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2011 Fiscal Year Annual Research Report

ヒストン修飾を介した植物の乾燥ストレス適応機構の解析

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrated analysis of strategies for plant survival and growth in response to global environmental changes
Project/Area Number 23119522
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

関 原明  独立行政法人理化学研究所, 植物ゲノム発現研究チーム, チームリーダー (80281624)

Keywords乾燥ストレス / ヒストン修飾酵素 / シロイヌナズナ / マイクロアレイ / 遺伝子発現制御
Research Abstract

乾燥などの環境ストレスに対する植物の応答や耐性機構に関する研究は近年、飛躍的に進んでいる。しかしながら、植物におけるエピゲノム変動を介した環境ストレス応答とその制御機構はほとんど解析されていない。我々はこれまでに、シロイヌナズナが乾燥ストレスを受けて誘導する遺伝子の発現状況(量)が、ヒストン修飾の量・質的な変化と相関していることを明らかにしてきた。この事から、ヒストン修飾を中心としたエピゲノム制御機構が、植物の環境ストレス応答に関与することが十分に考えられる。本研究では、シロイヌナズナのヒストン修飾酵素遺伝子変異体を用いた解析を行い、環境ストレス、特に乾燥ストレス応答に関わるエピゲノム制御機構の解明を目指す。
シロイヌナズナのヒストン修飾酵素遺伝子変異体を用いて乾燥ストレス試験を行った結果、ヒストン脱アセチル化酵素HDA6遺伝子の変異体が、乾燥ストレス耐性を示す事を見出した。野生株とhda6変異体を比較したところ、乾燥ストレス応答時の植物体の水分量および気孔の開閉などに差異は見られなかった。乾燥ストレス応答に関与する既知の代表的な遺伝子群について乾燥ストレス時の遺伝子発現応答を調べたところ、hda6変異体と野生株との間に差異は見られなかった。乾燥ストレス処理時の遺伝子発現プロファイルをマイクロアレイを用いて解析した結果、新規なストレス応答性代謝経路の遺伝子発現が野生株とhda6変異系統の間で異なっていた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

シロイヌナズナのヒストン修飾酵素遺伝子変異体を用いて乾燥ストレス試験を行った結果、ヒストン脱アセチル化酵素HDA6遺伝子の変異体が、強い乾燥ストレス耐性を示す事を見出している。マイクロアレイ解析を行ったところ、興味深いことに新規な代謝パスウェイの発現応答が野生株と変異体の間で異なっている事を見出した。

Strategy for Future Research Activity

ヒストン脱アセチル化酵素HDA6が上記新規代謝パスウェイの遺伝子領域に直接結合しているかどうかをクロマチン免疫沈降法を用いて解析する。また、hda6変異体と野生株の間で乾燥処理条件下で新規代謝パスウェイの代謝産物の蓄積量に差がないかどうか解析する。上記の研究を通してなぜhda6変異体が乾燥ストレス耐性を示すかを明らかにする。

  • Research Products

    (10 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (4 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] An Epigenetic Integrator : New Insights into Genome Regulation, Environmental Stress Responses and Developmental Controls by HISTONE DEACETYLASE 62012

    • Author(s)
      Kim, et al
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis HDA6 Regulates Locus-Directed Heterochromatin Silencing in Cooperation with MET12011

    • Author(s)
      To, et al
    • Journal Title

      PLoS Genet

      Volume: 7 Pages: e1002055

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Derepression of ethylene-stabilized transcription factors (EIN3/EIL1) mediates jasmonate and ethylene signaling synergy in Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Zhu, et al
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      Volume: 108 Pages: 12539-12544

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 局速シーケンサーを用いたシロイヌナズナにおけるエピゲノム解析の実際2011

    • Author(s)
      金鍾明, ら
    • Journal Title

      植物の生長調節

      Volume: 46 Pages: 142-148

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The HDA6 Function in Environmental Stress Response2012

    • Author(s)
      Kim, J.M., et al
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] RNA and epigenetic regulations in plant abiotic stress responses2011

    • Author(s)
      Seki, M., et al
    • Organizer
      第6回ムギ類研究会
    • Place of Presentation
      横浜市立大学木原生物学研究所(横浜市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] 植物の環境ストレス応答におけるRNAおよびエピジェネティック制御機構の解析2011

    • Author(s)
      関原明
    • Organizer
      第230回京都大学生態学研究センターセミナー
    • Place of Presentation
      京都大学生態学研究センター(大津市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-21
  • [Presentation] Arabidopsis transcriptome and epigenome analysis in abiotic stress responses2011

    • Author(s)
      Matsui, A., et al
    • Organizer
      第1回モデル生物丸ごと一匹学会
    • Place of Presentation
      理研播磨研究所(佐用郡)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-08-20
  • [Book] Methods in Molecular Biology-The third edition of the Arabidopsis Protocols(Edited by Drs.Jose J.Sanchez-Serrano and Julio Salinas)2012

    • Author(s)
      Kim, et al
    • Publisher
      Humana Press Inc(in press)
  • [Remarks]

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/pgnrt/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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