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2011 Fiscal Year Annual Research Report

スプライシング/mRNA核外輸送装置によるクロマチンサイレンシングの多元的制御

Publicly Offered Research

Project AreaDiversity and asymmetry achieved by RNA program
Project/Area Number 23112716
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

谷 時雄  熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 教授 (80197516)

Keywordsスプライシング因子 / mRNA核外輸送 / ヘテロクロマチン / イントロン / セントロメア / 分裂酵母
Research Abstract

染色体のセントロメア領域は、分裂装置のスピンドルが結合する特殊なクロマチン領域で、分裂酵母では、その領域はセントロメア由来のnon-coding RNAから産生されたsiRNAが関わるRNAi機構を介してヘテロクロマチン化されている。我々は現在までの解析で、分裂酵母セントロメアのヘテロクロマチン形成にスプライシング因子Prp14pとmRNA核外輸送関連因子Ptr8pが必須であることを明らかにした。本研究では、セントロメアdg non-coding RNA内に見いだしたmRNA型イントロンと、ヘテロクロマチン形成に関わるsiRNA産生機構の関連を解明するため、イントロンを除いた変異型dg ncRNAを転写合成するminichromosome plasmidを作成して解析を行った。その結果、イントロンが無いと、minichromosomeにおけるヒストンH3K9のトリメチル化効率が有意に低下することを見いだし、スプライス部位の存在がヒストンのメチル化反応に影響を及ぼすことを明らかにした。また、dgイントロンのスプライシング効率を制御するシスシグナル配列が、イントロンの上流400塩基内に存在することを欠失変異解析により明らかにした。スプライシング効率を低下させて、RNAi関連因子結合の足場としてイントロンを機能させている可能性が考えられた。更に、セントロメアヘテロクロマチン形成にスプライシング因子が関わる機構が、生物種を越えて、ヒトなど高等生物においても保存されているか検証した。その結果、ヒト培養細胞において、siRNAでヒトPrp14相同因子をノックダウンすると、セントロメアとスピンドルの結合に異常が生じ、染色体分離が正常に進行しないことが判明した。高等動物においても、分裂酵母で観察されたスプライシング因子のセントロメアヘテロクロマチン形成への関与が考えられた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

in vitroアッセイ系の確立は、問題点が多く当初予定した程は進展しなかったが、ヒトやマウスなどの高等動物において、siRNAを用いたスプライシング因子のノックダウンで分裂酵母と同様に染色体分離異常が生じる発見は、今後の研究にとって大きな成果となった。さらに、セントロメア dg イントロンのスプライシング反応効率を制御するシスエレメント配列の存在を明らかにした点も、今後の研究展開にとって大きな前進であった。以上の結果から、(2)の区分と自己評価した。

Strategy for Future Research Activity

分裂酵母細胞抽出液を用いたsiRNA産生のin vitroアッセイ系確立は、残り1年間では大きな進展が見込めない可能性が高いので、高等生物におけるスプライシング因子と染色体セントロメアヘテロクロマチン形成の関連について、人的資源と労力を集中して解析を展開させる予定である。ヒトなどの高等生物において、セントロメアヘテロクロマチン形成にRNAiシステムやスプライシング因子が関わる機構については現在全く報告がなく、研究が進展すれば、RNA及びエピジェネテクス研究分野に対するオリジナリティの高い大きな貢献ができると考えている。

  • Research Products

    (26 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (20 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Diverse functions of nuclear non-coding RNAs in eukaryotic gene expression2012

    • Author(s)
      Madoka Chinen
    • Journal Title

      Frontiers in Bioscience

      Volume: 17 Pages: 1402-1417

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of the RNA-binding protein Nrd1 in stress granule formation and its implication in the stress response in fission yeast2012

    • Author(s)
      Ryosuke Satoh
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0029683

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of the ptr5^+ gene involved in nuclear mRNA export in fission yeast2012

    • Author(s)
      Nobuyoshi Watanabe
    • Journal Title

      Biochemial Biophysical Research Communication

      Volume: 418 Pages: 62-66

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2011.12.128

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic association/dissociation and harboring of endogenous mRNAs in stress granules2011

    • Author(s)
      Junwei Zhang
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 124 Pages: 4087-4095

    • DOI

      10.1242/jcs.090951

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Screening and characterization of natural compounds that affect nuclear speckle formation and alternative pre-mRNA splicing in mammalian cells2011

    • Author(s)
      Yota Matsuo
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] 分裂酵母mRNA核外輸送因子Ptr8pのセントロメアヘテロクロマチン形成への関与2011

    • Author(s)
      水谷文哉
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] mRNAの核外輸送を阻害する低分子化合物のスクリーニング2011

    • Author(s)
      糀本大和
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] スプライシング因子SF2の核スペックル局在を促進する化合物Toyocamycinの解析2011

