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2011 Fiscal Year Annual Research Report

膜タンパク質の生理分子科学

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Science for Supra Functional Systems ? Development of Advanced Methods for Exploring Elementary Process
Project/Area Number 22018026
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

小倉 尚志  兵庫県立大学, 大学院・生命理学研究科, 教授 (70183770)

Keywords生体エネルギー変換 / チトクロムc酸化酵素 / 電子伝達 / プロトンポンプ / 共鳴ラマン / ミトコンドリア / 呼吸調節 / リン脂質小胞
Research Abstract

ミトコンドリア内膜の呼吸鎖電子伝達系では呼吸基質から遊離した電子が伝達され、それと共役したプロトンポンプが働く。そして膜電位(ΔΨ)とプロトン濃度勾配(ΔpH)からなるプロトン駆動力(Δμ_H+)が生成する。電子伝達速度はΔμ_H+により制御されることが知られており、呼吸調節と呼ばれている。このしくみを分子構造に基づいて説明するために、可溶化チトクロムo酸化酵素(CcO)をリン脂質二重膜小胞に再構成したCOVをモデル系として用いた。色素ローダミンを用いてΔΨをプローブし、ΔΨ存在下と非存在下の共鳴ラマンスペクトルを比較したところ、ほとんど差が認められなかった。一方、Δμ_H+存在下と非存在化では共鳴ラマンスペクトルに差が認められたため、構造変化を引き起こすのはΔpHであることが示唆された。pH指示薬であるパィラニンを用いた実験ではCOV外液のpH変化は認められなかったため、ヘムの構造変化を引き起こしているのはCOV内部のアルカリ化であることが示唆された。紫外共鳴ラマン分光法によるCOVの構造解析の準備としてCcOの紫外共鳴ラマンスペクトル(励起波長:229nm)を測定する条件を決定した。また、COV中のP中間体を調べる準備として紫外ラマン用石英試料管(セル)中でCcOのP中間体を調製する条件を決定した。
CO結合型CcOのCOを光解離した後のヘムおよびその近傍の構造変化を時間分解可視共鳴ラマン分光法で調べた。2つのヘムの協同的構造変化を検出するとともにCO結合型や平衡状態還元型とは異なる中間的コンフォメーションの存在が明らがにした。同様の実験をプローブ光を赤外として行った。CO光解離後の遅延時間50ns以内にアミドIバンドが変化し、その変化は2μsの時定数で消失した。この変化はプロトンゲートの開閉を反映している可能性が高い。

  • Research Products

    (25 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (20 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] An intermediate conformational state during ligand binding to cytochrome c oxidase detected by time-resolved resonance Raman analyses of heme peripheral group2012

    • Author(s)
      Izumi Ishigami, et al
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 2 Pages: 178-180

    • DOI

      10.1246/cl.2012.178

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] T-quaternary structure of oxy human adult hemoglobin in the presence of two allosteric effectors, L35 and IHP2011

    • Author(s)
      K.Kanaori, et al
    • Journal Title

      Biochim.Biophys.Acta-Bioenergetics

      Volume: 1807 Pages: 1253-1261

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2011.06.004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Post-translational His-Cys Cross Linkage Formation in Tyrosinase Induced by Copper(II)-Peroxo Species2011

    • Author(s)
      N.Fujieda, et al
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 133 Pages: 1180-1183

    • DOI

      10.1021/ja108280w

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Resonance Raman study on the oxygenated and the ferryl-oxo species of indoleamine 2,3-dioxygenase during catalytic turnover2011

    • Author(s)
      S.Yanagisawa, et al
    • Journal Title

      Faraday Disc.

