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2012 Fiscal Year Annual Research Report

1分子リフォールディング実験によるミオグロビンの天然ー変性状態の揺らぎの解析

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
Project/Area Number 23107711
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

川上 勝  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 准教授 (70452117)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Keywordsミオグロビン / 1分子測定 / メカニカルアンフォールディング / リフォールディング
Outline of Annual Research Achievements

24年度は、23年度に引き続き、ミオグロビンのホロ体に対し、1分子力学測定(メカニカルアンフォールディング)実験を行い、ミオグロビンをN末、C末方向から引っ張る事で、分子の力学安定性を調べ、さらに、メカニカルアンフォールディングがどの様に進行するかを調べた。300余りのアンフォールディングデータを調べた結果、ホロ体のミオグロビンは、張力に対し、まずその全体構造を30pN程度の張力までは保持し、その後、一斉に構造が壊れる、すなわちアンフォールディングピークが一度のみ出現する場合に加えて、第二、第三のアンフォールディングピークを伴う、すなわち構造は一度に全て壊れるのではなく、いくつかの中間体を経てメカニカルアンフォールディングが頻繁に起こる事を発見した。これらは、ミオグロビンのアンフォールディング経路が同時に複数存在することを示している。ミオグロビンがこのように複数の経路を取る事が出来る理由として、ミオグロビンの天然状態が、いくつかの準安定状態間を揺らいでおり、それぞれの状態に関して経路が決まっているためではないかと考えられる。さらには、この経路には、ヘムとの相互作用が大きく関わっている事が示唆される。
次にホロ体のメカニカルアンフォールディング実験を進展させ、グロビン鎖を引っ張って壊す事でヘムを一旦解離させ、張力を緩めて再びミオグロビンをリフォールディングさせるという実験を行う事で、ミオグロビンのアポ体のメカニカルアンフォールディング実験を実現した。その結果、アポ体のアンフォールディング経路はホロ体とは異なり、中間体を経ない、協同的なアンフォールディングのみであることを見出した。つまりヘムとの相互作用を失った状態の分子は、アンフォールディング中間体を経ずに壊れる事が分かり、上述の仮説を強く支持する結果が得られた。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2012

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Variation in the mechanical unfolding pathway of p53DBD induced by interaction with p53 N-terminal region or DNA2012

    • Author(s)
      Yukinori Taniguchi and Masaru Kawakami
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 7 Pages: e49003

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0049003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prying open single GroES ring complexes by force reveals co-operativity across domains.2012

    • Author(s)
      Akiko Ikeda-Kobayashi, Yukinori Taniguchi, David J. Brockwell, Emanuele Paci, Isao Sakane, Yasushi Kawata and Masaru Kawakami
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 102 Pages: 1961-1968

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2012.03.046

  • [Journal Article] Recent advances in single-molecule biophysics with the use of Atomic Force Microscopy2012

    • Author(s)
      Masaru Kawakami and Yukinori Taniguchi
    • Journal Title

      Advances in Chemical Physics

      Volume: 146 Pages: 89-132

    • DOI

      10.1002/9781118131374.ch5

  • [Journal Article] Mechanical Unfolding Studies of Protein Molecules2012

    • Author(s)
      Yukinori Taniguchi, Akiko Kobayashi and Masaru Kawakam
    • Journal Title

      BIOPHYSICS

      Volume: 8 Pages: 51-58

    • DOI

      10.2142/biophysics.8.51

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mechanical Unfolding Pathways of Holo-myoglobin Explored by AFM-based Single Molecule Force Spectroscopy2012

    • Author(s)
      Yoshida Aya and Masaru Kawakami
    • Organizer
      Indo-Japan Joint Workshop on “Recent Advances in Spectroscopy and Microscopy: Fundamentals and Applications to Materials and Biology”
    • Place of Presentation
      ハイデラバード、インド
    • Year and Date
      2012-11-20 – 2012-11-22
    • Invited
  • [Presentation] Mechanotransduction uncovered by single molecule force spectroscopy2012

    • Author(s)
      Masaru Kawakami
    • Organizer
      7th international Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology
    • Place of Presentation
      大津
    • Year and Date
      2012-10-30 – 2012-11-01
  • [Presentation] AFMを用いたホロミオグロビンの一分子力学計測によるアンフォールディング経路の探索2012

    • Author(s)
      吉田文、川上勝
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2012-09-22 – 2012-09-24
  • [Book] Single-Molecule Biophysics: Experiment and Theory, Volume 1462012

    • Author(s)
      T. Komatsuzaki, M. Kawakami, S. Takahashi, H. Yang , R. J. Silbey, S. A. Rice, A. R. Dinner
    • Total Pages
      300
    • Publisher
      John Wiley Sons Inc.

URL: 

Published: 2018-02-02  

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