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2012 Fiscal Year Annual Research Report

RNAサイレンシング機構からみたメリステムの解析

Publicly Offered Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 23012008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

渡邊 雄一郎  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (60183125)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
KeywordsマイクロRNA / tasiRNA / 人為的機能抑制 / RNA分解 / シロイヌナズナ / 組織特異的抑制 / 分裂組織
Research Abstract

miRNAやtasiRNAの合成・作用に関与するシロイヌナズナのRNA-dependent RNA polymerase 6(RDR6),ARGONAUTE 1(AGO1),DICER-LIKE PROTEIN 4(DCL4)遺伝子が、特に茎頂分裂組織、根端分裂組織、維管束系で強く発現していた。RNAサイレンシングで鍵となるRNA-induced silencing complex(RISC)のコア因子を構成するAGO1との結合タンパク質をMASS解析し、mRNAの3'-UTR配列と結合することが推測される因子候補があがった。その遺伝子は根端分裂組織、維管束系で強い発現、茎頂においては特有の発現を示す。
異所的に人為的な人工小分子RNAによる標的遺伝子の発現抑制を誘導する系を構築した。1つは葉肉細胞特異的なCAB3プロモーター下流に人工miRNAをデザインしていれた前駆体コンストラクトをつなぐものである。導入したシロイヌナズナのメリステムでは抑制効果による表現型は期待通りあらわれず初期発生への影響はない。一方で発生段階がすすんでから葉肉組織での発現が期待通り抑制された。エクソソームという3'-5'RNA分解酵素のサブユニットRPP44a遺伝子のT-DNA挿入変異株のホモ接合体は胚性致死となるが、今回構築した系では植物体はみかけ正常に発生がすすみ、種子もつけた。2つ目の系としてtasiRNAの一つTASIc前駆体RNAを改変し,二つの標的遺伝子を抑制する配列をタンデムに導入したものである。コンストラクトをシロイヌナズナに導入したところ、狙い通りにその2つの遺伝子発現の低下が確認され、機能破壊が行えることが明らかとなった。複数の冗長遺伝子の機能低減などを行う上で非常に利用価値のある系となった。
核から細胞質へと特異的にRNAを輸送する際に関わるTHO/TREX因子について解析したところ、特定のmiRNAがTHO/TREX因子に依存することが観察された。

  • Research Products

    (11 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Loss of XRN4 function can trigger cosuppression in a sequence-dependent manner.2013

    • Author(s)
      Hayashi, M., et al.,
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 53 Pages: 1310-1321

    • DOI

      doi:10.1093/pcp/pcs078

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Decapping proteins are involved in the accumulation of miRNA in Arabidopsis thaliana.2012

    • Author(s)
      Motomura, K., et al.,
    • Journal Title

      RNA Biology

      Volume: 9 Pages: 644-652

    • DOI

      doi:10.4161/rna.19877

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA processing bodies, peroxisomes, Golgi bodies, mitochondria, and endoplasmic reticulum tubule junctions frequently pause at cortical microtubules.2012

    • Author(s)
      Hamada, T., et al.,
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 53 Pages: 699-708

    • DOI

      doi:10.1093/pcp/pcs025

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ウイルス抵抗性機構としてのRNA exosomeの機能解析2013

    • Author(s)
      熊倉直祐
    • Organizer
      日本植物病理学会大会
    • Place of Presentation
      岐阜大学、岐阜市
    • Year and Date
      2013-03-29
  • [Presentation] Assessment of plant RNA exosome as a viral resistance factor2012

    • Author(s)
      Naoyoshi Kumakura
    • Organizer
      Frontiers in Plant RNA Research 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学(招待講演)
    • Year and Date
      2012-10-17
  • [Presentation] Construction of microRNA expression system independent of DCL12012

    • Author(s)
      Masayuki Tsuzuki
    • Organizer
      Frontiers in Plant RNA Research 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学(招待講演)
    • Year and Date
      2012-10-17
  • [Presentation] Assessment of plant RNA exosome as a viral resistance factor2012

    • Author(s)
      Naoyoshi Kumakura
    • Organizer
      The complex life of mRNA
    • Place of Presentation
      EMBL、ハイデルベルク、ドイツ(招待講演)
    • Year and Date
      2012-10-08
  • [Presentation] Assessment of RNA exosome as a viral resistance factor2012

    • Author(s)
      Naoyoshi Kumakura
    • Organizer
      The XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions
    • Place of Presentation
      国際交流会館、京都
    • Year and Date
      2012-08-29
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるDCL1に依存しないmicroRNAの発現系の構築2012

    • Author(s)
      都筑正行
    • Organizer
      日本植物細胞分子生物学会
    • Place of Presentation
      奈良先端科学技術大学院大学
    • Year and Date
      2012-08-05
  • [Remarks]

    • URL

      http://bio.c.u-tokyo.ac.jp/labs/watanabe/index.htm

  • [Remarks]

    • URL

      http://gpes.c.u-tokyo.ac.jp/faculty-staff/health-and-security/yuichiro-watanabe.html

URL: 

Published: 2014-07-16  

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