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2011 Fiscal Year Annual Research Report

変性タンパク質の動的多様構造の新規解析法の開発

Publicly Offered Research

Project AreaTarget recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
Project/Area Number 22113501
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

鎌形 清人  東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (90432492)

Keywords天然変性タンパク質 / チトクロムc / 一分子蛍光観察 / p53 / 原子間力顕微鏡
Research Abstract

本研究は、一分子レベルで変性タンパク質の主鎖の形とダイナミクスを観測する手法の開発を通して、変性タンパク質の動的な構造多様性を明らかにすることを目的とした。昨年度に引き続き、鎌形らが開発した一分子蛍光装置を用いて、変性剤で変性させたチトクロムcの構造とダイナミクスの観測を行った。3つの変性剤濃度条件で蛍光色素Atto532を修飾したチトクロムcの一分子計測を行った結果、少なくとも3つの状態が存在し、観測頻度の多い2つの状態が顕著に変性剤濃度依存性を示した。そのうち、蛍光強度の弱い状態は変性剤の増加ともに観測頻度が減ることから、特定の部分構造を持つと推測された。一方、蛍光強度が強い状態は、変性剤の増加とともに観測頻度が増えることから、ほどけた構造を持つと考えられた。次に、蛍光強度の消光を引き起こす因子を特定するために、ヘムを除去した変異体で一分子測定を行った。その結果、ヘムだけでなく、トリプトファンなどのアミノ酸によっても、消光が起こることが明らかになった。以上から、変性チトクロムcは、少なくとも3つの状態に分類され、その構造的な特徴を明らかにすることに成功した。次に、原子間力顕微鏡と走査型トンネル顕微鏡を用いて、がん抑制因子であるp53の一分子構造解析を行った。原子間力顕微鏡に用いて、金基板上に固定したp53分子の画像データを取得し、解析を行ったところ、様々な会合体が観測された。生理的な条件下で存在する4量体に着目したところ、多様な構造をとることが明らかになった。今後、様々な条件下でデータを取得することで、p53の機能の解明への展開が期待される。

  • Research Products

    (28 results)

All 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (25 results)

  • [Journal Article] 新技術によるタンパク質研究の新展開2012

    • Author(s)
      鎌形清人
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 52 Pages: 104-105

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Staring at a Protein : Ensemble and Single Molecule Investigations on Protein Folding Dynamics2012

    • Author(s)
      Takahashi, S., Kamagata, K.
    • Journal Title

      Single-Molecule Biophysics : Experiment and Theory in Adv.Chem.Phys

      Volume: 146 Pages: 3-22

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 一分子蛍光観察法を用いたタンパク質フォールディングの解明2011

    • Author(s)
      小井川浩之、鎌形清人、高橋聡
    • Journal Title

      高分子

      Volume: 60 Pages: 801-803

  • [Presentation] Folding dynamics of cytochrome c551 studied by long time observation of fluorescence time series from single molecules2012

    • Author(s)
      Toshifumi Kawaguchi, Kiyoto Kamagata, Hiroyuki Oikawa, Yoshihiro Sambongi, Satsohi Takahashi
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20120325-20120328
  • [Presentation] Exploring The Energy Landscape of Denatured Protein Using Time-series Detection of Fluorescence of Free Single Molecules2012

    • Author(s)
      Kiyoto Kamagata, Toshifumi Kawaguchi, Akinori Baba, Yoshihiro Sambongi, Tamiki Komatsuzaki, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      International Symposium on Innovative Nanobiodevices ISIN 2012
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20120321-20120322
  • [Presentation] 蛋白質一分子の構造ダイナミクス解析2012

    • Author(s)
      鎌形清人
    • Organizer
      「水和とATP」サテライトミーティング蛋白質折り畳みの理解に向けた一分子基礎科学を目指して
    • Place of Presentation
      仙台(招待講演)
    • Year and Date
      20120310-20120312
  • [Presentation] 新規一分子FRET計測技術によるABCトランスポーターのATP加水分解機構の解析2012

    • Author(s)
      中野駿介, 七谷圭, 古田忠臣, 櫻井実, 魚住信之, 高橋聡, 鎌形清人
    • Organizer
      新学術領域研究「水を主役としたATPエネルギー変換」
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20120307-20120309
  • [Presentation] 変性タンパク質の動的多様構造の新規一分子解析法の開発2012

    • Author(s)
      鎌形清人
    • Organizer
      新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識と機能発現」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪(招待講演)
    • Year and Date
      20120124-20120125
  • [Presentation] 走査プローブ顕微鏡による癌抑制因子p53の一分子解析2012

    • Author(s)
      高橋聖弥, 道祖尾恭之, 鹿島理沙, 時野隆至, 米田忠弘, 高橋聡, 鎌形清人
    • Organizer
      新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識と機能発現」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20120124-20120125
  • [Presentation] Single-molecule diffusion mesurement of a GroEL-binding peptide2012

    • Author(s)
      Suguru Watanabe, Shion Ando, Kiyoto Kamagata, Hideki Taguchi, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      奈良
    • Year and Date
      20120107-20120108
  • [Presentation] Single-molecule dynamics of MsbA, a member ofABC transporter2012

