2011 Fiscal Year Annual Research Report
適応的形質獲得のゲノム基盤
Publicly Offered Research
| Project Area | Genetic bases for the evolution of complex adaptive traits |
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| Project/Area Number |
23128503
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| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
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Principal Investigator |
岡田 典弘 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (60132982)
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| Keywords | シクリッド / 異種間雑種 / QTL解析 / マウス / 脳 / エンハンサー / Satb2 |
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| Research Abstract |
シクリッド:Haplochromis chilotesとH. sp. "rockkribensis"の雑種F2系統を飼育し始めてから2年が経過し、形態測定に適当なサイズ(9cm以上)まで成長したため収獲を開始した。F1集団では形態的にも一様であったが、F2集団は形態的に非常に大きなvariationを保持しており、様々な形質について(唇、歯列、頭部形状、吻角、吻サイズなど)QTL解析がおこなえる事が期待される。またビクトリア湖産シクリッドの連鎖地図作成とQTL解析に用いる150個のマイクロサテライトマーカーを準備し、現在はgenotypingを続けているところである。さらに、総括班の支援を受けて東アフリカ三大湖のシクリッド計7種(唇の肥大化し3種を含む)の全ゲノム配列決定に向けたシーケンスライブラリの作製をおこなった。哺乳類:哺乳類の形態進化のゲノム基盤に関しては、SINEに由来する哺乳類特異的なエンハンサーの探索、およびその発現制御対象となる遺伝子との比較を中心におこなった。特にAS021と名付けられたエンハンサーは、大脳新皮質の深層におけるcallosal neuron(脳梁へ軸索を投射するニューロン)にてSatb2の発現を促進させる働きを持つことが明らかとなった。Satb2は脳梁の発生に重要な機能を持つ遺伝子として知られている。このことから、真獣類特異的に進化した脳梁の形成に、SINE由来エンハンサーが関与した可能性が示された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
シクリッド:初年度が経過した時点で、リンケージマップの作製はおおよそ完成の見通しがたち、今後はQTLの結果を待つ状態であることから、当初の目標に沿っている。哺乳類:satb2の論文が出版され、これからはさらにこの詳細を解析していく方向性が打ち立てられていることから研究は順調であると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
シクリッドに関しては、このままgenotypingを進め、目的の遺伝領域の特定を目指す。
マウスに関しても、引き続いてsatb2のノックアウトマウスを用いた詳細な解析を進めていく予定である。
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[Journal Article] B chromosomes have a functional effect on female sex determination in lake victoria cichlid fishes2011
Author(s)
Yoshida K, Terai Y, Mizoiri S, Aibara M, Nishihara H, Watanabe M, Kuroiwa A, Hirai H, Hirai Y, Matsuda Y, Okada N
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Journal Title
PLoS Genet
Volume: 7
Pages: e1002203
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genetically distinct coelacanth population off the northern Tanzanian coast2011
Author(s)
Nikaido M, Sasaki T, Emerson JJ, Aibara M, Mzighani SI, Budeba YL, Ngatunga BP, Iwata M, Abe Y, Li WH, Okada N
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A
Volume: 108
Pages: 18009-18013
Peer Reviewed
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[Journal Article] A Mammalian Conserved Element Derived from SINE Displays Enhancer Properties Recapitulating Satb2 Expression in Early-Born Callosal Projection Neurons2011
Author(s)
Tashiro K, Teissier A, Kobayashi N, Nakanishi A, Sasaki T, Yan K, Tarabykin V, Vigier L, Sumiyama K, Hirakawa M, Nishihara H, Pierani A, Okada N
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Journal Title
PLoS One
Volume: 6
Pages: e28497
Peer Reviewed
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