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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanisms of transcriptional regulation underlying periodicity and modulation in cell proliferation during plant development

Publicly Offered Research

Project AreaIntrinsic periodicity of cellular systems and its modulation as the driving force behind plant development
Project/Area Number 22H04714
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

伊藤 正樹  金沢大学, 生命理工学系, 教授 (10242851)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Keywords細胞周期 / 細胞増殖 / 転写制御 / シロイヌナズナ
Outline of Annual Research Achievements

DREAM complexはE2FとMYB3Rなどの細胞周期制御に重要な転写因子を含む複合体であり、広範囲の細胞周期遺伝子の転写を制御している。DREAM構成因子の1つをコードするTCXファミリーには、気孔系譜細胞に特異的なSOL1とSOL2が存在しており、二重変異体は気孔系譜細胞の過剰な分裂による気孔の発生異常が生じることを既に明らかにしている。TAP tagを利用したタンパク質複合体解析からは、SOL1はE2FおよびDPファミリータンパク質と相互作用していることが示唆された。また、e2fの変異がsol1 sol2二重変異体の異常を抑圧する効果があることが分かった。R2R3型Myb転写因子をコードするFLPの変異はsol1 sol2と同様の表現型を示すことなどから、同一の経路で機能していることが示唆されている。e2f変異はflp変異体に対しても抑圧効果を示すこと、FLP過剰発現による気孔系譜細胞の分裂抑制を強く促進することが分かった。このような結果から、FLP、SOL1/2およびE2Fの三者が密接に関わり、SOL1/2とE2Fの物理的な相互作用が関与する転写制御系が存在し、気孔系譜細胞の細胞周期を制御しているものと予想された。

細胞サイズ制御因子SCL28については、免疫沈降と質量分析による解析を行った結果、AtSOMS1に加えて、新たな相互作用因子として新規GRAS転写因子を同定した。このGRAS転写因子は2つのよく似た遺伝子にコードされており、二重変異体ではscl28変異体と同様の細胞サイズの低下が観察される。scl28変異を組み合わせて解析したところ、根では単独変異と同じ表現型を示すが、葉では組み合わせにより表現型が強くなることが分かった。このようにSCL28は複数のタンパク質と相互作用しながら、組織特異的な仕組みで機能し細胞サイズを制御している可能性が示唆された。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Royal Holloway University of London(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Royal Holloway University of London
  • [Int'l Joint Research] University of Hamburg(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      University of Hamburg
  • [Int'l Joint Research] Biological Research Centre(ハンガリー)

    • Country Name
      HUNGARY
    • Counterpart Institution
      Biological Research Centre
  • [Int'l Joint Research] Institute of Plant Sciences Paris Saclay(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Institute of Plant Sciences Paris Saclay
  • [Journal Article] MYB3R-mediated and cell cycle-dependent transcriptional regulation of a tobacco ortholog of <i>SCARECROW-LIKE28</i> in synchronized cultures of BY-2 cells2023

    • Author(s)
      Mineta K, Hirota J, Yamada K, Itoh T, Chen P, Iwakawa H, Takatsuka H, Nomoto Y, Ito M
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 40 Pages: 353~359

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.23.0515a

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The canonical E2Fs together with RETINOBLASTOMA-RELATED are required to establish quiescence during plant development2023

    • Author(s)
      Gombos M, Raynaud C, Nomoto Y, Molnar E, Brik-Chaouche R, Takatsuka H, Zaki A, Bernula D, Latrasse D, Mineta K, Nagy F,He X, Iwakawa H, Oszi E, An J, Suzuki T, Papdi C, Bergis C, Benhamed M, Bogre L, Ito M, Magyar Z
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6 Pages: 903

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05259-2

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Jasmonates, gibberellins, and powdery mildew modify cell cycle progression and evoke differential spatiotemporal responses along the barley leaf2023

    • Author(s)
      Krasauskas J, Ganie SA, Al-Husari A, Bindschedler L, Spanu P, Ito M, Devoto A
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 75 Pages: 180~203

    • DOI

      10.1093/jxb/erad331

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ChIP-Seq およびRNA-Seqデータから DREAM複合体の転写制御機構を探る2024

    • Author(s)
      岩川秀和, 山本留衣, 野本友司, 鈴木孝征, 伊藤正樹
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 気孔形成において細胞分裂を制御するTCXファミリータンパク質による転写因子複合体の形成2024

    • Author(s)
      峯田敬斗, 岩川秀和, 西内巧, 伊藤正樹
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] シロイヌナズナの活性化型MYB3R転写因子は細胞質分裂の進行と植物のライフサイクルに不可欠である2024

    • Author(s)
      千賀理保子, 野本友司, 鈴木孝征, 伊藤正樹
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 気孔前駆細胞特異的なTCXファミリータンパク質による転写制御機構と細胞分裂における役割2023

    • Author(s)
      峯田敬斗, 野本友司, 岩川秀和, 西内巧, 鈴木孝征, 伊藤正樹
    • Organizer
      北陸植物学会2023年度大会
  • [Presentation] The Arabidopsis KNO1 protein targets RMI1 for autophagic degradation promoting homologous recombination upon DNA damage2023

    • Author(s)
      Chen P, Schnittger A, De Winne N, De Jaeger G, Ito M, Heese M
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2023 Symposium (TJPB2023)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Control of cell division for stomatal formation requires transcriptional regulation by stomatal lineage-specific TCX family proteins2023

    • Author(s)
      Mineta K, Nomoto K, Iwakawa H, Suzuki T, Nishiuchi T, Ito M
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2023 Symposium (TJPB2023)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Developmental repression of cell cycle through the action of DREAM complex containing both E2F and MYB3R transcription factors2023

    • Author(s)
      Masaki Ito
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2023 Symposium (TJPB2023)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Expanding roles of transcriptional regulation during the plant cell cycle2023

    • Author(s)
      Masaki Ito
    • Organizer
      Sustainable Enhancement of Plant Productivity with Precision
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A GRAS family transcription factor, SCARECROW-LIKE28, regulates cell size by inhibiting G2 progression in Arabidopsis2023

    • Author(s)
      Nomoto Y, Takatsuka H, Yamada K, Mineta K, Chen P, Iwakawa H, Nishiuchi T, Ito M
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] KNO1-mediated autophagic degradation of the Bloom syndrome complex component RMI1 promotes homologous recombination2023

    • Author(s)
      Chen P, Schnittger A, De Winne N, De Jaeger G, Ito M, Heese M
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 気孔前駆細胞特異的なTCXファミリータンパク質による転写制御機構と細胞分裂における役割2023

    • Author(s)
      峯田敬斗, 岩川秀和, 野本友司, 西内巧, 鈴木孝征, 伊藤正樹
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
  • [Remarks] 植物発生生物学研究室ウェブサイト

    • URL

      http://bio.w3.kanazawa-u.ac.jp/bio-s/plantdev/

  • [Remarks] Science Japan

    • URL

      https://sj.jst.go.jp/news/202206/n0623-03k.html

URL: 

Published: 2024-12-25  

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