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2012 Fiscal Year Annual Research Report

生殖細胞の形成を制御するNanos/Pumilio/mRNA複合体の構造解析

Publicly Offered Research

Project AreaStructural basis of cell-signalling complexes mediating signal perception, transduction and responses
Project/Area Number 23121524
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

橋本 博  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (40336590)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
KeywordsRNA複合体 / 結晶化 / 構造解析
Outline of Annual Research Achievements

生殖細胞は次世代に遺伝情報を伝え, 種の保存を実現する唯一の細胞であり, 次の世代をつくる全能性を有する. 生殖細胞の前駆細胞である始原生殖細胞の形成と維持にはNanosとPumilioが必要である. NanosとPumilioは, 高等真核生物で保存されたRNA結合タンパク質であり, mRNAの3' 非翻訳領域に結合し, 標的mRNAの翻訳を抑制する. しかし, その制御機構は不明であり, Nanos/Pumilio/mRNA複合体の原子レベルでの立体構造解析が求められている. 本研究は, 生殖細胞の基になる始原生殖細胞の形成と維持に必要なmRNAの翻訳制御因子, NanosとPumilioの構造生物学的研究であり, それらが機能している現場である複合体のX線結晶構造解析を目指す.
前年度にPumilioのC末端ドメイン(PumCTD), NanosのC末端ドメイン(NosCTD)とRNAとの複合体の結晶化に成功したが, 平成24年度は三者複合体のX線結晶構造解析を目指した試料調製を精力的に行った. 10-merと20-merの単鎖RNAを用いて, まずPumCTDとRNAを混合し, その後, NosCTDを添加しゲル濾過を行ったところ, 10-merのRNAでは三者複合体を形成しなかったが, 20-merのRNAを用いた場合に三者複合体としてゲル濾過カラムから溶出することに成功した. また,NosCTDとPumCTDはゲル濾過では相互作用が確認出来なかった. さらに, RNAに対する親和性は, NosCTDよりもPumCTDの方が高いという結果を得ている. これらの結果から, まずPumilioが配列特異的にRNAに結合し, その後NanosがPumilio-RNA複合体に結合し, 三者複合体が形成するモデルを提唱できる.

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of aldoxime dehydratase and its catalytic mechanism involved in carbon-nitrogen triple-bond synthesis2013

    • Author(s)
      Junpei Nomura
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 110 Pages: 2810-2815

    • DOI

      10.1073/pnas.1200338110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for the inhibition of xyloglucan-specific endo-β-1,4-glucanase (XEG) by XEG-protein inhibitor2012

    • Author(s)
      Takuya Yoshizawa
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 287 Pages: 18710-18716

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.350520

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and X-ray diffraction analysis of the ternary complex of the C-terminal domain of human REV1 in complex with REV7 bound to a REV3 fragment involved in translesion DNA synthesis2012

    • Author(s)
      Sotaro Kikuchi
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun

      Volume: 68 Pages: 962-964

    • DOI

      10.1107/S1744309112032435

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis of recruitment of DNA polymerase z by interaction between REV1 and REV72012

    • Author(s)
      Sotaro Kikuchi
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 287 Pages: 33847-33852

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.396838

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of a small molecule PCNA inhibitor that disrupts interactions with PIP-Box proteins and inhibits DNA replication2012

    • Author(s)
      Chandanamali Punchihewa
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 287 Pages: 14289-14300

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.353201

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanistic insights into the activation of rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator2012

    • Author(s)
      Naoyuki Kuwabara
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 20 Pages: 440-449

    • DOI

      10.1016/j.str.2012.01.005

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] REV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造から明らかになったDNAポリメラーゼζのリクルート機構2013

    • Author(s)
      菊池 壮太郎
    • Organizer
      第30回PFシンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場, 茨城
    • Year and Date
      2013-03-14 – 2013-03-15
  • [Presentation] REV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造から明らかになったDNAポリメラーゼζのリクルート機構の構造基盤2012

    • Author(s)
      菊池 壮太郎
    • Organizer
      第35回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場, 福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] Structural basis of recruitment of DNA polymerase zeta by interaction between REV1 and REV72012

    • Author(s)
      Sotaro Kikuchi
    • Organizer
      AsCA 12/CRYSTAL 28
    • Place of Presentation
      Adelaide Convention Centre, Australia
    • Year and Date
      2012-12-02 – 2012-12-06
  • [Presentation] Crystal structures of human PCNA in complex with small molecule inhibitors for cancer therapeutics2012

    • Author(s)
      Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      AsCA 12/CRYSTAL 28
    • Place of Presentation
      Adelaide Convention Centre, Australia
    • Year and Date
      2012-12-02 – 2012-12-06
  • [Presentation] Structural basis of recruitment of DNA polymerase ζ by interaction between REV1 and REV72012

    • Author(s)
      Sotaro Kikuchi
    • Organizer
      The 8th 3R Symposium
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai International Conference Center, Hyogo
    • Year and Date
      2012-11-25 – 2012-11-28
  • [Presentation] 損傷乗り越えDNA合成に関わるREV1-REV7-REV3三者複合体の結晶構造解析2012

    • Author(s)
      菊池 壮太郎
    • Organizer
      日本結晶学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学 片平キャンパス, 宮城
    • Year and Date
      2012-10-25 – 2012-10-26
  • [Presentation] REV1-REV7-REV3相互作用の構造基盤2012

    • Author(s)
      橋本 博
    • Organizer
      遺伝研研究集会
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所, 静岡
    • Year and Date
      2012-10-03 – 2012-10-04
    • Invited
  • [Presentation] 抗がん剤併用薬開発に向けた PCNAと阻害剤との複合体構造2012

    • Author(s)
      菊池 壮太郎
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場, 愛知
    • Year and Date
      2012-06-20 – 2012-06-22

URL: 

Published: 2018-02-02  

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