためSAXS及びCDスペクトルを測定した。その結果有意な差が認められたため何らかの構造変化あると考えられる。一方Rac1との相互作用面を見出すためNMRを用いたperturbation実験を行った結果コイルドコイルの領域にあることが示唆された。

  • Research Products

    (6 results)

All 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with a REV3 fragment.2009

    • Author(s)
      Hara, et al.
    • Journal Title

      Acta Crysatallogr. F65

      Pages: 1302-1305

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of the zinc-finger domain of zebrafish Nanos2009

    • Author(s)
      Hashimoto, et al.
    • Journal Title

      Acta Crysatallogr. F65

      Pages: 959-961

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for novel interactions between human translesion synthesis polymerases and PCNA2009

    • Author(s)
      Hishiki, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 284

      Pages: 10552-10560

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Intrinsic Dynamics of Restriction Endonuclease EcoO109I Studied by Molecular Dynamics Simulations and X-Ray Scattering Data Analysis2009

    • Author(s)
      Oroguchi, et al.
    • Journal Title

      Biophys.J 96

      Pages: 2808-2822

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural Studies of Chromatin-related Proteins PAD4 and NML Recognizing Intrinsically Disordered Region2009

    • Author(s)
      Shimizu T
    • Organizer
      Yokohama NMR workshop
    • Place of Presentation
      Yokohama
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/xtal/index.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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