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2013 Fiscal Year Annual Research Report

動物由来RNAウイルスが制御する非コードRNAマシナリーの探索と解析

Publicly Offered Research

Project AreaFunctional machinery for non-coding RNAs
Project/Area Number 24115709
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

本田 知之  京都大学, ウイルス研究所, 助教 (80402676)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Keywords非コードRNA / 核 / ウイルス / スペックル
Research Abstract

ボルナ病ウイルス (BDV) は細胞核で複製するマイナス鎖をゲノムに持つRNAウイルスである。BDVが持続感染した核内には、ウイルスゲノムRNAを含む核内スペックル(vSPOT)が形成される。vSPOTはウイルスの転写・複製の場と考えられてきたが、既存の宿主核内構造物のマーカーとは共局在せず、その詳細な構成分子ならびに宿主細胞へ及ぼす影響については未だ不明である。一方、近年、細胞核にはタンパク質をコードしない長鎖非コードRNA(ncRNA) が存在することがわかってきた。BDVゲノムと長鎖ncRNAは、ともに核内に局在する長鎖ncRNAであり、核内でタンパク質が集積した構造物を形成する。また、クロマチンの構造や細胞の転写と関連している点も共通した特徴である。そこで本研究では、長鎖ncRNAのモデルとして、vSPOTと最近発見した内在性ボルナウイルス様配列(EBLN)の詳細な解析を行う。本年度の研究において、vSPOTマシナリー及びEBLNについて以下の結果を得た。
1)超解像度顕微鏡を用いて、vSPOTを詳細に観察した。その結果、ウイルスタンパク質は均一にvSPOTに局在するのではなく、NはvSPOT外周側、Pは内周側に局在する傾向を認めた。
2)vSPOTには、宿主分子HMGB1が局在する。BDV感染細胞中で、BDVリボタンパク複合体(RNP)およびHMGB1と相互作用する分子HBPを同定した。しかし、vSPOTでは、HBP-1とBDV RNPとの相互作用を認めなかった。以上から、vSPOTは、HBP-1とBDV RNPの相互作用を回避する構造である可能性が考えられた。
3)BDV持続感染細胞において、EBLN RNAをアンチセンスオリゴでノックダウンすると、BDV量が増加した。このことから、EBLNはRNAとして機能してBDV感染を阻害する可能性が示唆された。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Nucleocytoplasmic shuttling of viral proteins in Borna disease virus infection.2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 5 Pages: 1978-1990

    • DOI

      10.3390/v5081978

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 核内におけるウイルスRNA検知機構の解明2014

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第2回感染症国際センターシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20140318-20140318
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation of an endogenous bornavirus element expression in the human genome2014

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      Mobile Genetic Elements and Genome Evolution
    • Place of Presentation
      USA
    • Year and Date
      20140309-20140314
  • [Presentation] RNAウイルスとLINE-1との相互作用解析2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第36回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] 細胞核におけるボルナ病ウイルス持続感染機構の解明2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第31回染色体ワークショップ、第12回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      20131125-20131127
  • [Presentation] クロマチン結合タンパク質RBMXを介したボルナウイルスの複製制御機構の解析2013

    • Author(s)
      平井 悠哉
    • Organizer
      第31回染色体ワークショップ、第12回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      20131125-20131127
  • [Presentation] 内在性ボルナ病ウイルス様エレメントによるボルナ病ウイルスの新しい制御機構2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131110-20131112
  • [Presentation] ボルナウイルス感染細胞における特異的核内構造体vSPOTの構造形成メカニズムの解明2013

    • Author(s)
      平井 悠哉
    • Organizer
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131110-20131112
  • [Presentation] Endogenous viral elements: a novel restriction non-coding RNA of Borna disease virus infection2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      Riboclub 2013
    • Place of Presentation
      Canada
    • Year and Date
      20130923-20130925
  • [Presentation] Epigenetic regulation of an endogenous bornavirus element in the human genome2013

    • Author(s)
      Kozue Sofuku
    • Organizer
      The 12th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Year and Date
      20130910-20130913
  • [Presentation] A cooperative role of the mutations within the polymerase gene and the leader sequence of Borna disease virus in viral transcription activity and viral factory formation2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      The 12th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Year and Date
      20130910-20130913
  • [Presentation] 内在性RNAウイルス由来lncRNAの発現と機能解析2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      RNA Frontier Meeting 2013
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      20130903-20130905
  • [Presentation] 内在性RNAウイルス由来lncRNAの発現と機能解析2013

    • Author(s)
      朝長 啓造
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛
    • Year and Date
      20130724-20130726
  • [Remarks] 朝長研究室:京都大学ウイルス研究所ヒトがんウイルス研究分野

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/tomonaga-hp/

  • [Remarks] ボル研web

    • URL

      https://www.facebook.com/pages/%E3%83%9C%E3%83%AB%E7%A0%94web/386637678098111

URL: 

Published: 2015-05-28  

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