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2011 Fiscal Year Annual Research Report

フラビン結合光センサードメインを鋳型とした酸化還元状態感受性蛍光タンパク質の開発

Publicly Offered Research

Project AreaEnvironmental sensing of plants: Signal perception, processing and cellular responses
Project/Area Number 23120513
Research InstitutionNagoya Institute of Technology

Principal Investigator

岩田 達也  名古屋工業大学, 工学研究科, テニュア・トラック助教 (20569917)

Keywords植物 / 可視化 / タンパク質 / 生物・生体工学 / バイオテクノロジー / フラビン / 酸化還元状態
Research Abstract

葉緑体やミトコンドリアにおいてはエネルギーと還元力の生産を行うため、光環境やストレスなどの外界の環境によってその酸化還元状態が変化すると考えられる。本研究の目的は細胞内(細胞小器官内)酸化還元状態に応答して蛍光強度が可逆的に変化する蛍光タンパク質を開発することである。平成23年度は、フラビンタンパク質を発現させた大腸菌体を用いてスクリーニングを行う系の確立を目指した。シロイヌナズナフォトトロピンのLOV2ドメインのC426A変異体(LOV(C/A))を用いて、このタンパク質を発現させた大腸菌を菌体のまま蛍光が観測できるかどうか調べた。LOV(C/A)を発現させた大腸菌懸濁液を蛍光分光光度計にて測定を行ったところ、LOV(C/A)に由来する蛍光を観測することができた。
これは、LOV(C/A)を発現していない大腸菌内在性のフラビンタンパク質の蛍光スペクトルとは強度、形の点で区別された。また、LOV(C/A)は大腸菌内で光依存的に還元された。これは、大腸菌体内の還元的雰囲気下に応答して光依存的に還元されたのであり、LOV(C/A)が酸化還元応答性蛍光タンパク質として機能しうることを示唆する結果を得た。次に、LOV(C/A)遺伝子を鋳型としてランダム変異導入法を試みた。作製した変異(候補)プラスミドを7個選んでシーケンスを行ったところ、変異塩基は4-12箇所(アミノ酸にして1-8箇所)導入されることがわかった。これらの候補のうち約50候補の性質を調べ、LOV(C/A)より光還元の速度が速い変異体を見つけることが出来た。
LOV以外のフラビン結合光受容体を鋳型として酸化還元状態感受性蛍光タンパク質に変換できる可能を検討するため、光還元反応と損傷DNAの修復過程の分子メカニズムの解明に向けたFTIR分光法による構造解析を行うことができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平成23年度は、蛍光タンパク質の大腸菌体内でのスクリーニング系とフラビン結合をコードする遺伝子へのランダム変異導入を目指した研究を行い、実際に達成することが出来た。またDNA光回復酵素の光反応のFTIR分光法による研究を発表することができた。

Strategy for Future Research Activity

平成24年度は酸化還元応答性蛍光タンパク質の鋳型として、LOVドメイン以外にBLUFドメインやクリプトクロム/DNA光回復酵素ファミリータンパク質を用いて変異導入による作製を試みる。また、実際にスクリーニングを行ったフラビンタンパク質変異体に対して、実際に植物細胞や植物体にて発現を行い、その蛍光の挙動を観測する。
また、BLUFドメイン自身の光反応の性質を調べることで、蛍光タンパク質の適性について調べたいと考えている。

  • Research Products

    (25 results)

All 2012 2011

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (21 results)

  • [Journal Article] Light-induced structural changes of the LOV2 domains in various phototropins revealed by FTIR spectroscopy2011

    • Author(s)
      T.Iwata, S.Tokutomi, H.Kandori
    • Journal Title

      BIOPHYSICS

      Volume: 7 Pages: 89-98

    • DOI

      10.2142/biophysics.7.89

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Substrate Assignment of the (6-4) Photolyase Reaction by FTIR Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Y.Zhang, J.Yamamoto, D.Yamada, T.Iwata, K.Hitomi, T.Todo, E.D.Getzoff, S.Iwai, H.Kandori
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.Lett.

      Volume: 183 Pages: 2774-2777

    • DOI

      10.1021/jz201250b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strong donation of the hydrogen bond of tyrosine during photoactivation of the BLUF domain2011

    • Author(s)
      T.Iwata, A.Watanabe, M.Iseki, M.Watanabe, H.Kandori
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.Lett.

      Volume: 2 Pages: 1015-1019

    • DOI

      10.1021/jz2003974

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FTIR study of light-dependent activation and DNA repair processes of (6-4) photolyase2011

    • Author(s)
      Y.Zhang, T.Iwata, J.Yamamoto, K.Hitomi, S.Iwai, T.Todo, E.D.Getzoff, H.Kandori
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 50 Pages: 3591-3598

    • DOI

      10.1021/bi1019397

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アニオンラジカル型による(6-4)光回復酵素のDNA修復2012

    • Author(s)
      山田大智、岩田達也、神取秀樹
    • Organizer
      2011年度生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2012-03-19
  • [Presentation] フラビン結合光センサードメインを鋳型とした酸化還元状態感受性蛍光タンパク質の開発2012

    • Author(s)
      岩田達也
    • Organizer
      新学術領域研究「植物の環境感覚:刺激受容から細胞応答まで」2011年度第2回班会議
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2012-02-19
  • [Presentation] Hydrogen-bonding structures of the tyrosine and glutamine residues in the BLUF domain2012

    • Author(s)
      T.Iwata, S.Ito, M.Iseki, M.Watanabe, H.Kandori
    • Organizer
      Gordon Research Conference "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
    • Place of Presentation
      Galveston, USA
    • Year and Date
      2012-01-24
  • [Presentation] フラビンを発色団とする光センサータンパク質2011

