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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of the hydration state that changes the structure and interaction of biomolecules

Publicly Offered Research

Project AreaAquatic Functional Materials: Creation of New Materials Science for Environment-Friendly and Active Functions
Project/Area Number 22H04561
Research InstitutionTokyo University of Pharmacy and Life Science

Principal Investigator

藤田 恭子  東京薬科大学, 薬学部, 講師 (90447508)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Keywords水和状態 / イオン構造 / 生体分子
Outline of Annual Research Achievements

本年度は単離した膜貫通型αヘリックスタンパク質をターゲットとして、水和イオン液体中への溶解と溶解後の構造、安定性について解析を行った。溶解後の膜タンパク質の二次構造に影響を及ぼすイオン構造の共通性について基礎知見を集積した。イオン構造を選択することで水溶液中と同様の二次構造を保持した溶解が可能であることを確認した。含水率を変化させてながら解析を行うことで、二次構造が変化する含水率域の存在を確認した。光駆動型膜タンパク質であるバクテリオロドプシンを用いた検討では、二次構造だけでなくタンパク質内部に位置する発色団レチナールが水溶液中と同様の状況で存在しており、光照射に伴うプロトンポンプ輸送に伴う構造変化も水和イオン液体中でも観測された。水和イオン液体中に溶解後、検討を行った膜貫通型αヘリックスタンパク質の変性温度は水中に比べて20℃以上向上することを確認した。
また領域内共同研究を進め、各種分光法やシミュレーションを用いて水和イオン液体中の水分子について解析を行った。分子間振動バンドをプローブとするフェムト秒ラマン誘起カー効果分光により、濃度の異なる水和イオン液体の低振動数スペクトルを測定し分子間振動バンドの評価を行い、カオトロピックとコスモトロピックなアニオンでは微視的な水和構造(第二、第三溶媒和圏)が異なることを明らかにした。得られた結果はJ. Phys. Chem. Bに掲載となった。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Low-Frequency Spectra of Hydrated Ionic Liquids with Kosmotropic and Chaotropic Anions2024

    • Author(s)
      Koyakkat Maharoof、Ishida Tateki、Fujita Kyoko、Shirota Hideaki
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 128 Pages: 4171~4182

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.4c01255

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hydrated Ionic Liquids: Perspective for Bioscience2023

    • Author(s)
      Fujita Kyoko、Ohno Hiroyuki
    • Journal Title

      The Chemical Record

      Volume: 23 Pages: e202200282

    • DOI

      10.1002/tcr.202200282

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Low-Frequency Spectrum in Hydrated Ionic Liquids Having Different Kosmotropicity: Water Concentration Dependence2024

    • Author(s)
      9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems Makuhari Messe, Chiba, Japan, 12th Aug 2023-18th Aug 2023, poster Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • Organizer
      17th DAE-BRNS Biennial Trombay Symposium on Radiation and Photochemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Improved renaturation process of aggregated recombinant proteins through the design of hydrated ionic liquids2023

    • Author(s)
      Kyoko Fujita, Kazune Kobayashi, Anna Ito, Shun Yanagisawa, Kimiyoshi Ichida, Kouta Takeda, Nobuhumi Nakamura, Hiroyuki Ohno
    • Organizer
      Improved renaturation process of aggregated recombinant proteins through the design of hydrated ionic liquids, 9th Congress on Ionic Liquids
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Low-Frequency Spectra of Hydrated Ionic Liquids Having Different Kosmotropicity2023

    • Author(s)
      Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • Organizer
      9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex System
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] バイオサイエンス分野における水和イオン液体の可能性2023

    • Author(s)
      藤田恭子
    • Organizer
      日本薬剤学会第38年会
    • Invited
  • [Presentation] Solubility and Structural Changes of Biomolecules as a Function of Water Content in Hydrated Ionic Liquids2023

    • Author(s)
      Kyoko Fujita
    • Organizer
      第61回生物物理学会
    • Invited
  • [Presentation] Water Concentration Dependence of Low-Frequency Spectrum in Hydrated Ionic Liquids Having Different Kosmotropicity2023

    • Author(s)
      Maharoof Koyakkat, Kyoko Fujita, Hideaki Shirota
    • Organizer
      The 17th annual Meeting of Japan Society for Molecular Science
  • [Presentation] 水和イオン液体中におけるDNAアプタマーと標的分子の結合検出2023

    • Author(s)
      藤田 恭子、筑肱 秀紀、稲葉 真太朗、池袋 一典
    • Organizer
      電気化学会第91回大会
  • [Presentation] 水和イオン液体中におけるDNAアプタマーと標的分子の結合解析2023

    • Author(s)
      筑肱 秀紀、稲葉 真太朗、誉田 拓也、塚越 かおり、大野 弘幸、池袋 一典
    • Organizer
      日本薬学会第144年会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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