• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

Genome modality in the nuclear pore territories

Publicly Offered Research

Project AreaGenome modality: understanding physical properties of the genome
Project/Area Number 21H05744
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

WONG W・R  金沢大学, ナノ生命科学研究所, 教授 (30464035)

Project Period (FY) 2021-09-10 – 2023-03-31
Keywords核膜孔 / DNA
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、核構造に結びついたゲノムDNA-核膜構成因子の相互作用の観点から、核膜孔テリトリーにおけるゲノムモダリティを解明することである。高速AFM技術をベースとし、ヌクレオソームを構成するヒストンタンパク質H2AがDNAとの相互作用により、 物理的にDNAの屈性を制御することを解明した。ヒストンH2AとDNA、ならびにその相互作用の解明を目指した。結果として、生命科学において広く知られていながらも誰も見たことがなかった、ヒストンが DNAに巻き付き離れるダイナミクスの一部を初めて明らかにした(J. Phys. Chem. Lett. 2021, Nature index-Research highlight: DNA wrap videos)。また、DNAやタンパク質などの生体高分子が局所的に集まることで液滴を形成する相分離現象は,細胞内でおこる複雑な生命現象を効率よく進める基盤的機構として注目されています。Wongは,相分離を評価できる蛍光プローブ(Pyr-A)の開発に成功した (iScience 2021)。さらに、エピジェネティックな「リーダー」であるブロモドメインタンパク質(BRD4)のC末端に存在する天然変性領域(IDR)は相分離を引き起こし、転写調節因子の集積とその安定化に寄与する。Wongは、核膜孔タンパク質NUP210がBRD4およびヒストンH3を介しクロマチンと相互作用していることを見出した (Cells 2022)。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Nanoscopic Assessment of Anti-SARS-CoV-2 Spike Neutralizing Antibody Using High-Speed AFM2023

    • Author(s)
      Lim Keesiang、Nishide Goro、Sajidah Elma Sakinatus、Yamano Tomoyoshi、Qiu Yujia、Yoshida Takeshi、Kobayashi Akiko、Hazawa Masaharu、Ando Toshio、Hanayama Rikinari、Wong Richard W.
    • Journal Title

      Nano Letters

      Volume: 23 Pages: 619~628

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.2c04270

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spatiotemporal tracking of small extracellular vesicle nanotopology in response to physicochemical stresses revealed by HS‐AFM2022

    • Author(s)
      Sajidah Elma Sakinatus、Lim Keesiang、Yamano Tomoyoshi、Nishide Goro、Qiu Yujia、Yoshida Takeshi、Wang Hanbo、Kobayashi Akiko、Hazawa Masaharu、Dewi Firli R. P.、Hanayama Rikinari、Ando Toshio、Wong Richard W.
    • Journal Title

      Journal of Extracellular Vesicles

      Volume: 11 Pages: 12275~12275

    • DOI

      10.1002/jev2.12275

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Inhibition of Canonical Wnt Signaling Promotes Ex Vivo Maintenance and Proliferation of Hematopoietic Stem Cells in Zebrafish2022

    • Author(s)
      Kimura Koki、Yamamori Shiori、Hazawa Masaharu、Kobayashi-Sun Jingjing、Kondo Mao、Wong Richard W、Kobayashi Isao
    • Journal Title

      Stem Cells

      Volume: 40 Pages: 831~842

    • DOI

      10.1093/stmcls/sxac044

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Discovery of a Novel Aminocyclopropenone Compound That Inhibits BRD4-Driven Nucleoporin NUP210 Expression and Attenuates Colorectal Cancer Growth2022

    • Author(s)
      Kondo Hiroya、Mishiro Kenji、Iwashima Yuki、Qiu Yujia、Kobayashi Akiko、Lim Keesiang、Domoto Takahiro、Minamoto Toshinari、Ogawa Kazuma、Kunishima Munetaka、Hazawa Masaharu、Wong Richard W.
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 11 Pages: 317~317

    • DOI

      10.3390/cells11030317

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] NSP9 of SARS-CoV-2 attenuates nuclear transport by hampering nucleoporin 62 dynamics and functions in host cells2022

    • Author(s)
      Makiyama Kei、Hazawa Masaharu、Kobayashi Akiko、Lim Keesiang、Voon Dominic C.、Wong Richard W.
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 586 Pages: 137~142

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.11.046

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Nano assessment of how viruses seize host nuclear transport systems2022

    • Author(s)
      Richard Wong
    • Organizer
      新学術創成研究機構ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] Nano assessment of how viruses hijack host nuclear transport systems2022

    • Author(s)
      Richard Wong
    • Organizer
      15th NanoLSI Colloquium
    • Invited
  • [Presentation] Nano imaging of genomic modality in nuclear pore territories2022

    • Author(s)
      Richard Wong
    • Organizer
      学術変革領域A 2022年度 ゲノムモダリティ領域会議
    • Invited
  • [Presentation] Nano imaging of nuclear pore dynamics in cancer cells2022

    • Author(s)
      Richard Wong
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] クロススケール核膜孔内選択的分子輸送システムの解明とその破綻2022

    • Author(s)
      Richard Wong
    • Organizer
      学術変革領域A クロススケール新生物学 第2回領域会議
    • Invited
  • [Remarks] http://fsowonglab.w3.kanazawa-u.ac.jp/sample3.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi