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2011 Fiscal Year Annual Research Report

Secトランスロコンを含む過渡的複合体の構造生物学

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative understanding of biological processes mediated by transient macromolecular complexes; New technology for visualizing physiologically metastable states.
Project/Area Number 22121503
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

塚崎 智也  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (80436716)

Keywords蛋白質 / 過渡的複合体 / トランスロコン / 膜透過 / 膜組み込み / Sec / 構造解析 / 構造生物学
Research Abstract

Secトランスロコン(protein-conducting-channel)を介したタンパク質の膜透過,膜組込みはすべての生物に共通した必須の細胞機能である。大腸菌などの真正細菌では膜タンパク質SecYEG複合体がSecトランスロコンを構成しているが,Secトランスロコンは単独では機能しない。実際にタンパク質が膜透過,膜組み込みする際には,SecA(タンパク質の膜透過駆動モーター),SecDF(Secトランスロコンによる膜透過の促進),YidC(トランスロコンと共に膜組込みに関与),ribosome等と過渡的な複合体を形成し,大きな構造変化を伴っている。これらの各構成因子の立体構造情報は得られつつあるが,未だSecトランスロコンを含む超分子複合体の形成状態や作動メカニズムについて依然不明な点が多い。本研究ではSecDFに着目し、SecDF膜タンパク質の構造の精密化を進め,最終的に3.3Å分解能で構造を決定した。構造から推測されたSecDFの機能[(1)SecDFの第一ペリプラズム領域がヒンジ様の動きで構造変化すること,(2)SecDFの膜貫通領域がプロトントランスポーターとして機能する]を,in vivo,in vitroの生化学的解析によって立証し,「SecDFはproton-motive forceによってダイナミックな構造変化を繰り返しながら,ペリプラズム側で膜透過基質蛋白質と相互作用し,膜透過の高効率化に寄与する膜内在性シャペロンである」とのモデルを論文で報告した。

  • Research Products

    (10 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel2012

    • Author(s)
      加藤英明, 他14名
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 482 Pages: 369-374

    • DOI

      10.1038/nature10870

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export2011

    • Author(s)
      塚崎智也, 他11名
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 474 Pages: 235-238

    • DOI

      10.1038/nature09980

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction of the first periplasmic domain of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus2011

    • Author(s)
      越前友香, 他3名
    • Journal Title

      Acta.Crystallograph.Sect.F Struct.Biol.Cryst.Commun.

      Volume: 67 Pages: 1367-1370

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The mechanism of protein export enhancement by the SecDF membrane component2011

    • Author(s)
      塚崎智也, 濡木理
    • Journal Title

      BIOPHYSICS

      Volume: 7 Pages: 129-133

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Secトランスロコンと共に機能するSecDF膜タンパク質の構造2011

    • Author(s)
      塚崎智也
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 51 Pages: 236-237

  • [Journal Article] タンパク質を膜透過させる分子装置2011

    • Author(s)
      塚崎智也, 濡木理
    • Journal Title

      化学工業

      Volume: 62 Pages: 471-477

  • [Presentation] Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export2012

    • Author(s)
      塚崎智也
    • Organizer
      Gordon Conference on Protein Transport Across Cell Membranes
    • Place of Presentation
      ホテルガルベス(テキサス州アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2012-03-12
  • [Presentation] タンパク質の膜透過を促進する膜タンパク質SecDFの構造と機能2011

    • Author(s)
      塚崎智也
    • Organizer
      「過渡的複合体」公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学薬学部(東京都)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-21
  • [Remarks]

    • URL

      http://first.lifesciencedb.jp/archives/2915

  • [Remarks]

    • URL

      http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2011/10.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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