2010 Fiscal Year Annual Research Report
細菌における蛋白質合成異常回避システム
Publicly Offered Research
| Project Area | Protein community: organization and maintenance of protein functions |
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| Project/Area Number |
22020001
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| Research Institution | Hirosaki University |
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Principal Investigator |
姫野 俵太 弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (80208785)
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| Keywords | tmRNA / trans-translation / ribosome / translation / SmpB / translation |
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| Research Abstract |
トランス・トランスレーションは、tmRNAと呼ばれる低分子RNAが情報分子mRNAと情報を読み取る分子tRNAの両方の機能を果たすことで異常mRNAから翻訳を引き継ぎ、結果として2本の情報分子から1本のキメラペプチドを合成する変則的翻訳であり、細胞においては「何らかの原因で滞った翻訳を解消し、そこから生じる異常タンパク質を処理する、真正細菌に特異的な細胞秩序維持システム」と理解される。本研究では、トランス・トランスレーションがmRNA上のどの位置でおこるのか、どのようなときに起こるのか、どうしてこの位置で起こるのか、という点について明らかにしていくことで、多彩な細胞機能との関係を明らかにすることを目的とした。
tmRNA結合タンパク質SmpBの点変異体および欠質変異体を多数作成し(本年度は特にmRNAを擬態すると考えられるC末端領域に焦点をあてた)、トランス・トランスレーションの各ステップにおける変異の効果を明らかにした。
ペプチジルtRNAからAla-tmRNAへのペプチド転移を指標にして、トランス・トランスレーションのターゲットとして好まれるmRNAの長さを調べたところ、decoding center下流の長さは短いものほど好まれる傾向にあった。また、decqding center下流の長さは、EF-TuによるGTPの加水分解活性には影響がなかった。
クロスリンク法を用いて、トランス・トランスレーションの各ステップにおけるリボソームタンパク質とSmpBの相互作用について解析した。その結果、mRNAの入り口にあるリボソームタンパク質とSmpBのC末端がクロスリンクすることが明らかになった。
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Research Products
(18 results)
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[Journal Article] A small nucleolar RNA functions in rRNA processing in C.elegans2010
Author(s)
Hokii, Y., Sasano, Y., Sato, M., Sakamoto, H., Sakata, K., Shingai, R., Taneda, A., Oka, S., Himeno, H., Muto, A., Fujiwara, T., Ushida, C.
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Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 38
Pages: 5909-5918
Peer Reviewed
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[Presentation] The mutation of the C.elegans genomic locus encoding a snoRNA has a defect in the pre-rRNA processing2010
Author(s)
Ushida, C., Hokii, Y., Sasano, Y., Sato, M., Sakamoto, H., Himeno, H., Muto, A., Fujiwara, T.
Organizer
Fifteenth Annual Meeting of the RNA Society
Place of Presentation
Seattle
Year and Date
20100614-20100618
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[Presentation] Structural studies for RsgA/YjeQ, a ribosome maturation factor2010
Author(s)
Takemoto, C., Connell, S.R., Hase, Y., Naoe, C., Wang, H., Kaminishi, T., Kikuchi, T., Hirata, Y., Kurita, D., Muto, A., Muto, Y., Yokoyama, S., Himeno, H.
Organizer
Ribosomes 2010 Meeting
Place of Presentation
Orvieto, Italy
Year and Date
20100503-20100507
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