2021 Fiscal Year Annual Research Report
生体内ニューロン分化における高時間解像度・多階層クロマチンポテンシャルの解析
Publicly Offered Research
| Project Area | Chromatin potential for gene regulation |
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| Project/Area Number |
21H00242
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
岸 雄介 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 講師 (00645236)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | ニューロン / 神経幹細胞 / scATAC-seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、神経幹細胞がニューロンに運命決定してから4日間の初期分化過程にて、どういったクロマチン構造変化が起きるかを、scATAC-seqを用いて解析した。
その結果、数時間の単位でクロマチン構造が次々に変化すること、またその変化に相関して活性を変化させる転写因子が多数存在することが明らかとなった。個々の転写因子に注目して、転写因子自身の発現タイミングと活性化するタイミングを解析してみると、1. 発現と活性化のタイミングが相関する転写因子、2. 発現と活性化のタイミングが逆相関する転写因子、3. 発現が活性化より少し早い転写因子、が存在することがわかった。現在のところ、1は遺伝子発現をまさにそのタイミングで制御する転写因子、2は遺伝子発現を抑制する転写因子、3はクロマチン構造を前もって転換する因子である可能性を考えている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
ニューロン分化の初期過程では、細胞の状態が数時間単位で大きく変化するが、その変化の基盤にある遺伝子発現制御メカニズムはほとんどわかっていない。本年度の研究では、この初期過程でクロマチン構造がどのように変化するか、そしてそれを制御する可能性のある転写因子群を明らかにすることができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、同定した転写因子群のノックアウトや過剰発現を実施することで、それらが本当にニューロン分化初期過程のクロマチン構造変化に重要なのか、そしてニューロン分化の進行に重要なのかを明らかにする。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Protective role of HMGB1 in keratinocytes in skin inflammation by maintaining chromatin modification2021
Author(s)
Naoyuki Senda, Hideyuki Yanai, Sana Hibino, Lei Li, Yu Mizushima, Tomomitsu Miyagaki, Mai Saeki, Yusuke Kishi, Sho Hangai, Junko Nishio, Makoto Sugaya, Tadatsugu Taniguchi, and Shinichi Sato
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Journal Title
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Volume: 118
Pages: e2022343118
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A FOXG1-dependent critical period for autism-associated GABAergic circuits2021
Author(s)
Goichi Miyoshi*, Yoshifumi Ueta, Akiyo Natsubori, Kou Hiraga, Hironobu Osaki, Yuki Yagasaki, Yusuke Kishi, Yuchio Yanagawa, Gord Fishell, Rob Machold, and Mariko Miyata
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Journal Title
Nature Communications
Volume: 12
Pages: 3773
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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