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2011 Fiscal Year Annual Research Report

分子間相互作用に由来する振動バンドの強度と形状の変化を理解するための解析法理論

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Science for Supra Functional Systems ? Development of Advanced Methods for Exploring Elementary Process
Project/Area Number 22018009
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

鳥居 肇  静岡大学, 教育学部, 教授 (80242098)

Keywords分子間相互作用 / 振動スペクトル / 強度 / バンド形状 / 理論解析 / 水素結合 / 水 / ペプチド
Research Abstract

スペクトルを構成する重要要素のうち,「強度」と「形状」に関しては,これまでに十分な理解が得られているとは言い難い。これらの理解を統合的に且つ十分に進めることにより,振動スペクトルを十分に生かし切った解析が可能になると考えられる。本研究では,分子間相互作用に由来する振動バンドの強度と形状の変化を統合的に理解するための解析法理論を,実験研究者に提示することを目的としている。今年度は以下の成果を得た。
1.水素結合に与る水分子の並進運動に伴う電子密度の変化を,水30分子程度から成るクラスターを対象とした理論計算により検討した。その結果,この並進運動により大きな分子間電荷フラックス(分子間の電荷の授受)が引き起こされ,それが十分な大きさの双極子微分として現れることを明らかにした。これを取り入れることにより,液体の水のTHzスペクトルにおける~200cm^<-1>のバンドを再現できることを,1024分子系のMD計算を用いて示した。
2.ペプチド鎖のアミドII赤外バンド強度が大きな2次構造依存性を示すメカニズムを,理論計算により検討した。当該ペプチド基のN-H基と隣接ペプチド基のC=O基の位置関係と振動形により,ペプチド基間電荷フラックスの赤外強度への寄与が変化することが,重要であることを示した。
3.DMF同位体混合液体のC=O伸縮ラマンバンドに見られるバンド融合と強度偏りのメカニズムを,理論的に検討した。時間領域の理論計算により,実験的に得られるバンド形を十分な精度で再現することができることを示し,バンド融合と強度偏りが,異なる同位体種間の分子間振動カップリングによって生ずることを明らかにした。

  • Research Products

    (16 results)

All 2012 2011

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] Merged-and separate-band behavior of the C=O stretching band in N,N-dimethylformamide isotopic liquid mixtures : DMF/DMF-d_1, DMF/DMF-d_6, and DMF/DMF-^<13>C=O2012

    • Author(s)
      H.Torii, M.G.Giorgini, M.Musso
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.B

      Volume: 116 Pages: 353-366

    • DOI

      10.1021/jp209119e

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanism of the Secondary Structure Dependence of the Infrared Intensity of the Amide II Mode of Peptide Chains2012

    • Author(s)
      H.Torii
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.Lett.

      Volume: 3 Pages: 112-116

    • DOI

      10.1021/jz201540r

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 液相系の赤外・遠赤外スペクトルの計算手法と基礎理論2012

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Journal Title

      日本赤外線学会誌

      Volume: (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Intermolecular electron density modulations in water and their effects on the far-infrared spectral profiles at 6 THz2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.B

      Volume: 115 Pages: 6636-6643

    • DOI

      10.1021/jp201695b

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 水の分子内・分子間振動に伴う電子の挙動の解析2012

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学(横浜市)
    • Year and Date
      2012-03-26
  • [Presentation] Structures, rapid dynamics, and vibrational spectra of proteins and related liquid systems : Theoretical study2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Organizer
      Shizuoka University International Symposium 2011-Initiatives for Crossing Boundaries within Science and Technology-
    • Place of Presentation
      B-nest(静岡市)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] 水素結合系の低振動数モードの振動分極率と電子の動き2011

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      第34回溶液化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Year and Date
      2011-11-16
  • [Presentation] Resonantly delocalized vibrational dynamics and intermolecular electronic motions induced by the OH stretching and molecular translation in liquid water2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Organizer
      Workshop on Dynamics and Structure of Water : From Gas Phase Clusters to Condensed Phase
    • Place of Presentation
      Inst.Atom.Mol.Sci., Acad.Sinica(台北市,台湾)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-15
  • [Presentation] 液体の水における分子間の電子の動きとTHzスペクトル強度2011

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      日本分光学会テラヘルツ分光部会シンポジウム「テラヘルツ分光法の最先端V」~バイオテラヘルツ分光~
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-29
  • [Presentation] ペプチドの赤外強度に対する電荷フラックスの効果2011

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      第5回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] How are the electronic motions coupled to nuclear motions in liquids? The cases of water and related systems2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Organizer
      EMLG/JMLG Annual Meeting 2011
    • Place of Presentation
      Hotel Sofitel Victoria (Warsaw, Poland)
    • Year and Date
      2011-09-12
  • [Presentation] The structural organization of dipolar liquids in electrolytic solutions probed by the noncoincidence effect : The case of Li^+/propylene carbonate solutions2011

    • Author(s)
      M.G.Giorgini, H.Torii, M.Musso
    • Organizer
      EMLG/JMLG Annual Meeting 2011
    • Place of Presentation
      Hotel Sofitel Victoria (Warsaw, Poland)
    • Year and Date
      2011-09-12
  • [Presentation] Effects of intermolecular electron density modulations on the Terahertz spectral intensity of liquid water2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Organizer
      The Seventh Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京都)
    • Year and Date
      2011-09-05
  • [Presentation] Intermolecular electron density modulations in water related to vibrational couplings and intensities : OH stretching and terahertz2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Organizer
      15th International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Place of Presentation
      Centro Stefano Francini (Switzerland)
    • Year and Date
      2011-06-21
  • [Presentation] Spectroscopic phenomena arising from resonant intermolecular vibrational coupling and the related electronic motions2011

    • Author(s)
      H.Torii
    • Organizer
      CECAM Workshop on "Vibrational Spectroscopy of Complex Systems"
    • Place of Presentation
      Ecole Normale Superieure (Paris, France)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-05-23
  • [Presentation] 水の分子並進運動に誘起される電子の揺らぎと遠赤外スペクトルの形状2011

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      第14回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山市)
    • Year and Date
      2011-05-13

URL: 

Published: 2013-06-26  

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