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2012 Fiscal Year Annual Research Report

動原体配列の違いが染色体構造の進化に及ぼす影響

Publicly Offered Research

Project AreaSystematic study of chromosome adaptation
Project/Area Number 23125513
Research InstitutionKyoto Sangyo University

Principal Investigator

河邊 昭  京都産業大学, 総合生命科学部, 准教授 (10582405)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Keywords動原体 / ハクサンハタザオ / 反復配列
Outline of Annual Research Achievements

ハクサンハタザオとその近縁種は動原体特異的反復配列を3種類持っている。それらは変種や地域集団で染色体特異性が異なっていることが分かっていた。今回それらの動原体構成の異なる個体の交配をおこない、同じ染色体が異なる動原体反復配列を持っているF1の作出をおこなった。F1は異なる交配の組み合わせの物が複数得られ、それぞれ異なる染色体において動原体の構成が異なっていることが期待される。動原体の違いを区別するために染色体ごとに動原体を識別するための遺伝マーカーの作出をおこなった。動原体領域は組み換えが低いことから遺伝的変異が少ないことが知られている。マーカーの作出のために塩基配列を複数の系統で決定したので変異量の推定をおこなったところ、今回使用した系統においても染色体によってはほとんど変異が見られなかった。このことは一部の染色体では組み換えの低さが変異量を決定する要因になっている可能性を示唆する。一部の変異量の低さにもかかわらず、最終的にはほとんどの染色体が区別できるマーカーを作出することができた。
F1と親個体もしくは別の個体との交配をおこない、染色体の伝達率の違いを調査している。調査個体数はいまだ少ないものの、一部の染色体において伝達率の差が観察された。今後、この伝達率の差と動原体構成の違いの関係、伝達率の差の元になる現象を明らかにすることで動原体領域の進化の機構を探ることができるかもしれない。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2013 2012

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Evolution of the ONSEN retrotransposon family activated upon heat stress in Brassicaceae2013

    • Author(s)
      Hidetaka Itoh
    • Journal Title

      Gene

      Volume: 518 Pages: 256-261

    • DOI

      10.1016/j.gene.2013.01.034

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Centromere-targeted de novo integrations of an LTR retrotransposon of Arabidopsis lyrata.2012

    • Author(s)
      Sayuri Tsukahara
    • Journal Title

      Genes and Development

      Volume: 26 Pages: 705-713

    • DOI

      10.1101/gad.183871.111

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 動原体特異性を持つ転移因子COPIA93/20ファミリーのアブラナ科植物での存在様式2012

    • Author(s)
      河邊昭
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-09-26
  • [Presentation] 葉緑体ゲノム断片の核移行パターン2012

    • Author(s)
      降旗初佳
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-09-24

URL: 

Published: 2018-02-02  

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