    • Author(s)
      岩田達也
    • Organizer
      生物物理化学研究会シンポジウム「光といのち」
    • Place of Presentation
      名古屋(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-25
  • [Presentation] DNA光回復酵素の活性化と修復2011

    • Author(s)
      山田大智、張宇、岩田達也、山元淳平、人見研一、岩井成憲、藤堂剛、E.D.Getzoff、神取秀樹
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-12-21
  • [Presentation] FTIRを用いた(6-4)光回復酵素の活性化過程における分光解析2011

    • Author(s)
      山田大智、張宇、岩田達也、人見研一、藤堂剛、E.D.Getzoff、神取秀樹
    • Organizer
      第17回錯体化学若手の会中部・東海地区勉強会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] FTIR study of light-dependent activation and DNA repair processes of (6-4) photolyase2011

    • Author(s)
      Y.Zhang, J.Yamamoto, D.Yamada, T.Iwata, K.Hitomi, S.Iwai, T.Todo, E.D.Getzoff, H.Kandori
    • Organizer
      17th International Biophysics Congress and 12th National Biophysics Congress
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2011-10-31
  • [Presentation] BLUFドメインの光反応におけるチロシンとグルタミン残基の構造2011

    • Author(s)
      岩田達也
    • Organizer
      新学術領域研究「植物の環境感覚:刺激受容から細胞応答まで」第2回若手の会
    • Place of Presentation
      滋賀
    • Year and Date
      2011-10-26
  • [Presentation] 新規蛍光タンパク質の開発-細胞内酸化還元状態の可視化-2011

    • Author(s)
      岩田達也
    • Organizer
      名工大・名市大合同テクノフェア2011
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-10-20
  • [Presentation] Spectroscopic study of the photoactivation process of Xenopus (6-4) photolyase2011

    • Author(s)
      D.Yamada, Y.Zhang, T.Iwata, K.Hitomi, T.Todo, E.D.Getzoff, H.Kandori
    • Organizer
      International Workshop on "Spectroscopy on Photoinduced Functions of Electrons and Spins in Biology and Material Science
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2011-10-13
  • [Presentation] ^<15>Nラベルした(6-4)光産物修復の赤外分光観測2011

    • Author(s)
      張宇、山田大智、岩田達也、山元淳平、人見研一、岩井成憲、藤堂剛、E.D.Getzoff、神取秀樹
    • Organizer
      第5回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] Hydrogen-bonding structures of glutamine and tyrosine residues during the photoreaction of the BLUF domains2011

    • Author(s)
      T.Iwata, M.Iseki, M.Watanabe, H.Kandori
    • Organizer
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Himeji, Japan
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] FTIR study of light-dependent activation and DNA repair processes of E.coli CPD photolyase2011

    • Author(s)
      I M.M.Wijaya, Y.Zhang, T.Iwata, J.Yamamoto, S.Iwai, H.Kandori
    • Organizer
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Himeji, Japan
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] Spectroscopic study of light-dependent activation and DNA repair processes of Xenopus (6-4) photolyase2011

    • Author(s)
      D.Yamada, Y.Zhang, T.Iwata, J.Yamamoto, K.Hitomi, S.Iwai, T.Todo, E.D.Getzoff, H.Kandori
    • Organizer
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Himeji, Japan
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] Functional conversion of green-proteorhodopsin by site-directed mutagenesis2011

    • Author(s)
      R.Abe-Yoshizumi, K.Inoue, T.Iwata, H.Kandori
    • Organizer
      The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Himeji, Japan
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] アフリカツメガエルの(6-4)光回復酵素における活性化過程の分光解析2011

    • Author(s)
      山田大智、張宇、岩田達也、人見研一、藤堂剛、E.D.Getzoff、神取秀樹
    • Organizer
      第51回生物物理若手の会夏の学校
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-08-25
  • [Presentation] Structure of tyrosine residue in the unphotolyzed and intermediate states of the BLUF domains2011

    • Author(s)
      T.Iwata, A.Watanabe, M.Iseki, M.Watanabe, H.Kandori
    • Organizer
      5th Asia and Oceania Conference for Photobiology
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      2011-07-31
  • [Presentation] Spectroscopic study of the photoactivation process of Xenopus (6-4) photolyase2011

    • Author(s)
      D.Yamada, Y.Zhang, T.Iwata, K.Hitomi, T.Todo, E.D.Getzoff, H.Kandori
    • Organizer
      5th Asia and Oceania Conference for Photobiology
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      2011-07-31
  • [Presentation] フラビン結合光センサードメインを鋳型とした酸化還元状態感受性蛍光タンパク質の開発2011

    • Author(s)
      岩田達也
    • Organizer
      新学術領域研究「植物の環境感覚:刺激受容から細胞応答まで」2011年度第1回班会議
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2011-06-27
  • [Presentation] (6-4)光回復酵素における活性化過程の分光解析2011

    • Author(s)
      山田大智、張宇、岩田達也、人見研一、藤堂剛、E.D.Getzoff、神取秀樹
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波
    • Year and Date
      2011-06-24
  • [Presentation] Light-induced activation processes of the cryptochrome/photolyase family detected by FTIR spectroscopy2011

    • Author(s)
      T.Iwata
    • Organizer
      BIT Life Sciences' 2nd Symposium on Enzymes & Biocatalysis-2011
    • Place of Presentation
      Dalian, China(招待講演)
    • Year and Date
      2011-04-27

URL: 

Published: 2013-06-26  

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