2012 Fiscal Year Annual Research Report
アロ認証関連遺伝子の進化遺伝学的解析
Publicly Offered Research
| Project Area | Elucidation of Common Mechanisms for Allogeneic Authentication in Animals and Plants |
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| Project/Area Number |
24112702
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| Research Institution | Yamagata University |
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Principal Investigator |
田宮 元 山形大学, 医学部, 教授 (10317745)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | 細胞・組織 / CD9 / Izumo / 配偶子認識 / 生殖 / 進化遺伝学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の研究目標は、CD9 のように当該特別推進研究領域で取得されているアロ認証に関連する遺伝子の塩基配列をTajima のD や非同義置換率と同義置換率の比ω、Fay とWu のH のような進化遺伝学的統計量を用いて評価して、その特有の進化的パターンを探り、それらの知見から、アロ認証にどのような中核原理が可能であるのか予言するというものである。具体的には、１）CD9 やIZUMO1 のような広義のアロ認証に関係する幾つかの興味深い遺伝子について、1000Genomes などの公共データベースからDNA 配列バリエーション情報を取得して、進化遺伝学的分析を実施する。さらに、２）これまで当該領域で取得されているアロ認証に関係すると考えられている遺伝子について、その遺伝子に責任を持つ研究班員に対して可能な実験的研究（例えば次世代シークエンサーを用いたバリエーション検索や自然集団を用いた遺伝子多様性解析など）に関する助言を行い、希望に応じて遺伝統計学的な分析を実施し、結果を担当班員へレポートして、その論文出版を支援する。最終的に、３）これらの分析を通して、アロ認証機構に特有の進化の歴史を明らかにし、その中核原理についてどのようなメカニズムが許されるのか予想し班員に提示する。実際に、平成24年度中に、CD9とIZUMO1について、1000Genomesからデータを取得し、TajimaのDとω（dN/dS）を計測したところ、CD9はD0かつω1と強い純化淘汰の対象にあるが、IZUMO1はむしろω1と迅速進化の対象となっていることが示された。IZUMO1の更なる調査では、この遺伝子がヒト集団中でCNV多型領域のひとつであることが判明し、今後、アロ認証関連遺伝子の進化メカニズムへの興味深い示唆を与えるものであると期待される。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
CD9とIZUMO1に関して、当初の予定通りの解析を実施し、予想以上の知見が得られている。これらにつき、領域会議や領域主催の国際会議にて発表を行った。他班員からの分析依頼については、森班員からの依頼で、植物のアロ認証関連遺伝子であるY47遺伝子の進化遺伝学的解析を実施し、詳細なレポートを作成した。また、ホヤのthemis遺伝子につき、進化遺伝学解析を依頼され、実施している。これらから、おおむね当初研究計画どおり、順調に進展していると判断している。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成25年度も前年度と同じく、CD9とIZUMO1を中心にして、アロ認証関連遺伝子の進化遺伝学的分析を行う。特に、他の班員からの依頼をもっとも積極的に公知し、受け入れを行うことを予定している。更に、これらの分析の幾つかについては、班員の論文出版を積極的に支援していくことを予定している。
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