• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Annual Research Report

リボソームの品質管理における機能不全RNAの認識メカニズム

Publicly Offered Research

Project AreaDiversity and asymmetry achieved by RNA program
Project/Area Number 23112710
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

北畠 真  京都大学, ウイルス研究所, 助教 (10321754)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Keywordsリボソーム
Outline of Annual Research Achievements

出芽酵母を用いて、機能不全リボソームRNAの品質管理の分子機構について研究を行った。以前の研究から、機能不全となる点変異を持つ25S rRNAに誘導される形でユビキチンがリボソームに結合することが、このRNAの選択的分解に明らかになることが明らかとなっており、本研究ではこの反応に関わるE3ユビキチンリガーゼMms1複合体を対象に詳細な解析を行った。
この複合体がユビキチンを結合させるリボソームたんぱく質の解析結果から、60Sと40Sのそれぞれのサブユニットが翻訳伸長過程で行う「ラチェットモーション」がMms1によるリボソームの認識に関与しているのではないかという示唆が得られた。そこでこのユビキチン化部位の近傍に位置する40S側のたんぱく質にMycタグを連続して付加し、E3リガーゼによるリボソームへの結合を阻害する状況を作りだすことを試みてみた。このようなリボソームを持つ出芽酵母において変異25S rRNAの分解速度を測定したところ、明らかに速度の低下がみられており、このことは(少なくとも一部の)変異リボソームの分解に40Sサブユニットとの結合が必要である、という仮説を支持している。ただしこの状況では分解速度は低下するが、Mms1欠損株のように完全に分解が停止するわけではないので、40Sサブユニットの協力を必要としない、別の過程での認識が働いている可能性も同時に示唆されている。
これまでにMms1経路によって分解されるとされる機能不全25S rRNAは4種類のみであり、その分解経路の一般性には検証の余地が残されていた。そこでこの点についても、合計47種類の変異25S rRNAを作成し、Mms1の基質になるかどうかを調べた。その結果少なくとも10種類の変異はリボソームの機能不全を引き起こし、Mms1による分解を誘導することが明らかになった。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2013 2012

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay.2012

    • Author(s)
      Kotaro Fujii, Makoto Kitabatake, Tomoko Sakata, Mutsuhito Ohno
    • Journal Title

      EMBO Journal

      Volume: 31(11) Pages: 2579-2589

    • DOI

      10.1038/emboj.2012.85.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 真核生物リボソームの品質管理2013

    • Author(s)
      北畠真
    • Organizer
      第2回リボソームミーティング
    • Place of Presentation
      東京農工大学農学部
    • Year and Date
      2013-03-28 – 2013-03-29
  • [Presentation] 真核生物リボソームの品質管理2012

    • Author(s)
      北畠真
    • Organizer
      第14回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学百周年記念会館川内萩ホール
    • Year and Date
      2012-07-18 – 2012-07-20
  • [Presentation] 機能不全リボソームRNAの分解においてたんぱく質分解経路の果たす役割2012

    • Author(s)
      北畠真
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場
    • Year and Date
      2012-06-20 – 2012-06-22
  • [Presentation] 40S Subunit Dissociation and Proteasome-dependent RNA Degradation in Nonfunctional 25S rRNA Decay2012

    • Author(s)
      Makoto Kitabatake
    • Organizer
      The 22nd CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II"
    • Place of Presentation
      Riken CDB, Kobe, JAPAN
    • Year and Date
      2012-06-11 – 2012-06-13
  • [Presentation] 40S Subunit Dissociation and Proteasome-dependent RNA Degradation in Nonfunctional 25S rRNA Decay2012

    • Author(s)
      Makoto Kitabatake
    • Organizer
      RNA2012
    • Place of Presentation
      Ann Arbor, Michigan, USA
    • Year and Date
      2012-05-29 – 2012-06-02

URL: 

Published: 2018-02-02  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi