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2011 Fiscal Year Annual Research Report

大脳新皮質形成に関わる発現制御機構

Publicly Offered Research

Project AreaNeural Diversity and Neocortical Organization
Project/Area Number 23123504
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

西原 秀典  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (10450727)

Keywords脳 / 発生 / 遺伝子発現
Research Abstract

本研究計画は、(A)AS021と名付けられたSINE由来エンハンサーによるSatb2発現制御機構の研究、および(B)大脳新皮質で機能する新規エンハンサーの探索、の2点から成る。(A)に関しては、エンハンサーの分子機能およびSatb2の上流遺伝子を発見し、SINEを介した発現制御機構の解明を目的としている。平成23年度は、まずAS021遺伝子座がSatb2を大脳新皮質の深層ニューロン特異的に発現させるエンハンサーとして機能することを明らかにし、論文として発表した。さらに、Yeast one-hybrid screeningおよびトランスジェニックマウスを用いたエンハンサーアッセイにより、AS021遺伝子座に結合する転写因子としてNfixの同定に成功した。Satb2と同様、Nfixも脳梁形成の必須遺伝子であることが知られている。このことからSINE由来のAS021遺伝子座がNfixの結合を介してSatb2のエンハンサーとして機能し、脳梁への軸索投射に関与している可能性が示唆された。(B)に関しては、これまでにAS14_22-2と呼ばれる新規エンハンサーを発見し、詳細な分子機能解析を開始したところである。さらに複数のSINE由来エンハンサーを介した遺伝子発現の制御ネットワークを明らかにするために、Nfix結合モチーフを持つSINE由来領域を全ゲノム中から探索した。その結果、50以上の遺伝子座を発見し、そのうち少なくとも8遺伝子座に関しては実際にNfixが結合可能であることを示した。現在その中でエンハンサー機能を有する遺伝子座を探索中である。これらの発見は、Nfix結合モチーフを内部に含むSINEが哺乳類の祖先のゲノム中を転移することによって新規の発現制御領域を増大させていた可能性を示唆するものであり、大変興味深い成果と言える。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

AS021遺伝子座の機能解析の成果を論文として発表し、さらに新規エンハンサーも発見されている点は計画通りであると言える。予想以上に進展した点は、AS021の結合因子を介した遺伝子制御ネットワークの存在を示唆するデータが得られた点であり、エンハンサー探索によってそれが証明されれば研究が大きく発展すると期待される。

Strategy for Future Research Activity

研究計画に記載された内容に関しては、平成24年度も計画通りに研究を継続する。それに加え、遺伝子制御ネットワークの存在を証明するために、AS021結合因子を介するエンハンサーも探索する予定である。新規エンハンサーが発見されれば、これまでAS021に関しておこなってきた内容と同様の解析を進め、大脳新皮質形成に至る制御ネットワークを明らかにする。

  • Research Products

    (7 results)

All 2012 2011

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Phylogeny of galactolipid synthase homologs together with their enzymatic analyses revealed a possible origin and divergence time for photosynthetic Membrane biogenesis2012

    • Author(s)
      Yuzawa Y, Nishihara H, Haraguchi T, Masuda S, Shimojima M, Shimoyama A, Yuasa H, Okada N, Ohta H
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 19 Pages: 91-102

    • DOI

      10.1093/dnares/dsr044

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A mammalian conserved element derived from SINE displays enhancer properties recapitulating Satb2 expression in early-born callosal projection neurons2011

    • Author(s)
      Tashiro K, Teissier A, Kobayashi N, Nakanishi A, Sasaki T, Yan K, Tarabykin V, Vigier L, Sumiyama K, Hirakawa M, Nishihara H, Pierani A, Okada N
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 6 Pages: e28497

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0028497

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] B chromosomes have a functional effect on female sex determination in Lake Victoria cichlid fishes2011

    • Author(s)
      Yoshida K, Terai Y, Mizoiri S, Aibara M, Nishihara H, Watanabe M, Kuroiwa A, Hirai H, Hirai Y, Matsuda Y, Okada N
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: 7 Pages: e1002203

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1002203

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reverse evolution in RH1 for adaptation of cichlids to water depth in Lake Tanganyika2011

    • Author(s)
      Nagai H, Terai Y, Sugawara T, Imai H, Nishihara H, Hori M, Okada N
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 28 Pages: 1769-1776

    • DOI

      10.1093/molbev/msq344

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A Mammalian Conserved Element Derived from SINE Displays Enhancer Properties Recapitulating Satb2 Expression in Early-Born Callosal Projection Neurons2012

    • Author(s)
      Hidenori Nishihara
    • Organizer
      The 59th NIBB Conference "NEOCORTICAL ORG ANIZATION"
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center, Okazaki, Aichi
    • Year and Date
      2012-03-12
  • [Presentation] Functional analysis of the SINE-derived enhancer for Satb2 expression in neocortex2011

    • Author(s)
      西原秀典
    • Organizer
      日本進化学会第13回大会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Year and Date
      2011-07-31
  • [Presentation] Molecular functional analysis of the neocortex-specific Satb2 enhancer derived from SINEs : Toward resolution of the evolutionary process of exaptation2011

    • Author(s)
      Hidenori Nishihara
    • Organizer
      SMBE 2011-Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto
    • Year and Date
      2011-07-28

URL: 

Published: 2013-06-26  

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