      Volume: 148 Pages: 239-247

    • DOI

      10.1039/c004552g

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] チトクロムc酸化酵素におけるヘムα側鎖ヒドロキシファルネシルエチル基の共鳴ラマン線の帰属2012

    • Author(s)
      坂口美幸, 他
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学、神奈川県
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] フェムト秒レーザーを用いた高感度時間分解赤外分光装置の開発と蛋白質水溶液への応用2011

    • Author(s)
      久保稔, 他
    • Organizer
      日本分光学会年次講演会
    • Place of Presentation
      理化学研究所、神奈川県
    • Year and Date
      2011-12-02
  • [Presentation] Protein Dynamics of and Reaction Mechanism of Cytochrome c Oxidase as Studied with Resonance Raman Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Izumi Ishigami, et al
    • Organizer
      The 3rd Asian Spectroscopy Conference
    • Place of Presentation
      Xiamen University, China
    • Year and Date
      2011-11-30
  • [Presentation] Microsecond Protein Dynamics of Cytochrome c Oxidase as Studied with Resonance Raman Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Takashi Ogura, et al
    • Organizer
      The 3rd Asian Spectroscopy Conference
    • Place of Presentation
      Xiamen University, China(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] 水溶液中のタンパク質の高感度時間分解赤外分光測定2011

    • Author(s)
      久保稔, 他
    • Organizer
      第5回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、北海道
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] Structural analysis of FMN and iron-sulfur clusters of bovine heart NADH-ubiauinone oxidoreductase by resonance Raman spectroscopy2011

    • Author(s)
      Masahide Hikita, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] ヘム鉄の電子密度がミオグロビンの自動酸化反応に与える影響の解明2011

    • Author(s)
      西村龍, 他
    • Organizer
      錯体化学会第61回討論会
    • Place of Presentation
      岡山理科大学、岡山県
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] Resonance Raman Study on Cytochrome c Oxidase Reconstituted in Phospholipid Vesicles2011

    • Author(s)
      Takashi Nomura, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] Protein Dynamics and Reaction Mechanism of Cytochrome c Oxidase : Resonance Raman Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Izumi Ishigami, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] The chemical nature of the ligand at the oxygen reduction site of the resting oxidized cytochrome c oxidase2011

    • Author(s)
      Miyuki Sakaguchi, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] Protein Dynamics of Cytochrome c Oxidase upon CN^- Photolysis as Studied with Resonance Raman Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Takeshi Nishigaki, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] Resonance Raman study on the ferryl oxo hemes with imidazole as axilal ligand having a bulky substituent2011

    • Author(s)
      Hirohito Ishimaru, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] Resonance Raman Study on Ligand-Bound Forms of Indoleamine 2,3-Dioxygenase2011

    • Author(s)
      Masayuki Hara, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] Resonance Raman Study on CO-bound Indoleamine 2,3-Dioxygenase with Tryptophan2011

    • Author(s)
      Sachiko Yanagisawa, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学、兵庫県
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] 共鳴ラマン分光法によるウシ心筋NADH-ユビキノン酸化還元酵素のFMNとFe-Sクラスターの構造解析2011

    • Author(s)
      引田理英, 他
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城県
    • Year and Date
      2011-06-24
  • [Presentation] 共鳴ラマン分光法によるインドールアミン2,3ジオキシゲナーゼの光学異性依存的基質相互作用の検出2011

    • Author(s)
      柳澤幸子, 他
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城県
    • Year and Date
      2011-06-24
  • [Presentation] チトクロム酸化酵素のリガンド解離構造ダイナミクス:新規高精度時間分解赤外分光装置を用いた追跡2011

    • Author(s)
      中島聡, 他
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城県
    • Year and Date
      2011-06-24
  • [Presentation] CO光解離をトリガーとしたチトクロムc酸化酵素の構造ダイナミクスの追跡2011

    • Author(s)
      石上泉, 他
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城県
    • Year and Date
      2011-06-24
  • [Presentation] ミオグロビンの機能調節機構の解明2011

    • Author(s)
      西村龍, 他
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城県
    • Year and Date
      2011-06-23
  • [Presentation] Resonance Raman study on CO-bound indoleamine 2,3-dioxygenase2011

    • Author(s)
      Takashi Ogura
    • Organizer
      The 3rd Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Stockey Centre, Parry Sound, Ontario, Canada(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-01
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sci.u-hyogo.ac.jp/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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