2023 Fiscal Year Annual Research Report
Deciphering the genome modality change through data-driven phase portrait reconstruction
Publicly Offered Research
| Project Area | Genome modality: understanding physical properties of the genome |
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| Project/Area Number |
23H04288
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
前原 一満 九州大学, 生体防御医学研究所, 助教 (90726431)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | クロマチン / 位相図 / ヒストンバリアント / ホッジ分解 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
生命現象としての生や死、増殖、細胞分化、がん化といった質的変化は、多種多数の分子が働く真核細胞の核内に存在するクロマチンの緻密な遺伝子発現制御システムにより実現される。本計画では、ゲノムモダリティ変化を定性的に理解するための情報解析手法開発を目的とする。クロマチンの状態変化を示すクロマチン・フロー計測法を樹立し、離散的ホッジ分解を応用した複雑ダイナミクスの要約法と組み合わせることで、クロマチン状態変化の位相図を構成し、複雑なクロマチン動態の定性的理解を試みる。本年度は、計画前半の目標として課題（A）に掲げた、高次元の空間で起きる遺伝子発現やクロマチンのダイナミクスを計測から再構成するためのデータ解析手法を構築した。さらにシングルセルレベルのクロマチンのダイナミクス再構築を目指し、データ取得と解析を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
当初予定に沿ったデータ解析手法の開発と並行してオミクス計測法に関わる技術開発も進めており、当初計画以上に進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究計画は順調に推移しており、今後の当初計画に基づく研究開発を遂行する。また最終年度に向け、論文成果の発表により注力する。
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Research Products
(7 results)