    • Author(s)
      Shunsuke Nakano, Kei Nanatani, Kiyoto kamagata, Nobuyuki Uozumi, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      奈良
    • Year and Date
      20120107-20120108
  • [Presentation] Microsecond-Resolved Time Traces of Protein Conformational Changes by Single-Molecule Fluorescence Detection2012

    • Author(s)
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Issei Iijima, Takahiro Hohsaka, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      奈良
    • Year and Date
      20120107-20120108
  • [Presentation] 大腸菌トランスポーターMsbAの一分子計測2011

    • Author(s)
      中野駿介、七谷圭、鎌形清人、魚住信之、高橋聡
    • Organizer
      第37回日本生体エネルギー研究会シンポジウム生体エネルギー論の再発見
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20111220-20111222
  • [Presentation] 新規一分子蛍光観測法による蛋白質の折り畳みのエネルギー地形の解明2011

    • Author(s)
      鎌形清人、馬場昭典、小松崎民樹、高橋聡
    • Organizer
      CREST「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」研究領域シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20111212-20111213
  • [Presentation] タンパク質フォールディングと一分子時系列解析2011

    • Author(s)
      鎌形清人、高橋聡
    • Organizer
      蛋白研セミナー「タンパク質科学の未来を語る~実験・理論研究者の対話~」
    • Place of Presentation
      大阪(招待講演)
    • Year and Date
      20111120-20111121
  • [Presentation] Imaging and tracking of single BLG molecules in solution2011

    • Author(s)
      Sion Ando, Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Kazumasa Sakurai, Yuji Goto, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      姫路
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Microsecond-resolved time traces of protein conformational change by single-molecule fluorescence detection2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Issei Iijima, Takahiro Hohsaka, Yoshihiro Sambongi, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      姫路(招待講演)
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Additives inhibiting the bleaching of fluorophores for the oong-time fluorescence observation of single proteins2011

    • Author(s)
      Hironao Itabashi, Eriko Mano, Hiroyuki Oikawa, Yasuyuki Araki, Kiyoto Kamagata, Takehiko Wada, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      姫路
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Energy landscape of denatured protein revealed by a new singe-molecule fluorescence method2011

    • Author(s)
      Kiyoto Kamagata, Toshifumi Kawaguchi, Akinori Baba, Yoshihiro Sambongi, Tamiki Komatsuzaki, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      姫路
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Submillisecond dynamics of protein folding and ligand binding detected by the line conforcal microscopy2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Issei Iijima, Takahiro Hosaka, Yoshihiro Sambongi, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      姫路
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Imaging and tracking of single BLG molecules in solution2011

    • Author(s)
      Shion Ando, Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Kazumasa Sakurai, Yuji Goto, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      グローバルCOEサマースクールシンポジウム(iremc分子系高次構造体化学国際教育研究拠点)
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20110818-20110919
  • [Presentation] Single-Molecule Dynamics of MsbA, a member of ABC transporter2011

    • Author(s)
      Shunsuke Nakano, Kei Nanatani, Kiyorto Kamagata, Nobuyuki Uozumi, Satoshi Takahashi
    • Organizer
      グローバルCOEサマースクールシンポジウム(iremc分子系高次構造体化学国際教育研究拠点)
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20110818-20110819
  • [Presentation] 変性タンパク質の動的多様性の新規解析法の開発2011

    • Author(s)
      鎌形清人
    • Organizer
      天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現第2回領域会議
    • Place of Presentation
      宮崎(招待講演)
    • Year and Date
      20110629-20110701
  • [Presentation] マイクロ秒分解一分子蛍光検出による蛋白質構造変化の追跡2011

    • Author(s)
      小井川浩之、鎌形清人、飯島一生、芳坂貴弘、高橋聡
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波
    • Year and Date
      20110623-20110624
  • [Presentation] Exploration of energy landscape of protein folding using a novel single-molecule fluorescence method2011

    • Author(s)
      Kiyoto Kamagata
    • Organizer
      The Complexity of Dynamics and Kinetics in Many Dimensions
    • Place of Presentation
      Telluride USA(招待講演)
    • Year and Date
      20110620-20110624
  • [Presentation] 新規一分子蛍光観測法による蛋白質の自由エネルギー地形の解析2011

    • Author(s)
      鎌形清人、川口敏史、馬場昭典、三本木至宏、小松崎民樹、高橋聡
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      大阪(招待講演)
    • Year and Date
      20110607-20110609
  • [Presentation] マイクロ秒分解一分子蛍光検出による蛋白質構造変化の追跡2011

    • Author(s)
      小井川浩之、鎌形清人、飯島一生、芳坂貴弘、高橋聡
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20110607-20110609
  • [Presentation] マイクロ秒分解一分子蛍光検出による蛋白質構造変化の追跡2011

    • Author(s)
      小井川浩之、鎌形清人、飯島一生、芳坂貴弘、高橋聡
    • Organizer
      第11回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2011-12-08

URL: 

Published: 2013-06-26  

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