2012 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム情報科学に基づく環境応答性プロモーターの動作原理の還元論的解析
Publicly Offered Research
| Project Area | Environmental sensing of plants: Signal perception, processing and cellular responses |
|---|
| Project/Area Number |
23120511
|
|---|
| Research Institution | Gifu University |
|---|
Principal Investigator |
山本 義治 岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (50301784)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2013-03-31
|
| Keywords | 合成プロモーター |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
【目的】
植物の環境応答を支配する転写ネットワーク解明へ向けて、環境応答性プロモーターの総括的な理解のための解析の足場づくりを試みる。
［本年度の研究成果］
１）予測結果の実験的検証：強光ストレス・UV-B・低温・高浸透圧に応答するELIP2、及び低pH・Alなど土壌ストレス応答性のAtALMT1のプロモーターについてプロモーター予測を行い、両プロモーターから１１のシス配列候補を同定した。実験検証の結果、このうち１０については実際に機能配列であることが確認され、未知の制御配列の予測においても山本らの手法は高い正解率（９１％）を示すことがわかった。
２）合成プロモーター解析：ELIP2プロモーターの解析から、２種類の新規シス配列を組み合わせることで初めてストレス応答が「合成される」という例を発見した。同定された配列は新規のものである。また、同一の組合せが強光、UV-B、概日リズムのシグナルをすべて受けることが分かった。また、過酸化水素応答や耐病性誘導（ISR）時の応答を担うシス配列として予測されたものから概日リズム応答を示す新規配列が同定された。
３）シス配列を認識するトランス因子同定のための解析スキームの構築の試み：本プロジェクト等により今後新規シス制御配列が多数同定されることを想定している。従ってそれらに対応するトランス因子の同定を望むのであれば、高速かつ低負担で行う必要がある。そこで、Y1Hスクリーニング及びin vitroスクリーニングを試みた。
|
| Research Progress Status |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
[Journal Article] Identification of cis-acting promoter elements in cold- and dehydration-induced transcriptional pathways in Arabidopsis, rice and soybean2012
Author(s)
Maruyama K, Todaka D, Mizoi J, Yoshida T, Kidokoro S, Matsukura S, Takasaki H, Sakurai T, Yamamoto YY, Yoshikawa K, Kojima M, Sakakibara H, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K
-
Journal Title
DNA Res
Volume: 19
Pages: 37-49
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Plant promoter analysis in the genomic age2012
Author(s)
Yoshioka Y, Hyakucachi M, Kobayashi Y,Koyama K, Iuchi S, Kobayashi M, Suzuki Y, Sugano S, Sakurai T, Shinozaki K, Mitsuda N, Ohme-Takagi M, Tada Y, Yamamoto YY
Organizer
77th CSHL Symposium: The Biology of Plants 2012
Place of Presentation
Cold Spring Harbor, NY (USA)
Year and Date
2012-05-31
-
-
[Book] Methods in Enzymology2013
Author(s)
Hieno A, Naznin HA, Sawaki K, Koyama H, Sakai Y, Ishino H, Hyakumachi M. Yamamoto YY
Total Pages
未定
Publisher
Analysis of environmental stress in plants with the aid of marker genes for H2O2 responses
