2012 Fiscal Year Annual Research Report
ＤＮＡ結合タンパク質のＡＴＰａｓｅの蛍光１分子イメージング
Publicly Offered Research
| Project Area | Water plays a key role in ATP hydrolysis and ATP-driven functions of proteins |
|---|
| Project/Area Number |
23118711
|
|---|
| Research Institution | Kyoto University |
|---|
Principal Investigator |
横田 浩章 京都大学, 物質－細胞統合システム拠点, 講師 (90415547)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2013-03-31
|
| Keywords | 1分子計測 / ナノバイオ / 核酸 / 酵素反応 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
DNA複製・修復・組み換えは、種の遺伝的連続性を保証する最も重要な機構である。現時点では、さまざまなタンパク質分子が実際にどのように相互作用しつつ、非常に複雑な反応を速やかに、そして絶妙な精度で触媒するのかについてのダイナミクスはわかっていない。ましてや、それらのタンパク質がエネルギー源であるATPをどのように結合・解離し、その加水分解エネルギーを化学力学変換して、DNAと相互作用し機能を発揮しているのかについての詳細はわかっていない。このATPの加水分解エネルギーの化学力学変換機構の理解のためには、直接ATPとタンパク質が相互作用している現場を可視化することが鍵となる。そこで本研究では、1分子蛍光イメージング観察系の改良を通して、DNA結合タンパク質のATPの結合・解離状態を高濃度ATP条件下で1分子可視化できる系を構築し、その化学力学変換機構に迫ることを目的とした。
平成24年度は、DNA基質の設計と作製、1分子蛍光イメージング観察系の改良を行いながら、本領域公募研究にて開発したゼロモード導波路（ナノ開口アレイ）を用い、ATPase1分子イメージングを継続した。そして、ナノ開口に固定したヘリカーゼ1分子のATPaseとそのヘリカーゼによるDNAの巻き戻しを同時に1分子計測できる系を確立した。
|
| Research Progress Status |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
|
Research Products
(9 results)
-
-
[Journal Article] Binding of hairpin pyrrole and imidazole polyamides to DNA: Relationship between torsion angle and association rate constants2012
Author(s)
Han., Y. W., Matsumoto, T., Yokota, H., Kashiwazaki, G., Morinaga, H., Hashiya, K. Bando, T., Harada, Y. and Sugiyama, H.
-
Journal Title
Nucleic Acids Research
Volume: 40
Pages: 11510-11517
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Real-time background-free selective imaging of fluorescent nanodiamonds in vivo2012
Author(s)
Igarashi, R., Yoshinari, Y., Yokota, H., Sugi, T., Sugihara, F., Ikeda, K., Sumiya, H., Tsuji, S., Mori, I., Tochio, H., Harada, Y., and Shirakawa, M.
-
Journal Title
Nano Letters
Volume: 12
Pages: 5726-5732
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
