2012 Fiscal Year Annual Research Report
優性遺伝型脊髄小脳変性症のハイスループット遺伝子変異探索
Publicly Offered Research
| Project Area | Personal genome-based initiatives toward understanding bran diseases |
|---|
| Project/Area Number |
23129503
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
|---|
Principal Investigator |
石川 欽也 東京医科歯科大学, 医学部附属病院, 講師 (30313240)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2013-03-31
|
| Keywords | ゲノム / 神経疾患 / 遺伝子 / 脳科学 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、常染色体優性遺伝型の脊髄小脳変性症のうち、未だ原因が不明の病型の原因を現在の技術で最も迅速と考えられるハイスループットな手法で同定することである。我々はこれまで本邦の原因不明の優性遺伝型脊髄小脳変性症を集積し、2009年にその1病型の原因を発見することが出来た。しかし未だ原因が同定されない病型(「未同定SCA」)が全SCA家系の10-20％と多数存在する。本研究では原因同定に有力な家系に絞って次世代シークエンサーとDNAマイクロアレー法を用いて原因の探索を目指した。まず家系５つについてマイクロアレーを用いて遺伝子変異が存在する候補染色体領域を限定ました。次に各家系から発症者2名ずつを選び、次世代シークエンサーを用いてエクソーム解析を行った。
その結果、1つの家系ではその連鎖候補領域内に存在する遺伝子内に、発症者全員に共通する遺伝子異常を見出した。この遺伝子異常は種を越えて保存されている機能的に重要な部位の変化であり、コンピュータ予測の結果でも原因である可能性をサポートする結果を得た。しかし、この結果のみでは本家系の原因であると断定できないため、当該家系と臨床的に類似する家系を全国に募った。その結果、15家系の集積が得られた。これらについて、平成24年度ゲノム支援から支援いただき、エクソーム解析を行った。その結果、1家系に同じ遺伝子内に異常を見出した。目下、この異常が家系内で分離するかどうかを検討している。
他の家系についても、遺伝子異常の探索を進めることができた。しかし、未同定ＳＣＡの家系自体が集積しづらく、原因の発見に至るためにはさらに多くの家系の集積を進めることが大きな課題の一つであることが判明した。
|
| Research Progress Status |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
[Journal Article] Abnormal RNA structures (RNA foci) containing a penta-nucleotide repeat (UGGAA)n in the Purkinje cell nucleus is associated with spinocerebellar ataxia type 31 pathogenesis.2013
Author(s)
Niimi Y., Takahashi M, Sugawara E, Umeda S, Obayashi M, Sato N, Ishiguro T, Higashi M, Eishi Y, Mizusawa H, Ishikawa K.
-
Journal Title
Neuropathology
Volume: in press
Pages: in press
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
[Journal Article] Development of Purkinje cell degeneration in a knockin mouse model reveals lysosomal involvement in the pathogenesis of SCA6.2012
Author(s)
Unno T., Wakamori M, Koike M, Uchiyama Y, Ishikawa K, Kubota H, Yoshida T, Sasakawa H, Peters C, Mizusawa H, Watase K.
-
Journal Title
Proc Natl Acad Sci USA.
Volume: 109(43)
Pages: 17693-17698
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Reduced brain-derived neurotrophic factor (BDNF) mRNA expression and presence of BDNF-immunoreactive granules in the spinocerebellar ataxia type 6 (SCA6) cerebellum.2012
Author(s)
Takahashi M., Ishikawa K, Sato N, Obayashi M, Niimi Y, Ishiguro T, Yamada M, Toyoshima Y, Takahashi H, Kato T, Takao M, Murayama M, Mori O, Eishi Y, Mizusawa H.
-
Journal Title
Neuropathology
Volume: 32(6)
Pages: 595-603
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Prevalence of inositol 1, 4, 5-triphosphate receptor type 1 gene (ITPR1) deletion, the mutation for spinocerebellar ataxia type 15 (SCA15), in Japan screened by gene dosage.2012
Author(s)
Obayashi M., Ishikawa K, Izumi Y, Takahashi M, Niimi Y, Sato N, Onodera O, Kaji R, Nishizawa M, Mizusawa H.
-
Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: 57(3)
Pages: 202-206
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Presentation] A gene search for a new spinocerebellar ataxia.2012
Author(s)
Ishikawa K., Sato N, Ozaki K, Mitsui J, Ishiura H, Hashimoto Y, Obayashi M, Matsuo H, Tsuji S, Mizusawa H.
Organizer
The 62nd Annual Meeting of the American Society of Human Genetics.
Place of Presentation
Moscone Convention Center, San Francisco.
Year and Date
2012-11-06 – 2012-11-10
-
-
