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2023 Fiscal Year Annual Research Report

第2のマクロオートファジーGOMEDの生体での役割

Publicly Offered Research

Project AreaMultimode autophagy: Diverse pathways and selectivity
Project/Area Number 22H04639
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

清水 重臣  東京医科歯科大学, 高等研究院, 特別教授 (70271020)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
KeywordsGOMED / ゴルジ体
Outline of Annual Research Achievements

一般的マクロオートファジーは、細胞質の変性タンパク質や傷害オルガネラなどを、膜で包み込んで分解する機構であり、Atg5やAtg7などの分子を用い、小胞体膜を主な起源とする。一方、GOMEDは、同じように膜で包み込んで細胞内成分を分解する機構であるが、Atg5/Atg7に依存せず、ゴルジ体膜を起源とする。このため、第2のマクロオートファジーとも称すべき機構である。しかしながら、オートファジーとGOMEDは、分解する基質タンパク質が大きく異なっており、異なる細胞機能である。
本年は、GOMED関連分子として、Wipi3と結合する分子を探索した。その結果、新たなGOMED実行分子としてゴルジ体局在分子2種類を同定した。また、このうち1種類はBARドメインを有するタンパク質で、生体膜の曲率を変える機能を有する分子であった。
また、GOMEDの定量法としてこれまでに、リソソームの肥大化、GFP-RFP tandemタンパク質の赤色蛍光の定量、電子顕微鏡解析などの方法を用いてきた。より正確に定量解析を行うために新たなGOMED解析法としてDAL/DAP法を開発した。すなわち、1、DAPGreenはGOMEDの最初期から全ての構造を緑色蛍光で標識すること、2、DAPRedは中期のステージ以降の構造を赤色蛍光で標識すること、3、DALGreenは後期の構造のみを緑色蛍光で標識することを応用して、GOMEDの進行度をダナミックに計測できる系を確立した。
さらに、昨年度より皮膚特異的GOMED欠損マウス、神経特異的GOMED欠損マウスの表現系を解析した他、病理所見等も解析し、GOMEDの整体での重要性を確認した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2023 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Identification of a novel type of focal adhesion remodelling via FAK/FRNK replacement, and its contribution to cancer progression2023

    • Author(s)
      Tsujioka Masatsune、Miyazawa Keisuke、Ohmuraya Masaki、Nibe Yoichi、Shirokawa Tetsuya、Hayasaka Haruko、Mizushima Tsunekazu、Fukuma Takeshi、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Cell Death and Disease

      Volume: 14 Pages: 256

    • DOI

      10.1038/s41419-023-05774-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lactiplantibacillus plantarum OLL2712 Induces Autophagy via MYD88 and Strengthens Tight Junction Integrity to Promote the Barrier Function in Intestinal Epithelial Cells2023

    • Author(s)
      Watanabe-Yasuoka Yumiko、Gotou Ayako、Shimizu Shigeomi、Sashihara Toshihiro
    • Journal Title

      Nutrients

      Volume: 15 Pages: 2655~2655

    • DOI

      10.3390/nu15122655

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of small fluorescent probes for the analysis of autophagy kinetics2023

    • Author(s)
      Sakurai Hajime Tajima、Iwashita Hidefumi、Arakawa Satoko、Yikelamu Alifu、Kusaba Mizuki、Kofuji Satoshi、Nishina Hiroshi、Ishiyama Munetaka、Ueno Yuichiro、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Pages: 107218~107218

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.107218

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Involvement of casein kinase 1 epsilon/delta (Csnk1e/d) in the pathogenesis of familial Parkinson's disease caused by <scp>CHCHD2</scp>2023

    • Author(s)
      Torii Satoru、Arakawa Satoko、Sato Shigeto、Ishikawa Kei‐ichi、Taniguchi Daisuke、Sakurai Hajime Tajima、Honda Shinya、Hiraoka Yuuichi、Ono Masaya、Akamatsu Wado、Hattori Nobutaka、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      EMBO Molecular Medicine

      Volume: 15 Pages: e17451

    • DOI

      10.15252/emmm.202317451

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Beclin1 is essential for the pancreas development2023

    • Author(s)
      Mehanna Sally、Arakawa Satoko、Imasaka Mai、Chen Wenting、Nakanishi Yuto、Nishiura Hiroshi、Shimizu Shigeomi、Ohmuraya Masaki
    • Journal Title

      Developmental Biology

      Volume: 504 Pages: 113~119

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2023.09.008

    • Peer Reviewed
  • [Remarks] 病態細胞生物ホームページ

    • URL

      https://www.tmd.ac.jp/mri/pcb/index.html

URL: 

Published: 2024-12-25  

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