• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Annual Research Report

ヒストン修飾を介した植物の乾燥ストレス適応機構の解析

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrated analysis of strategies for plant survival and growth in response to global environmental changes
Project/Area Number 23119522
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

関 原明  独立行政法人理化学研究所, 植物ゲノム発現研究チーム, チームリーダー (80281624)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Keywords植物 / 環境ストレス / ヒストン修飾 / エピジェネティック制御 / 酢酸
Outline of Annual Research Achievements

植物には移動の自由がないため、様々な環境ストレス変化に対して適応する機構を備えている。近年の研究から、このシステムにはヒストン修飾を介したクロマチンリモデリングによる転写(後)制御機構が関与する事が示唆されてきている。これまでに本申請代表者らは、シロイヌナズナヒストン脱アセチル化酵素HDA6の変異株が乾燥ストレスに対して耐性を示すことを見出している。
本研究では、HDA6の乾燥ストレス耐性における機能の解明を目指して研究を進め、以下の新規な知見を得た。1)シロイヌナズナhda6変異株を用いた表現型解析から、この変異株が強い乾燥耐性を示すことを見いだした。2) hda6変異株を用いた乾燥ストレス条件下でのマイクロアレイ解析から、乾燥ストレス応答時に酢酸発酵経路の遺伝子が強く発現し、内在性の酢酸量が高度に蓄積していることがわかった。3) クロマチン免疫沈降実験の結果等から、シロイヌナズナの乾燥耐性付与には、HDA6によって制御される酢酸発酵経路の活性化が必須であることがわかった。4) 酢酸の直接投与による植物の乾燥耐性付与実験を行ったところ、比較的高濃度の酢酸を投与したシロイヌナズナで、乾燥耐性を示すことがわかった。
これまでの研究により、酢酸合成経路は植物の環境ストレス耐性に関与する主要な代謝パスウェイの一つであり、エピジェネティックな因子によって直接的に制御されていることを明らかにした。また、“酢酸”という代謝産物が、植物が環境変動を乗り越え生存(環境突破)するために機能する事を初めて明らかにした。酢酸の効果を利用した乾燥ストレス耐性植物の作出や、乾燥耐性付与法の開発につながり、低コストによる劣悪環境からの突破力の獲得が期待できる。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 7 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Highly-reproducible ChIP-on-chip analysis to identify genome-wide protein binding and chromatin status in Arabidopsis.2013

    • Author(s)
      Kim, J.M. et al.
    • Journal Title

      In "Methods in Molecular Biology- A third edition of the Arabidopsis Protocols (Edited by Drs. Jose J. Sanchez-Serrano and Julio Salinas)". Humana Press Inc., NJ.

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An Epigenetic Integrator: New Insights into Genome Regulation, Environmental Stress Responses and Developmental Controls by HISTONE DEACETYLASE 6.2012

    • Author(s)
      Kim, J.M. et al.
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 53 Pages: 794-800

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs004.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Novel antisense RNA and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses2013

    • Author(s)
      Matsui, A. et al.
    • Organizer
      Abiotic Stress Workshop, Plant Animal Genome ASIA 2013
    • Place of Presentation
      Singapore
    • Year and Date
      2013-03-17 – 2013-03-19
    • Invited
  • [Presentation] Novel RNA and Epigenetic Regulation in Plant Abiotic Stress Responses2012

    • Author(s)
      Seki, M.
    • Organizer
      Seminar at University of Cambridge
    • Place of Presentation
      University of Cambridge, Cambridge, UK
    • Year and Date
      2012-12-13 – 2012-12-13
    • Invited
  • [Presentation] Novel antisense RNA and epigenetic regulations in plant abiotic stress responses2012

    • Author(s)
      Seki, M.
    • Organizer
      School of Biological Sciences Seminar, Royal Holloway, University of London
    • Place of Presentation
      Royal Holloway University of London, Egham, UK
    • Year and Date
      2012-12-12 – 2012-12-12
    • Invited
  • [Presentation] 植物の環境ストレス応答におけるエピジェネティック制御2012

    • Author(s)
      関 原明ら
    • Organizer
      日本学術会議公開シンポジウム「植物保護におけるゲノム科学の利用」
    • Place of Presentation
      日本学術会議講堂、東京
    • Year and Date
      2012-11-13 – 2012-11-13
    • Invited
  • [Presentation] Novel posttranscriptional and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses2012

    • Author(s)
      Seki, M.
    • Organizer
      AGI Workshop on Biotechnology Research and Application in Agriculture
    • Place of Presentation
      AGI, Hanoi, Vietnam
    • Year and Date
      2012-09-05 – 2012-09-05
    • Invited
  • [Presentation] Novel RNA and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses, and Establishiment of cassava functional genomics platform and its application to molecular breeding2012

    • Author(s)
      Seki, M.
    • Organizer
      Seminar at Hanoi University of Agriculture, June 9, Hanoi University of Agriculture
    • Place of Presentation
      Hanoi Univ. of Agr., Hanoi, Vietnam
    • Year and Date
      2012-06-09 – 2012-06-09
    • Invited
  • [Presentation] Novel RNA and epigenetic regulation in plant abiotic stress responses2012

    • Author(s)
      Seki, M.
    • Organizer
      GNU Plant Science Symposium 2012
    • Place of Presentation
      Jinju, Korea
    • Year and Date
      2012-05-10 – 2012-05-12
    • Invited
  • [Remarks] 独立行政法人理化学研究所 植物科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム ホームページ(日本語)

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/pgnrt/

  • [Remarks] 独立行政法人理化学研究所 植物科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム ホームページ(英語)

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/pgnrt/English/index.html

URL: 

Published: 2018-02-02  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi