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2012 Fiscal Year Annual Research Report

DNA損傷部位で停止した転写装置が及ぼす複製フォークの進行阻害とその回復機構

Publicly Offered Research

Project AreaCoupling of replication, repair and transcription, and their common mechanism of chromatin remodeling
Project/Area Number 23131518
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

真木 寿治  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (20199649)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Keywords遺伝的不安定性 / DNA複製 / 複製フォーク / 遺伝学
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、DNA損傷により停止した転写装置がDNA複製フォークの進行にどのような影響を与えるのかを分子レベルで解明し、転写装置により進行が阻害されたDNA複製がどのようにして回復するのかを明らかにすることである。そのために、申請者らが開発したin vitro oriCプラスミドDNA複製系での複製フォークの進行をモニターする実験系を基盤として、特定の部位にDNA損傷を導入した鋳型DNAを用いることにより損傷部位で停止した大腸菌RNAポリメラーゼによる複製フォークの進行阻害の状況を詳細に解析する。さらに、停止した転写装置を鋳型DNAから排除する働きを持つMfdタンパク質による複製の再開の検証、および遺伝学的な研究から複製フォークの進行と転写の進行をモジュレートすると考えられている一群のDNAヘリカーゼ(DinG、Rep、UvrD)の働きを生化学的に解析する。
本年度は、in vitro oriCプラスミドDNA複製系に用いる特定の部位にDNA損傷を導入した鋳型DNAの新規の調製法の確立と、それにより得られた鋳型DNAを用いた複製フォークの進行の阻害および回復の過程の解析を中心に研究を進めた。DNA損傷としてはベンツピレンがグアニンに付加したものを用い、それを含むオリゴDNAをoriCプラスミドに制限酵素とDNAリガーゼの反応で組み込み、超遠心分離機とゲル電気泳動により精製して、調製法を確立した。oriCプラスミドDNA複製系でリーディング鎖上の損傷により複製フォークが阻害すること、さらにDNAポリメラーゼIVの添加により複製フォークが再開することを生化学的に検出・解析することに成功した。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Quick replication fork stop by overproduction of Escherichia coli DinB produces non-proliferative cells with an aberrant chromosome.2012

    • Author(s)
      Mio Ikeda
    • Journal Title

      Genes and Genetic Systems

      Volume: 87 Pages: 229-231

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1266/ggs.87.221

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Escherichia coli DinB inhibits replication fork progression without signifiantly inducing the SOS response.2012

    • Author(s)
      Tatsuya Mori
    • Journal Title

      Genes and Genetic Systems

      Volume: 87 Pages: 75-87

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1266/ggs.87.75

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interactionbetween Escherichia coli DNA poluymerase IV and the single-stranded DNA-binding portein is required for DNA syntheisis on SSB-coated DNA.2012

    • Author(s)
      Asako Furukohri
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 40 Pages: 6039-6048

    • DOI

      10.1093/nar/gks264

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌の生育環境の急激な変化が引き起こす突然変異の解析2012

    • Author(s)
      上船晴香
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部、福岡
    • Year and Date
      2012-09-26
  • [Presentation] 損傷乗り越えDNA合成による複製フォーク再開機構の解析2012

    • Author(s)
      池田美央
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部、福岡
    • Year and Date
      2012-09-25
  • [Presentation] 大腸菌dinB遺伝子の遺伝的ネットワークの探索2012

    • Author(s)
      出水紀行
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部、福岡
    • Year and Date
      2012-09-25
  • [Presentation] Effects of inverted repeats on DNA replication fork: biochemical studies with a reconstituted oriC plasmid replication in vitro.2012

    • Author(s)
      Pey Jiun Lai
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部、福岡
    • Year and Date
      2012-09-25
  • [Presentation] Molecular mechanisms underlying the genetic instability of CAG CTG repeats in Escherichia coli.2012

    • Author(s)
      Hang Phuong Le
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部、福岡
    • Year and Date
      2012-09-25
  • [Presentation] Effects of a long inverted‐repeat on dynamics of Escherichia coli DNA replication fork.2012

    • Author(s)
      Hisaji Maki
    • Organizer
      3rd Erling Seeberg Symposium
    • Place of Presentation
      Trondheim and Orland, Norway
    • Year and Date
      2012-06-22
    • Invited
  • [Presentation] Hyper-processive and slower DNA chain elongation catalysed by dnaE173 DNA polymerase III holoenzyme.2012

    • Author(s)
      Hisaji Maki
    • Organizer
      Cantoblanco Workshop on "Polymerases involved in DNA replication, repair and,mutagenesis. From basic knowledge to biotechnological applications"
    • Place of Presentation
      Centro de Biolog#237;a Molecular Severo Ochoa, Madrid, Spain
    • Year and Date
      2012-06-05
    • Invited
  • [Presentation] Superoxide Mutagenesis: An Overview of Outcome and a Possible Involvement of Glyoxal.2012

    • Author(s)
      Hisaji Maki
    • Organizer
      U.S.-Japan DNA Repiar Meeting
    • Place of Presentation
      National Conference Center, Virginia, USA
    • Year and Date
      2012-04-12
    • Invited
  • [Book] DNA Polymerase III, Bacterial. In: Lennarz W.J. and Lane M.D. (eds.) The Encyclopedia of Biological Chemistry, vol. 22013

    • Author(s)
      Hisaji Maki
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      Academic Press

URL: 

Published: 2018-02-02  

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