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2023 Fiscal Year Annual Research Report

iBC法を用いたポストコッホ微生物集団の活写

Publicly Offered Research

Project AreaPost-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system
Project/Area Number 22H04889
Research InstitutionJikei University School of Medicine

Principal Investigator

杉本 真也  東京慈恵会医科大学, 医学部, 准教授 (60464393)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Keywordsバイオフィルム / 複合系 / 透明化 / イメージング / 細菌 / 真菌 / ライブセルイメージング / iCBiofilm
Outline of Annual Research Achievements

地球上の微生物の大部分は純粋培養が困難な難培養性の微生物であり、かつ、単細胞の状態ではなく、バイオフィルムのような集合体として存在することがわかってきた。しかし、分厚いバイオフィルムは屈折や散乱により光が深部まで到達しないため、従来の光学顕微鏡法では詳細な観察が困難であった。本研究では、独自に開発した瞬間バイオフィルム透明化法(iCB法からiCBiofilm法に改名)を用いて、試験管内および生体内において複数種の微生物が形成した複合バイオフィルムを観察し、任意の細胞の空間分布、細胞外マトリクス成分の局在、微生物間あるいは微生物-宿主間の相互作用などを明らかにすることを目的とした。

複数の細菌(黄色ブドウ球菌、表皮ブドウ球菌、腸球菌、枯草菌、緑膿菌、大腸菌、コレラ菌)および真菌(Candida albicans)を用いて単一菌種および複合菌種の分厚いバイオフィルムが形成される条件(菌種の組合せや培地組成など)を決定した。そして、これらのバイオフィルムを、iCBiofilm法を用いて顕微鏡観察し、内部の微生物や菌体外マトリクス成分の局在を明らかにした。また、これまで運動性のある細菌のバイオフィルムについての検討はこれまで不十分であったため、そのような細菌(大腸菌、緑膿菌、枯草菌など)のバイオフィルムのライブセルイメージングに向けた検討を行った。その結果、既存の透明化試薬が細菌の運動性を阻害することがわかったため、新たなライブセルイメージング用試薬の探索を実施し、いくつかの候補化合物を取得した。さらに、A01-竹下Gと連携して、糸状菌と緑膿菌によって形成される複合バイオフィルムの成熟過程のライブセルイメージングに成功した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Identification of lthB, a gene encoding a putative glycosyltransferase family 8 protein required for Leptothrix sheath formation2024

    • Author(s)
      Tatsuki Kunoh, Tatsuya Yamamoto, Erika Ono, Shinya Sugimoto, Minoru Takeda, Nobuhiko Nomura
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology

      Volume: 89 Pages: e0191922

    • DOI

      10.1128/aem.01919-22

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] バイオフィルム透明化法iCBiofilmの開発と透明化ライブセルイメージングへの応用2024

    • Author(s)
      杉本真也、金城雄樹
    • Journal Title

      東京慈恵会医科大学雑誌

      Volume: 138 Pages: 131-138

  • [Journal Article] バイオフィルムを数秒で透明化2023

    • Author(s)
      杉本真也
    • Journal Title

      光アライアンス

      Volume: 34 Pages: 26-29

  • [Journal Article] バイオフィルムの解析技術2023

    • Author(s)
      杉本真也
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 7 Pages: 713-17

  • [Journal Article] バイオフィルムにおける集団性と社会性ー形成メカニズムと表現型のゆらぎ2023

    • Author(s)
      杉本真也、尾花望
    • Journal Title

      生物の科学 遺伝

      Volume: 77 Pages: 428-435

  • [Presentation] バイオフィルムの透明化イメージングのすゝめ2023

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      第37回日本バイオフィルム学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 分子生物学と透視技術でバイオフィルムの形成原理と機能に迫る2023

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      第55回 ビブリオシンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] バイオフィルムを瞬時に透明にするiCBiofilm法の開発と応用2023

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      第72回 日本放線菌学会 学術講演会
    • Invited
  • [Presentation] バイオフィルムを透視する新技術で微生物のリアルな姿に迫る2023

    • Author(s)
      杉本真也、高谷直樹
    • Organizer
      日本科学振興協会年次大会2023「会いに行ける科学者フェス」
  • [Book] バイオフィルム革新的制御技術2023

    • Author(s)
      野村 暢彦 (著, 監修), 尾花 望 (著, 監修), 豊福 雅典 (著, 監修), 久能 樹 (監修)
    • Total Pages
      372
    • Publisher
      株式会社エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860438340
  • [Remarks] 東京慈恵会医科大学細菌学講座

    • URL

      http://square.umin.ac.jp/saikin/

  • [Remarks] 細菌学講座 東京慈恵会医科大学 基礎・臨床講座

    • URL

      http://www.jikei.ac.jp/academic/course/11_saikin.html

  • [Remarks] バイオフィルム研究センター 東京慈恵会医科大学 基礎・臨床講座

    • URL

      http://www.jikei.ac.jp/academic/course/77_biofilm.html

URL: 

Published: 2024-12-25  

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