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2023 Fiscal Year Annual Research Report

二元機能性青色光受容タンパク質の光応答機構

Publicly Offered Research

Project AreaNon-equilibrium-state molecular movies and their applications
Project/Area Number 22H04751
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山元 淳平  大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 准教授 (90571084)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Keywords時分割構造解析 / クリプトクロム / 光応答反応 / DNA修復
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、DNA修復を担う光回復酵素と概日リズム形成に関与するクリプトクロムの機能を単一の酵素で成し遂げる二元機能性動物類縁型クリプトクロムに注目し、その光応答分子機構を明らかにすることを目的に研究を行なった。クラミドモナス由来クリプトクロム(CraCRY)の二元機能性がどのように調整されているか調べるため、二電子還元型FADH-の熱力学的および速度論的安定性を評価したところ、DNA修復活性を向上させることが知られている集光アンテナ分子の結合の有無に依存してCraCRYにおけるFADH-の安定性が著しく異なることを明らかにした。
CraCRYによるDNA修復能を評価するため、兵庫県立大学・久保稔教授との共同研究を行ったところ、これまで研究されてきた他の生物種由来の光回復酵素とは異なる機構でDNA修復反応が進行する可能性が示唆された。
また、CraCRYのクリプトクロムとしての構造活性相関を調べるため、CraCRYタンパク質微結晶を用いた時分割シリアルフェムト秒X線結晶構造解析(TR-SFX)実験を行った。その結果、光受容中心であるFADからタンパク質C末端にかけて逐次的に構造変化する様子が観測された。10ナノ秒から数マイクロ秒にかけてFADのN5位近傍に存在するアスパラギンが回転し、それに伴い過渡的にFAD結合部位の近傍の溶媒露出部位が構造変化した。50ミリ秒程度でこの状態が暗状態へと回帰し、それに伴いFADの酸化還元状態が変化することから、この部位における過渡的な構造変化がFADプロトン化に関与することを明らかにした。さらに、測定開始点である10ナノ秒から200ミリ秒にかけてC末端アルファヘリックスが大きく構造変化することがわかった。本結果は現在論文にまとめているところである。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2023 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] フィリップ大マールブルグ(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      フィリップ大マールブルグ
  • [Int'l Joint Research] 台湾・台湾大学/台湾・中央研究院(その他の国・地域)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      台湾・台湾大学/台湾・中央研究院
  • [Int'l Joint Research] ESRF(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      ESRF
  • [Journal Article] A deazariboflavin chromophore kinetically stabilizes reduced FAD state in a bifunctional cryptochrome2023

    • Author(s)
      Hosokawa Yuhei、Morita Hiroyoshi、Nakamura Mai、Yamamoto Junpei
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-023-43930-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Visualizing the DNA repair process by a photolyase at atomic resolution2023

    • Author(s)
      Maestre-Reyna Manuel、Wang Po-Hsun、Nango Eriko、Hosokawa Yuhei、他
    • Journal Title

      Science

      Volume: 382 Pages: -

    • DOI

      10.1126/science.add7795

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 二元機能性動物類縁型クリプトクロムの 光活性化過程の動的構造解析2023

    • Author(s)
      山元淳平
    • Organizer
      令和5年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 時分割X線結晶構造解析で捉えたDNA光回復酵素によるDNA修復過程2023

    • Author(s)
      山元淳平, Manuel Maestre-Reyna, 別所義隆, Lars-Oliver Essen, 蔡明道
    • Organizer
      第23回日本光生物学協会年会
    • Invited
  • [Presentation] 時分割シリアルフェムト秒X線結晶構造解析によるDNA光回復酵素の全修復過程の原子分解能観測2023

    • Author(s)
      山元淳平, Manuel Maestre-Reyna, 別所義隆, Lars-Oliver Essen, Ming-Daw Tsai
    • Organizer
      日本放射線影響学会第66回年次大会
    • Invited
  • [Presentation] Time-resolved serial femtosecond crystallography on animal-like cryptochrome from Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Yuhei Hosokawa, Mai Nakamura, Junpei Yamamoto, Manuel Maestre-Reyna
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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