    • Author(s)
      八木浩亮
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] RNA制御のケミカルバイオロジー2011

    • Author(s)
      谷時雄
    • Organizer
      第22回フォーラム・イン・ドージン
    • Place of Presentation
      熊本ホテルキャッスル(熊本市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-04
  • [Presentation] 分裂酵母のセントロメアヘテロクロマチン形成における基本転写因子複合体TFIIH構成因子Ptr8pの関与2011

    • Author(s)
      水谷文哉
    • Organizer
      第22回フォーラム・イン・ドージン
    • Place of Presentation
      熊本ホテルキャッスル(熊本市)
    • Year and Date
      2011-11-04
  • [Presentation] スプライシング因子SF2の核スペックル局在を促進する化合物Toyocamycinの解析2011

    • Author(s)
      八木浩亮
    • Organizer
      第22回フォーラム・イン・ドージン
    • Place of Presentation
      熊本ホテルキャッスル(熊本市)
    • Year and Date
      2011-11-04
  • [Presentation] mRNAの核外輸送を阻害する低分子化合物のスクリーニング2011

    • Author(s)
      糀本大和
    • Organizer
      第22回フォーラム・イン・ドージン
    • Place of Presentation
      熊本ホテルキャッスル(熊本市)
    • Year and Date
      2011-11-04
  • [Presentation] pre-mRNAスプライシング/mRNA核外輸送装置によるクロマチンサイレンシングの多元的制御2011

    • Author(s)
      谷時雄
    • Organizer
      第84回日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-23
  • [Presentation] 分裂酵母のセントロメアヘテロクロマチン形成における基本転写因子複合体TFIIH構成因子Ptr8pの関与2011

    • Author(s)
      水谷文哉
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第44回研究報告会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡市)
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] 分裂酵母SPBハーフブリッジ構成因子Sfi1p/Ptr9pはTREX2複合体を介してmRNA核外輸送に関与する2011

    • Author(s)
      北畑衣理
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第44回研究報告会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡市)
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] 分裂酵母pre-mRNAスプライシング装置のクロマチンサイレンシングへの関与2011

    • Author(s)
      知念まどか
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第44回研究報告会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡市)
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] Ptr10p, a fission yeast membrane bound protein, is involved in nuclear mRNA export through the TREX-2 complex2011

    • Author(s)
      Nozomi Saitoh
    • Organizer
      RNA 2011
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都市)
    • Year and Date
      2011-06-16
  • [Presentation] Chemical control of nuclear speckle formation and alternative pre-mRNA splicing in mammalian cells2011

    • Author(s)
      Yota Matsuo
    • Organizer
      RNA 2011
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都市)
    • Year and Date
      2011-06-15
  • [Presentation] Screening for the compounds that affect the nuclear mRNA export in mammalian cells2011

    • Author(s)
      Hafize Aysin Demirkol
    • Organizer
      RNA 2011
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都市)
    • Year and Date
      2011-06-15
  • [Presentation] Functional Analysis of the Nuclear Structures Using Bio-probes2011

    • Author(s)
      谷時雄
    • Organizer
      上原財団国際シンポジウム2011
    • Place of Presentation
      Hyatt Regency Tokyo(東京都)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-07
  • [Presentation] mRNAの核外輸送を阻害する低分子化合物のスクリーニング2011

    • Author(s)
      糀本大和
    • Organizer
      第6回日本ケミカルバイオロジー学会
    • Place of Presentation
      東工大70周年記念講堂(東京都)
    • Year and Date
      2011-05-24
  • [Presentation] スプライシング因子SF2の核スペックル局在化阻害化合物の解析2011

    • Author(s)
      八木浩亮
    • Organizer
      第6回日本ケミカルバイオロジー学会
    • Place of Presentation
      東工大70周年記念講堂(東京都)
    • Year and Date
      2011-05-24
  • [Presentation] 分裂酵母スプライシング因子Prp14pのRNAiを介したセントロメアヘテロクロマチン形成への関与2011

    • Author(s)
      弓掛辰洋
    • Organizer
      第5回日本エピジェネテクス研究会年会
    • Place of Presentation
      KKR熊本(熊本市)
    • Year and Date
      2011-05-19
  • [Presentation] セントロメアヘテロクロマチン形成への分裂酵母基本転写因子複合体TFIIH構成因子Ptr8pの関与2011

    • Author(s)
      水谷文哉
    • Organizer
      第5回日本エピジェネテクス研究会年会
    • Place of Presentation
      KKR熊本(熊本市)
    • Year and Date
      2011-05-19
  • [Book] Chembiomolecular Science : at the Fronteir of Chemistry and Biology2012

    • Author(s)
      Kaya Shigaki
    • Publisher
      Visual screening for the natural compounds that affect the formation of the nuclear structures(印刷中)
  • [Remarks]

    • URL

      http://aster.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm

URL: 

Published: 2013-06-26  

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