2013 Fiscal Year Annual Research Report
アロ認証関連遺伝子の進化遺伝学的解析
Publicly Offered Research
| Project Area | Elucidation of Common Mechanisms for Allogeneic Authentication in Animals and Plants |
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| Project/Area Number |
24112702
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
田宮 元 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (10317745)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | 細胞・組織 / CD9 / Izumo / 配偶子認識 / 生殖 / 進化遺伝学 |
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| Research Abstract |
本研究の研究目標は、CD9 のように当該特別推進研究領域で取得されているアロ認証に関連する遺伝子の塩基配列をTajima のD や非同義置換率と同義置換率の比ω、Fay とWu のH のような進化遺伝学的統計量を用いて評価して、その特有の進化的パターンを探り、それらの知見から、アロ認証にどのような中核原理が可能であるのか予言するというものである。平成25年度中には、CD9とIZUMO1を代表例として、1000人ゲノムプロジェクトからDNAバリエーションデータを取得し、TajimaのDとω（dN/dS）を計測したところ、CD9はD<<0かつω<1と強い純化淘汰の対象にあるが、IZUMO1はむしろω>1と迅速進化の対象となっていることが示された。興味深いことに、更なる調査で、IZUMO1がヒト集団中で高度のCNV多型領域のひとつであることが判明し、その他にもかなりの数の生殖関連遺伝子がCNV領域中にあって、実際のヒト集団でコピー数多型を示すことが分かった。このようなゲノム浮動が、今後、アロ認証関連遺伝子の進化メカニズムに興味深い示唆を与えるものであると期待される。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(11 results)
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[Journal Article] A pollen coat-inducible autoinhibited Ca2+-ATPase expressed in stigmatic papilla cell is required for compatible pollination in the Brassicaceae.2014
Author(s)
Iwano M, Igarashi M, Tarutani Y, Kaothien-Nakayama P, Nakayama H, Moriyama H, Yakabe R, Entani T, Shimosato-Asano H, Ueki M, Tamiya G, Takayama S
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Journal Title
Plant Cell
Volume: 26
Pages: 636-649
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Variants in melanogenesis-related genes associate with skin cancer risk among Japanese populations.2014
Author(s)
Yoshizawa J, Abe Y, Oiso N, Fukai K, Hozumi Y, Nakamura T, Narita T, Motokawa T, Wakamatsu K, Ito S, Kawada A, Tamiya G, Suzuki T
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Journal Title
J Dermatol
Volume: 41
Pages: 296-302
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Comparison of caregiver strain in Parkinson's disease between Yamagata, Japan, and Maryland, The United States.2013
Author(s)
Tanji H, Koyama S, Wada M, Kawanami T, Kurita K, Tamiya G, Saito N, Suzuki K, Kato T, Anderson KE, Gruber-Baldini AL, Fishman PS, Reich SG, Weiner WJ, Shulman LM.
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Journal Title
Parkinsonism Relat Disord
Volume: 19
Pages: 628-633
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A founder haplotype of APOE-Sendai mutation associated with lipoprotein glomerulopathy.2013
Author(s)
Toyota K, Hashimoto T, Ogino D, Matsunaga A, Ito M, Masakane I, Degawa N, Sato H, Shirai S, Umetsu K, Tamiya G, Saito T, Hayasaka K.
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Journal Title
J Hum Genet
Volume: 58
Pages: 254-258
DOI
Peer Reviewed
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