2012 Fiscal Year Annual Research Report
スプライシング制御因子のＲＮＡ認識における柔軟性の構造生物学的研究
Publicly Offered Research
| Project Area | Diversity and asymmetry achieved by RNA program |
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| Project/Area Number |
23112723
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| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
武藤 裕 独立行政法人理化学研究所, RNA生物学研究チーム, チームリーダー (30192769)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2013-03-31
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| Keywords | NMR / 構造解析 / SUP-12 / ASD-1 / 選択的スプライシング / RNA 結合ドメイン / FGFレセプター / C.elegans |
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| Outline of Annual Research Achievements |
線虫ではASD-1とSUP-12が協同してFGFRのpre-mRNAの特定の部位に結合しスプライシング反応を制御して、筋肉芽細胞特異的なFGFR分子を生成することが明らかにされている。本研究では、このふたつの因子による協同的なスプライシング反応の制御を構造生物学的な手法によって明らかすることを目指した。構造解析の結果、ASD-1とSUP-12は協同的にＵＡＣＧＵＧＧＵＧＵＧCというRNA配列を認識していることが明らかになった。この場合、SUP-12単独でRNAを認識する様式と異なっていることが分かった。ふたつのRNA結合ドメインによって協働的に認識されるグアニン塩基の重要性を明らかにするため、この塩基の置換配列や挿入配列を用いたRNA配列で調べたところ、RNAに対する結合が弱くなっている場合とともにふたつのドメインの位置関係が固定されないことがNMR法の緩和実験から明らかになった。このように変異したＲＮＡ配列では、ASD-1, SUP-12が結合するにもかかわらず、スプライシング制御能が落ちているものがあるが、この活性の消失とふたつの蛋白因子の位置関係の固定化との間に相関が見られた。このことは、スプライシング因子が単にターゲット配列に結合するだけではなく、構造的な協働性が発揮されないとスプライシング制御が適切に行われない可能性を示唆し、興味深い。これられの結果から、ＳＵＰ－１２は、単独では、RNAへの特異性が低く比較的幅広い結合特異性をもつが、ASD-1との協働作用によって結合位置が固定されるという結合における効果とともに、因子の位置関係も重要な意味をもつことが明らかになった。
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| Research Progress Status |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Solution Structure of the Splicing Factor Motif (SFM) of the human Prp18 protein2012
Author(s)
He, F., Makoto Inoue, M., Kigawa, T., Takahashi, M., Kuwasako, K., Tsuda, K., Kobayashi, N., Terada, T., Shirouzu, M., Guuml;ntert, P., Yokoyama, S. and Muto, Y
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Journal Title
PROTEINS
Volume: 80
Pages: 968-974
DOI
Peer Reviewed
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